EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-19167 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr18:17372630-17374482 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr18:17373414-17373426AAACAAACAATC-6.92
GRHL2MA1105.1chr18:17373651-17373666TACAACTGGTTTGTC-6.64
GRHL2MA1105.1chr18:17372929-17372944TTCAAACCAGTTTTG+6.67
Lhx3MA0135.1chr18:17373150-17373163AAATTAATTAAAT+6.07
PRDM1MA0508.2chr18:17373529-17373539GTGAAAGTGA-6.02
RFX1MA0509.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-7.01
RFX1MA0509.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+7.04
RFX2MA0600.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+7.09
RFX2MA0600.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-7.22
RFX3MA0798.1chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+7.33
RFX3MA0798.1chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-7.3
RFX4MA0799.1chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-6.96
RFX4MA0799.1chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+7.19
RFX5MA0510.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+6.93
RFX5MA0510.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-7.12
RargMA0859.1chr18:17373761-17373777CAGGTCAACAGTTCAT+6.04
ZNF263MA0528.1chr18:17373069-17373090TCTTTCCCCTCTCTCTGCTCC-6.48
ZNF384MA1125.1chr18:17373176-17373188ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr18:17373175-17373187AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
AAACCGGAGC ACCCGGAGGA AACCCACGCG AATGCAGGGA GAACATGCAA ACTCCACACA 60
GAAACGGCAA CTGAGCCGAG GCTCGAATCA GCGACCCAGC GACTTTCTTG CTGTGAGGCG 120
ACAGCACTAC CTACTGCACC ACTGCTTCGC CATTTAGATA TCATTAAAAT TAAAATTCCG 180
TTGATATCGG AGGTGATCTA TTGTGCATGC CAACTTTACA TCAGACCCAA ATGTTAGTCG 240
TTATTCAAAA AGAATGTGTC TGAACTGAAT CATTGAGTCA GTGATTCATA AACTAATCAT 300
TCAAACCAGT TTTGAGAACT GAATTATCAA AAATTTCTGA CTAGTCAGTG CCAGTGGCGT 360
AGTGGAAAGT GTACTAACAC ATGCACTCCG GTGTTCACGG CGGCCAGAGT TCGATTCTTG 420
CCTCAAGGTC CTATGCCAAT CTTTCCCCTC TCTCTGCTCC ACACACTTTC CTGTCAATTC 480
TCTCTACTGT CCTGTCCAAT AAAAGTGAAA ACCCCTAAAA AAATTAATTA AATAAAAAAT 540
AAACTAATAA AAAAAAAATT CTGACTGAAA CAGTTAATTC ATGTAACAAT TTACTTCTAT 600
TATTTTAAAA AGAGCAGCAA GTAATCCATT TTATAATGCT ACTGTACGTA AACAATGCCT 660
GACTAAATAA TACAACTTTA ACTGTTAACC GCTCACTAAA AGGAATAGCC TACAGTTAAT 720
GAACAAATCA TTTCGAAGTG GTTTTGTGAT CTATATCAAA AGCTCCATCA AAACAATCCA 780
ACTCAAACAA ACAATCAATT CACTAACAAC TTTTAATTTA CTGTCATTTC ATCAAAAGCA 840
CTGCTCATAT TGTGGAAAGG GATTGTCTAA CTCAGCGCAG GAAAGAAAAT CATACAGTTG 900
TGAAAGTGAG TAAATAACTG AATCTTCATG CTTTTCCTTT AACATTATGT GTGCGGATGC 960
ACGTACACAA ACACCTACCA TTAATTAGCA TCGTTATCTC CACAGCCTCA CTAAATCTAA 1020
TTACAACTGG TTTGTCATTA ACCGCAAATG ATGGTAGGGA AACATTAATG AGAGTGACTC 1080
GCTTCAGAAG AACATCGGTA AACCAACTAA ATGAAACAAC TCACTTTAGT TCAGGTCAAC 1140
AGTTCATTGC TTTCACGGAC AGTTTAGCGG TGGAAGAGAA CGTCTTGTCA CCTGCACACA 1200
GGACTCTGTT GTCAGGATGT CCGATATTGG TTTCACGACA ATAATAATAA TAAAGCAAAT 1260
ATTTGATGAA GACTTGCTAG AACTGATAAA CGTTGCACCA TTAGTGTAAA ACATTAATGG 1320
TATCCATGCT AGCTCATGTC ATAAATCAAA GCTAGGCTCG TCTAAGAGTG GCAAGCTAGC 1380
ACGCTAGGCT GTTTATCAGC AGTATTAAGT GCAATTTGTG AATTAGCTGG GCTAACGGAC 1440
ATTACAGAGC GCTGAGGCCT GTCTCACCCA ATGTGTGCCA GGACGAGGTG TGTCTGTGTG 1500
TGTATGTGGA TGACTGTAGA TAATTTTAAT ATCAGGCTGG TGTGGATTGC TGATAGTGTT 1560
TTAAGGCAGG GCCCTGTGGA CTGAGCACTG GTAGTACCTA TCTGTAATTA GTAACCATTC 1620
TCTATCGCTG ATAAGATAAA CTCACCCTGA CCTTTTCCAT TTGGTCGCCA TGGTAACGGG 1680
CCCTCTACCC CCCCTCTTGA TATTATTTTA GTGATTAAAC AGCAAATAGC AGGGAGATGG 1740
GAGAAAGCGA TAGGGATGAT TAATAATGGT GTTTGGTTGA AGTGAATGTA TGCGAGCGTT 1800
TGTATGAGGA GGGCCACCGG TGTCAGAGAG GAGTGTGAAT AGGCTTGGCT TG 1852