EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-18639 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr18:12447-14169 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr18:12798-12812CGCTGACGTCATCA+6.56
BATF3MA0835.1chr18:12798-12812CGCTGACGTCATCA-7.03
NR2C2MA0504.1chr18:12766-12781GCAGGTCAGAGGTCA+7.23
Nr2f6MA0677.1chr18:12767-12781CAGGTCAGAGGTCA+6.67
PBX2MA1113.1chr18:12836-12848CTGATTGACAGG+6.62
PBX3MA1114.1chr18:12834-12851CTCTGATTGACAGGCGG+6.55
POU1F1MA0784.1chr18:13202-13216GATATGCTAATGAG+6.54
POU3F2MA0787.1chr18:13203-13215ATATGCTAATGA+6.27
RXRBMA0855.1chr18:12767-12781CAGGTCAGAGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr18:12767-12781CAGGTCAGAGGTCA+6.38
RxraMA0512.2chr18:12767-12781CAGGTCAGAGGTCA+6.27
SP1MA0079.4chr18:13225-13240GGTGGGCGGGGCTTG-6.87
SP2MA0516.2chr18:13224-13241TGGTGGGCGGGGCTTGA-7.06
SP4MA0685.1chr18:13223-13240CTGGTGGGCGGGGCTTG-6.28
ZSCAN4MA1155.1chr18:12522-12537CACACACACTGCAAA+6.34
Enhancer Sequence
TTACTGTGCT CCAGCAGATC AGCAGAAACA CTCAGAGCAG CAGCAGCAGG TACTGAACAC 60
ACACACACAC ACACACACAC ACACTGCAAA CCTGTCTATC TGAACAATTC AGAGTGTGTG 120
TGAGCATGTT TGTGTCTGTT TTTGAGTAAG ATTCTGTCAG TGTGAGTGTG TGTGTGTGAC 180
TGAGCTTATG TCTGTGTNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNGGC 300
AGCACACACA CGCCTTCCTG CAGGTCAGAG GTCAGCTGTT CTTTACTAGA GCGCTGACGT 360
CATCACACAC TGACCCCGCC CCTCTCTCTC TGATTGACAG GCGGTCATGC CCATCATCAA 420
CAGGTGAGAG ACGCCGCAGC TGATCCGGGA ACAGGTTTGA GCTTTAGGGT TATGAACAGG 480
GGAGGAGGGA GACGCACCGC TGCTCTATAG TGTAGAACAC ACACACACAC ACACACACAC 540
ACTGCTCCTG ACTGAGCTGT ACACCACTCC GCTGTCTCCA GAGTGTGTGT GTGTGTGTGT 600
GTTTGAGCAC ACAGATAATG TCCTCTAGCA CTGTTGATGT GTTCATCTAG AACTGCACAT 660
CTATAATCCT CTTAGTCTAT GCTGACATCA TCTTCAGCAG CTCAAACACT CTAATGGCTA 720
ATGGACAGAC GGCTGCTTCT CACTCAGGCC TGCTGGATAT GCTAATGAGA GGGGCACTGG 780
TGGGCGGGGC TTGACATGTA CAAAGGGAGA ATGTCAATCA AAGTGTTTCA GTCATCAGGT 840
GTGATTAGAC TCGGCTCTGT AACGGGCCTG ACGGGTCGGT GCGCTTCACT CGTTCACTAA 900
CTCGGCCTTC ATGAGAGTCT GGAATCTTCT GTCCAATCAG AATGAAACAG CTCTACAGCG 960
AGGAGGAGGA GGAGCTTCAG CTGGGCGTGT CTCTGGAGTT TCAGGTGCCG AGCACAGATC 1020
TGTCCGACGT CCGACAGATG ATGGACTCCA TAAACGCTCT GCCAGGTCAG ACGCTTAACC 1080
GGGTTAACAT CAGCACACCT GTAGGCCAAG ACATGCTTCA GGAAATGTTG CTCAAGAGTG 1140
TGTCAGCACT GACTTCCATA GCAGGAAACA TTAATGACAT GATTAAATAC TGCAGGTGAA 1200
CGAGCGCTTT AGGTAAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACCT 1260
GAGAGAGTAA CGTACACTGC AGATAAAGAC TAACCCTTGC CCAGCACTGT ACAAGAACAA 1320
CATCAGAGCG CTCACACCTT ATCACTTACT GGTGTTATAC TGACAGTGTT CTGTGTGTGT 1380
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTAGCT CCCTCAGCTC 1440
CGGTCATGAA CCCGCAGATC TCCAACTCTG CCACACACAC ATCTCTGCAT GTGTGCTGGA 1500
GTTTGTTCTC TGATGACACT GTGGAGTTTT ACCTGCTGCA CTGGAGGCTG ATCTCAGACG 1560
ACTGCACCCT ACTGACCCCG CAGGAGGGTA ACACACACAC ACACACACAC ACACACACTA 1620
ATACATACAG TCGCTGGCCA CTTTATTAGG TACACCTCAC TAGTACCGGG TCGGACCCCT 1680
TTTGCCTTCA GAACNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NN 1722