EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-18745 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr18:2837403-2838931 
TF binding sites/motifs
Number: 55             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr18:2838316-2838333ACAATTAATTAATAAAC+6.11
ArxMA0874.1chr18:2838316-2838333ACAATTAATTAATAAAC-6.12
FOXE1MA1487.1chr18:2838635-2838650CAATAAACAAACAAC+6.05
FOXE1MA1487.1chr18:2838110-2838125CAATAAACAAACAAT+6.18
Foxd3MA0041.1chr18:2838002-2838014AAACAAACAATT-6.22
Foxd3MA0041.1chr18:2838200-2838212AAACAAACAATT-6.22
Foxd3MA0041.1chr18:2838310-2838322AAACAAACAATT-6.22
Foxd3MA0041.1chr18:2837780-2837792AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837784-2837796AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837800-2837812AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837804-2837816AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837923-2837935AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837927-2837939AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837931-2837943AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837935-2837947AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837998-2838010AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838022-2838034AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838074-2838086AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838078-2838090AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838082-2838094AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838188-2838200AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838192-2838204AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838196-2838208AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838232-2838244AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838236-2838248AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838240-2838252AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838274-2838286AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838306-2838318AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838373-2838385AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838377-2838389AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838381-2838393AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838405-2838417AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838457-2838469AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838512-2838524AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838516-2838528AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838548-2838560AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838583-2838595AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2838619-2838631AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:2837845-2837857AAACAAACATAC-6.37
Foxd3MA0041.1chr18:2837867-2837879AAAAAAACAATC-6.44
Foxd3MA0041.1chr18:2837887-2837899AAATAAACAATC-6.62
Foxd3MA0041.1chr18:2838114-2838126AAACAAACAATC-6.92
Foxd3MA0041.1chr18:2838329-2838341AAACAAACAATC-6.92
Foxd3MA0041.1chr18:2838409-2838421AAACAAACAATC-6.92
Foxj3MA0851.1chr18:2838346-2838363AACAAATAAACAAACCA+6.12
Hmx1MA0896.1chr18:2838312-2838329ACAAACAATTAATTAAT+6.15
Hmx2MA0897.1chr18:2838202-2838219ACAAACAATTAAACCAA+6.04
Hmx2MA0897.1chr18:2838312-2838329ACAAACAATTAATTAAT+7.43
Hmx3MA0898.1chr18:2838202-2838219ACAAACAATTAAACCAA+6.05
Hmx3MA0898.1chr18:2838312-2838329ACAAACAATTAATTAAT+7.69
POU4F1MA0790.1chr18:2837458-2837472CATGAAATATGCAT-6.03
POU4F2MA0683.1chr18:2837456-2837472TTCATGAAATATGCAT-6.14
POU4F3MA0791.1chr18:2837456-2837472TTCATGAAATATGCAT-6.35
POU6F1MA0628.1chr18:2838319-2838329ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:2838319-2838329ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CTACTTGCAA ATACACAAAT AGGCTTGAAG TTTTAAAGCA CAATAGGTAA GTTTTCATGA 60
AATATGCATT TAAGAAACCA GTTACATCAA CGTCCTTGTT TATAAGAAAA AACAACGCAA 120
TGCCTAGTTT AACCACTAGG TTAACGGTTG TCAATCCTAA ATAGTGCACA CTTAAAATGT 180
CCAAAAACTA CTAGAACTGT TTTATGCAAT CTGCTGACTG ATTGTCCCAG TACATAACTA 240
ACGAACTAAC CAACGAACCA ACTAACTAAC TAACTAAACA ATCAAACAAA CTGTTAAACA 300
AACCAAAAAA AAAAACAACA ACAACAAACT AACTAACAAA CAAACCAGCC AACAAACCAA 360
CCAACATACC AACTAACAAA CAAACAAACA AACCAACAAA CAAACAAACA AACAAAACCA 420
ACTAACAAGC AATCCAACAA ATAAACAAAC ATACAACTAA CCAAAAAAAA ACAATCCAAG 480
CAAGAAATAA ACAATCTAAC CAACAAATAG ACAAACTGAC AAACAAACAA ACAAACAAAC 540
AAACCAACCA AAAACAACCC AACCAATAAA CAAACCAATA AACAAACCAA CCAACAAACA 600
AACAAACAAT TTAACCAATA AACAAACAAA CAAGCAACCC AACAAATAGA CCAACCAACC 660
AACAAACGAA CAAACAAACA AACAAACAAA CCAAAAACCA ATTTAACCAA TAAACAAACA 720
ATCCAATCAA CAAATAGAAA AACAAACCAA ATAATAAACA AATGAAAACA AACAAAAACA 780
ACAACAAACA AACAAACAAA CAAACAATTA AACCAATATG CAAACAAGCA AACAAACAAA 840
CAAACAAACA AAAACAAATA ATTCAACCAA TAAACAAACA AACCAACCAA ACAATAAACA 900
AAAAAACAAA CAAACAATTA ATTAATAAAC AAACAATCAA ACCAACAAAT AAACAAACCA 960
ACCAACCAAC AAACAAACAA ACAAACAAAC TATTTAACCA ATAAACAAAC AAACAATCCA 1020
ATCAACAAAT AGACAAAAAA CCAACCAATA AACAAAACAA ACAAACAACT AACAAACCAA 1080
CAAACAATTC AACCAATATG CAAACCAACA AACAAACAAA CAAACAAAGA ATTCAACCAA 1140
TATACAAACA AACAAACCAA CCAACAAACA AAAAAACAAA AAACAAACAA ACCAACAAAC 1200
AATTCAACCA ATTTACAAAC AAACAAACCA GCCAATAAAC AAACAACTAA CTAACAAACC 1260
AACAAACCAA CCCTTAACTT AGCTTAGCTT TTACTTAACT TTACCATCCA CACGTCTGAT 1320
TTAACAATCT TTCTGATGGC ATTTCTTGCC TATATTAAGC TTCTTCTGCT GGAGAAAGAG 1380
CCGAGGCTGA AAAAGGAAAA AACAAACCTG AAAGGCTATT TGAGGACTGT CAAACATCAC 1440
TGCGAATTCA GTTCCGGACC ACCTTCAACT CCGACAGAAA CCCAAACACA GATCATTACA 1500
CTGCTATAAT GCTAACAGAT CCTGAAGG 1528