EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-22524 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr19:42413428-42414874 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr19:42414751-42414767CACTAAATAAACAAAT+6.21
FOXC2MA0846.1chr19:42414754-42414766TAAATAAACAAA+6.18
FOXE1MA1487.1chr19:42414751-42414766CACTAAATAAACAAA+7.29
Lhx3MA0135.1chr19:42414795-42414808AAATTAATTATTA+6.25
RFX1MA0509.2chr19:42413611-42413627TGTTGCCATGGAGACA+6.03
RFX1MA0509.2chr19:42413611-42413627TGTTGCCATGGAGACA-6.04
RFX2MA0600.2chr19:42413611-42413627TGTTGCCATGGAGACA-6.1
RFX2MA0600.2chr19:42413611-42413627TGTTGCCATGGAGACA+6.27
RFX3MA0798.1chr19:42413611-42413627TGTTGCCATGGAGACA-6.29
RFX3MA0798.1chr19:42413611-42413627TGTTGCCATGGAGACA+6.47
RFX4MA0799.1chr19:42413611-42413627TGTTGCCATGGAGACA-6.16
Enhancer Sequence
GCTCTTGTAA AACCGCAACT GTAAACACCT ATCATCACCT CATAAAACCA CTTCAGCTGT 60
ATTCTGTCCT TCGGTTTAAT CCATGGTGAA ACAAAAATCA CAGACTCCCC CACACGCTCA 120
CATGCTGTAT TACCGTCTAT CCTGACCACA CACACACGCG CGTACTCTGA CTCCAATCGC 180
TGCTGTTGCC ATGGAGACAG GCCTGTACTC TACATTCCTG GGATATTTCA GGAAAAGGAA 240
GTGTGAGAAT TCTTCAGATT GTCTATGATG AATCGCTTGC TTTGGGAAGC GGAGGTGAGC 300
ACAGGCACTC ATCCATTCAC TCGCCCTATA ACAAAAAAAG CCTCAAGCAA CAGTAAACGT 360
TATAAAATCT CCGGTAAGCA TATTTTCAGG CTTAAAAGGG CTACGCCATG ATTAAAAGAA 420
TAGGGGATCT CATGTGTACA GCTAAAGCAG CATATTTATG CCATTTTTAC TTCATATAAT 480
GCTATCTCAA GTCTTTCCTG TGAAATTATT CATAGGATAA CATTTATTAA AAGAGTCAAA 540
TGCATCTTTT CACATTCAGC AACAGAACAA ACTATGAAAA AGGCATTTCA CTTCTGACGG 600
ATAAAATTAG AGCCTTACGA TGGGGGGGAA GGTTCAACCC CAAGTTGAAG GGGTAATGAG 660
TATTTGTGGC GCAACCTTCA CTCGCGGAGA TAAAACGGCA AAGATGTGCA CAATAATATC 720
TGTGCGTTTC AGAGGGCAGA CCTCTTTACA TTTCATCTCC ATCTGTTTTT CCATGTGCGT 780
TCACACTGCC ACAGAGCATT TGATGTTGCT CTCTCATCTG GCTGCTCCAT GCCAGCTTTT 840
CTGAGGTCAG GCCTCCTAAT AACAGGGTAG AGAAAACCAG AAGCTCTCTC TCACACACAC 900
ACTCACACAA GACCTTCTGA AAGAGAGAGC AAAAAACACA CTAGAAACAT ACAGGCATAA 960
CTCAAAACAA ATGTCTCTAA TAATTACATT CAGCATGTGA GCGGACGGGA AATGATGCTA 1020
GACATCCCAT TGTCAACATT TCATAAAAGT CGGCACATCT CCACCAACTG AATGGATGCT 1080
TTCTGACAGG CATTTGGGAG TTATGTAATA GAGATAATTT GACTATTTAG GATCCTTAAG 1140
ATGGATTTGA TTACTGATGA ATTAACAAAT GACATGCCTG GAGAACAAAA TGAATATTTT 1200
TTATGTTAAC CAAATTACAA AAAATTATTT TTTTGTATTT GTTAAATAAA AATTATTAAT 1260
TAGTTATTAA TTACAATAAA AAATATTATA ATATTAATAT ATATATAAAT ATAATATTAC 1320
TATCACTAAA TAAACAAATA AATATAATAC TCATATTAAT ATCAAATAAA TTAATTATTA 1380
TTAAATAAAT ATATTATTAT CACTAAATAA ATTTAATATT AATATCAATA AATAGATATA 1440
CTACTA 1446