EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-18857 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr18:8576914-8578336 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr18:8577666-8577681GAGGTCAAAGGTCAC+6.04
HNF4GMA0484.1chr18:8577665-8577680AGAGGTCAAAGGTCA+7.22
Lhx3MA0135.1chr18:8577239-8577252GGTTAATTAATTT-7.22
NR2C2MA0504.1chr18:8577665-8577680AGAGGTCAAAGGTCA+8.25
NR2F1MA0017.2chr18:8577671-8577684CAAAGGTCACCGG+6.37
Nr2f6MA0677.1chr18:8577666-8577680GAGGTCAAAGGTCA+8.42
RUNX1MA0002.2chr18:8578048-8578059AAACCACAAAC-6.02
RXRBMA0855.1chr18:8577666-8577680GAGGTCAAAGGTCA+7.95
RXRGMA0856.1chr18:8577666-8577680GAGGTCAAAGGTCA+8.12
RxraMA0512.2chr18:8577666-8577680GAGGTCAAAGGTCA+8.12
ZSCAN4MA1155.1chr18:8576970-8576985ATTTAAGTGTGTGTA-6.33
Enhancer Sequence
GGACAAAAAC ATAATCGTGA ACAATCGCTT CTAAAACAAA AGTTTGTTTT GACATAATTT 60
AAGTGTGTGT ACTGTGTATA TTTGTGTAAA TACACAGGTA TGCATATACA GTTGAAGTCA 120
GAATTATTAG CCCCCCTGTT TATGTTTTTC CCCAATTTCT GTTTAACGGA GATTTTTTTC 180
AACACATTTC TAAACCTAAT AGTTTAATAA CTCATCTCTA ATAATAATTG ATTTATCTTT 240
TCCATGATGA CAGTAAATAA TATTTGACTA GATATTTTTC AAGACACTTC TATACAGCTT 300
AAAGTGACAT TTAAAGGCTT AACTAGGTTA ATTAATTTTA CTAGGCAGGT TAGGGTAATT 360
AGGCAAGTCA TTGTATAATG ATGGTTTGTT CTGTAGAATA TCTAGCTAAT AATTCTGACT 420
TCAACTGTAT TTGAGAAAAT GTTTATTTAT GTCTAGATAT AAATTATAAA TGTTATAAAG 480
GAGTTAACGA TATAAAGGAG TTAACATTTC AGGGAATTTC TGGTGTAAAT GTCACAGCTG 540
TGTCATCAGT ATGACTCACA TTCAGTGCAG TTACTTTTAA TATAATGCAC AACGCCCACC 600
CTGCAGTCTG TCTGTACACA AAATAATACA ATGACCCCCC TGCACACCCT ACTCTCTCAC 660
AAAGAGTACA GGAAGACTGT GTGTGTGTGT GGCATGCTTT TTTCTTAGAC TGAGCTATAA 720
TGAGCGCTTA TGAGAAAAGA CAGGGCATTG TAGAGGTCAA AGGTCACCGG CAGCAGACAG 780
GAGGAAGACA ATCATCGGTG ACTCAAGGGC TGCAATCCCA TGATTCATAG CTGTAACATT 840
AAATCTGGGT AGAAATGCCT TTAGAATGGC ATTCATATGG TTTAATAAGG CATATCTTAG 900
AGTAACTAGA GGTAATGAGC TGATCTGAAG TAATGCGAAA GAGCTACGCA CATGCCAGAT 960
TTTTGGGGAG TGGTCCCGGA TTCGTCAGAG ACACTAATGT TTCCAGCATG TTGTGTGTTG 1020
TCAGGGCGAC AGTAATCCTG CGGGTGTCTG CTGCTGGGTT TCCTGTTGCG GGTTTTGGAG 1080
TCAGAGAGGC TTGCTGGAGG GAGCTTAGGT AGAGGACAAT AGCTCTCGAT GATGAAACCA 1140
CAAACGTACT GGCTACACCT TCACACACAC ACTTTGGCAC AGATGCATTG TGGTCTCTCA 1200
TTAGGAGACG GTTTCAATTA GCTTGAAACT CATTAAATAA ACCCAACCGC TAACTCACCG 1260
AGTCTGCAGC TTTTAGTGTG TGGCATATTT TACTGTATAT CGTCCTGCAG TCTCACACAC 1320
ACGCTTCCCA CAGATGGAGT ACAGCCACTA ATCATTCGCG TATGTGAGCT TATCATCAAA 1380
ACACACAAAC GTGTAAGCAT GTGTGATGGA GACCAACTGT GT 1422