EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-19110 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr18:16088994-16089732 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr18:16089219-16089236GGGTCAGACCGAGGTCA+6.31
Rarb(var.2)MA0858.1chr18:16089219-16089236GGGTCAGACCGAGGTCA+6
Rarg(var.2)MA0860.1chr18:16089229-16089246GAGGTCAAAAACGGTCA+6.53
Enhancer Sequence
AATGTCACTT TAAGCTATAT AGAAGTGTCT TGAAAAATAT CTAGTAAAAC ATTATGTACT 60
GTCATCATGG CAAAGATGAA ATAAATCAGT TATTAGAGGC GAGCTATTTA TGCACATATA 120
CATTTTTTAT TTGGAGTAAT AATTTAGTTT TAATGCTTTA ATTTTAAAAC ATTAGCTATG 180
GTAACCTTGC TTTAAAGTTA CAGTACCACA AATGCTTATT CATGAGGGTC AGACCGAGGT 240
CAAAAACGGT CAAGCAGAAC TTACTTTGTC AATATTTATG CAAAAAAAAG TTAGAATATA 300
GTGCATTTAT GGAGCGCTCT TTCCAGCATC TGCTCTGCAT TGGTTTGTAA GTGGCCGGTG 360
GTGCGACTCT AAGCGGATGT CATGCCCTGT CACATCCTGT TACTCTCACT GCCTTCCAGT 420
TTGTAGATGA GCTCTGTGAA GGGCCTTTTC TATTTGATGG ATTCAGCTAT GATCATGGTG 480
ACATTTACTT CACTAAAGAG GACGTAAAGT CTGTGTTGCA GAAGAACAGA TGTGAGGGAA 540
TGTTTTATAG TGACTGTAAA CAGTGGAATA CCGTCAATAA ATGATTTTGA TAGACAGAAT 600
GAGCCCTTTC TTTGAAGATC CATTCTTTTA TTGTTGTTTT TTTTTCTTTT TGGTCTGATT 660
ATTTTCAGGA CTTGAGAGAG ACAAGTTTGA TAACAAGACC GTGTCCTTTG AGGAGCACAT 720
CAAGTCGGAG CACAACAT 738