EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-22630 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr19:44175804-44176772 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr19:44176336-44176355CGGCCAGCAGGTGGCGCAT+6.88
HNF1AMA0046.2chr19:44176298-44176313CGTAAATAATTAATT-6.01
HNF1BMA0153.2chr19:44176299-44176312GTAAATAATTAAT+6.42
Lhx3MA0135.1chr19:44176304-44176317TAATTAATTATAC+6.12
Lhx3MA0135.1chr19:44176301-44176314AAATAATTAATTA-6.71
POU4F1MA0790.1chr19:44176299-44176313GTAAATAATTAATT+6.11
POU4F2MA0683.1chr19:44176299-44176315GTAAATAATTAATTAT+6.06
POU4F3MA0791.1chr19:44176299-44176315GTAAATAATTAATTAT+6.15
Sox1MA0870.1chr19:44176142-44176157TGCAATGCTATTGTT-6.59
Enhancer Sequence
AATGAAAATA CAAAGCTCTT GAGTCATTTT GAAGTGACTA TAATGTGTCA TTCAGTTCAA 60
AACTCAGGTC ACCAACCATG AAAACCATTG TTTGTTACAG ATTTATTTAC AGAAAACCCA 120
GGGAACATTA CTGAAATTCA TTAAATAAAT ACATAATTTC AGCATTTGAT GATTATTACA 180
TTCCATGAAG TTTTATAATG TTTACACCAT TCAAAGAGTC TTGATTTAAG GTACAATAGC 240
CAGCACTTAT TTTTGTAGCT ATAAGAATAT ATATCAATCA TTAGAACAGT TTGTGATCAA 300
TGATAGATTT GTATATGATG TTGATCATGC TAAATAAATG CAATGCTATT GTTTACAGTT 360
CAGTTACATG TCCCTTTTGC TTTTTTATCG CATATTTGGA CTTTTATATG AAGTTAAACA 420
TTTAAATTTC CATTATTTAA ATATATCCTG TCATAATTTG AATGGATACC ACGAGTGCAC 480
TACTATTTAC ACACCGTAAA TAATTAATTA TACGGTTATT ACATTACACA GGCGGCCAGC 540
AGGTGGCGCA TTACATCCTT TATAAATGCC AGAATTACAA TAAAAACTCT CGTTTTTTAC 600
AACTAATGGT GCTTATAGTT TTAATGTTGT AAATCTTAAA TGTATACAGG CCAATAACTA 660
TAAGAGATAT AAGAATACAG GCGCTGCTTT TGTCTGATAG TCTCTGACAG GCGCTTTTGA 720
TTTACCTCAG CATTCTTTGA GAGCAGAAAA TGACCCGGAT GCAGTTTGCT GAATGCGGCA 780
AGATGACGTC CGCGCTTATT TACATGTGTG ACACTGAGGG AAGCTTCAAG AATGGCTTTT 840
AACCCTTACT GTGTTTTTAA ACCTTCGATT TAGTGCGTAA ATTTAACTTG TATATCGATT 900
CTAGAATCAA GACGGCTATT TTAATTTAGT ATTGTTGGTT TAATTGTTAC TATCAAACCA 960
TTTTCAGT 968