EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-22816 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr2:527855-528735 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr2:528247-528257ACTAATTAGC+6.02
HOXB3MA0903.1chr2:528247-528257ACTAATTAGC+6.02
LHX6MA0658.1chr2:528247-528257ACTAATTAGC+6.02
RFX1MA0509.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+7.14
Enhancer Sequence
ACGGAGAAAT CAAACACGCT GACAGATCAA CTATTATGCG CACACTTAGT TTTACATTAT 60
ACTCATAATG TAAAAATAAT CTGCATGTCA TCGATCTGTA AATAATTTGT GTAATTACAT 120
TTATAATTAC ATTATTGACC TTAACCCATG CTTAAACCAA CCCATACGAG CATAACCCGG 180
CCCGTATCCC ACCACAAGAA CACCAGAAGT GTTGTGCAAC GCAATATGAA GCTATGATGC 240
AAGTACATAG TAGTTTAGGC CACTTTATTC AAAGTAGGAC CGGGAAACGG GAACAGAGAA 300
CTGTCCAAAT ATGCAGAGAT TTTATTTCCT GTCATGTAAA TATACCCTAA CTATTGATAA 360
ACCATTAACT AAGGCATTTA GCTCAATCAA CTACTAATTA GCTGCTTAAT ATTTGTCAAT 420
AAGGTCAGAA TTGGGTTTAG TTATTGGGCA GGATTAGGCA TGCAGAGTAA GATCATGCCT 480
TATAAGTGCT AATAAACTGT GAATATCTTA ACAATAGGCA GGTATTAAGG CAGCAGTAAC 540
GGTGTGAGTT GCTTAAACTA AAGTTTTACC ATGGTTTATT TAGCTCTGGT GTGAGTGTTA 600
GAGATGATCT GTGTGAACAG AGTCTCTCTC AGACAGACAC CCGCTCTGAT CGATTCGTTC 660
CAGCAGCCGA ATGAACAGAG GGGGATTACA TTTCATTAGT GCTGATCCTC ATTCGACATC 720
AGAGGACACT CTCTGTCTGA ACACCACTCT CAAAATACTG TGGTACTATA CAGTGAATTC 780
TGTAGAGTTT AACCATACTG TAGTAAAGAA ATTGAATTAA TCAAGTGTGG TGACTCTACA 840
GTTGCTATGG TAACAACTAT AGTGATTGAT CTGTTTTGGT 880