EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-22896 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr2:2256956-2258480 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr2:2256976-2256993TTTAATTAATTAATTCT-6.44
Arid3bMA0601.1chr2:2257855-2257866TTAATTAATAT-6.62
GATA6MA1104.1chr2:2257583-2257596TCTCTTATCTTTA-6.28
HNF1AMA0046.2chr2:2257607-2257622AGTCAATTATTAACT-6.55
HNF1AMA0046.2chr2:2257607-2257622AGTCAATTATTAACT+6.66
HNF1BMA0153.2chr2:2257608-2257621GTCAATTATTAAC+6.2
HNF1BMA0153.2chr2:2257608-2257621GTCAATTATTAAC-6.57
LMX1BMA0703.2chr2:2256974-2256985ATTTTAATTAA+6.62
Lhx3MA0135.1chr2:2256979-2256992AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr2:2256978-2256991TAATTAATTAATT+6.78
NFICMA0161.2chr2:2257920-2257931TGTGCCAAGTA-6.32
POU6F1MA0628.1chr2:2256980-2256990ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:2256980-2256990ATTAATTAAT-6.02
RarbMA0857.1chr2:2257331-2257347GAAGTTCAGAAGGTCA+6.01
RargMA0859.1chr2:2257332-2257348AAGTTCAGAAGGTCAA+6.99
Enhancer Sequence
AAGAAAAAAA CTCTCTTAAT TTTAATTAAT TAATTCTGAT ATTTTTTTAT ATAAAAAAAT 60
GCTTTAAGAT TTTGTAGACG TTTGGACTAT AGAAACAAGA GAAAAACTTT ACGTAAGACA 120
AACTTTTTTG CCATGTTGTT CAAGTTTTAT ATGCCCTGAT GGGGAGAAAT GACAGATTTT 180
ATGTCCTAAA TATTTTAGTG ACCTGCATAG CAAATAAAAC AAATAAAATC AATAGAGGCT 240
GCGTTGTTCT TTCTTTAATA CGCAACTACC AGCTTTTATA AGCCTGACAG TGTGTAATAA 300
ATCTGATATT CACAGATAGG AGTGAATGGG TGTAGACCGA GAGCATTGAC TCAGTACAGT 360
CGCACTACAG ATGAGGAAGT TCAGAAGGTC AAAATCCTCC AGCTGAGTGT TCATCTTCAC 420
ATTTCCACAG ATCTTCATGA CATTGTCTTA TCATTATGAT ACTCCGTGCA ATCTGTTTCA 480
TTCTCATGAA TCCCACACAT TTCCCGAGCA CTGCTCAATG AGGGTTTAGC ATTGAATCCG 540
AAGCACACAT GTGATCAATT GTAAGTACAC ACGATTTCAG TGTCAAGGTG TGATGGAGAC 600
AGTGCTGCTA TTATATAAGC CTCCGGATCT CTTATCTTTA TAGCGGATTG AAGTCAATTA 660
TTAACTTGGT GTTTGAGGAG AAAAAAAGAC ACATGGAGTT TTATTGAGAG ACTTCTGAGA 720
GTCTAATAAT GTGTGTTTCT CTAGTGTTTT TCTTTGGAAG TCACGCTAAA ATGGCAGGGT 780
TACTAATACT ATGACTTACT CATTTATCCA GATACATCAT TATTCAATAA AAACATTTAC 840
TTTTTAACTG TGCTGTGCAA AATATTGAAC AATTATCATT ATTGCAATTA ATTGAAGTGT 900
TAATTAATAT AAGCATTATT GAAATATCTG TATGGCAGAG AGGTGAGGTA AATTATTTAT 960
TGTATGTGCC AAGTATTTGT GTGTTGCATG CATACACTGC AAAAATGCTT TCCTTACTTA 1020
GTTTTTGTCT TGTTTTTAGC CCAAACATCT GAAGATTTTT TGACCAAGAA GCATTTTCTA 1080
GACAAGCAAA CAATATGGAT TTGTTTTCAG ATATAATATG CCAAAATGAA GTGAGTTTTT 1140
CCTTAAAACA AGCTAAAAAG ATCTTGTTTT TCGTTTTAAC ATTTGATTAG TTCGCTTATT 1200
GGCAATTTAT TTAGCTTGAT TTAGGTGAAA ACTTGCATCA TTTGTCATTA TTTCTGAAAG 1260
ATACAGACAG ATATAGAAAC AACTGGTCTA CTGGGATTTT CACGCACAAC CATCTCTAGG 1320
GTTTACAGAG AATGCTCCGG CAAAGAGGAA ATATCCAGTG AGCGGCAGTT CTGTGGGCGC 1380
AAATGCCTTG TTGATGCCGG AGGTCAGAGG AGAATGGCCA GACTGGTTCC AGCTGATAGA 1440
AAGGCAACAG TAACTCAAAT AAGCACTCGT TACAACCGAG CTCTGCAGAA GAGCATCTCT 1500
GAACACACAA CACGTCCAAC CTTG 1524