EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-18206 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr17:43540996-43543326 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK1MA0852.2chr17:43542950-43542964GTCTTGTTTACATT-7.22
FOXK2MA1103.1chr17:43542952-43542963CTTGTTTACAT-6.62
Foxj3MA0851.1chr17:43541541-43541558GTCTTTGTTTACTATAC-6.41
Foxo1MA0480.1chr17:43542951-43542962TCTTGTTTACA+6.02
Lhx3MA0135.1chr17:43541827-43541840TAATTAATTATTT+6.71
POU4F1MA0790.1chr17:43541828-43541842AATTAATTATTTAT-6.63
POU4F2MA0683.1chr17:43541826-43541842ATAATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr17:43541826-43541842ATAATTAATTATTTAT-6.54
RARA(var.2)MA0730.1chr17:43541500-43541517AGGTCATAAAAAAGTCA+6.25
RFX1MA0509.2chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT+6.72
RFX1MA0509.2chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT-6.72
RFX2MA0600.2chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT+6.89
RFX2MA0600.2chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT-6.89
RFX3MA0798.1chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT+6.57
RFX3MA0798.1chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT-6.57
RFX4MA0799.1chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT+6.93
RFX4MA0799.1chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT-6.93
RFX5MA0510.2chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT+7.09
RFX5MA0510.2chr17:43542666-43542682AGTTACCATGGTAACT-7.09
Rarb(var.2)MA0858.1chr17:43541500-43541517AGGTCATAAAAAAGTCA+6.5
ZNF24MA1124.1chr17:43543029-43543042AATTCATTCATTC+7.22
ZNF24MA1124.1chr17:43543041-43543054CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr17:43543013-43543026CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr17:43543033-43543046CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr17:43543037-43543050CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
CCAAAGCTTT TCAACAAATT TCTACAGAAA GCAGTTACTA CGGTATGAGA TCTCTTGTCC 60
ATTTTATCTC AACACTCAAC TTCTACGTGG ACTATAATAA CATCAGATGA ACTATGCTCA 120
CATTTCTTAG TCCGTGTGTT TGTTTTATCG TCTGCTAGTG TGTAATGTAA ATGGCAAAGC 180
ATGGATGTTA ACCATCACCA GAAAGGCAAA CAGAGTCTTT ATTGTGAATG TAATCACATT 240
AGCCATGAGG CCGATCACCC TCAGCGCCAC AAGCGCACAC TGGAAAAATA AAATTATTCA 300
GAGGGCACAG TCATATGACT TGATTTCTCT CCAGAAACAC TAGGAACAAA CGAAGGGTCA 360
AGAAACCGTT TCTGTTTGTT CTCTTCTGGG CTTTTTTCTC CTAATGAGAA ACTAATGAGG 420
TTTACAGTGC TTTTTAACAC TGTCTTTGAA TACACAGTAT TGTATAAGTT TGATGAATCA 480
CATGTTTTTT GTTAAATTAA TAAGAGGTCA TAAAAAAGTC ACTGCAGGTC AATAACCACA 540
GTACAGTCTT TGTTTACTAT ACTGCAGAGC TGCTTCTGTT AGTGATTTTG AATACTTGCA 600
AGATTTGTTG GATTCAGACC TGTCAGTAAT CAGTTGTCAG GAAGAATGCT GTTGGAAAAG 660
CCCTAAAATA TAAACTGATG GCATCTCTGT GTTGAAAACT GCTGGCACAC ATCTGACACT 720
AAATAATAAA CCAAAAGTCT GTAATGTTTG TAATTTGAGT TTGGCTACAA TTTCCTTCAC 780
CAATGGACTA AGTAAACTGC AGGAACAAAA AAAGTTAAAG TGTTATAACT ATAATTAATT 840
ATTTATAATA CAAGTCAACA CAAAAACCCA ACCCCTTTAC ATGAGTAAAT TTATGCTTTG 900
CAATTGAAAC ATTATGTTAA AACATTGCCA AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG 960
ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AATTACACTA AAACACATTA ACATGCTGCC 1020
ATTCAACCAG ATATAAACAG AATATTTTTA CAAAAGTATC TAACTGGTTC ATTAAAAAAA 1080
TGAAAACTCT CCCTCGAAGA ACAGAAGCCA AACGTCGAAA CGACTAGGGC AATTACGTTT 1140
TAAAATGTCA GCTAAATGGT AAAAAGCATG AAAAGAGGGT CTTAAAAGTC AAATTTTGAT 1200
TTACTGTCAT TCGGAAACTT ACCCAAAAGG CAAGCGGTGG CGAGAACAGA CACAATTCCC 1260
AAACGCTCCA TGATCCAGAT TTACTTCAAG CGTCCCACAT CTGTTTATCC GTCTGAATTC 1320
ATCCCGCTAG ACGACAGTGT TTGGTAAAAC CTTGTTTGCT GGAAACTGTT GAAGATTCCT 1380
TCTCTCATTC CCTCTTTCCG AAGGCTCATC AATGTCATAT GACGCTAATC ATGTGATCAA 1440
GTCACATTCC TAAACAGACA GGAACTATTT ATTAGCACCT TACTAATTTA TCACTATTGT 1500
GCAACCTTTT CAATAAACAT GAAGGAAACT GAGCAACACC CTGAAGTTAA TCGTTATATT 1560
TCGAATGGTG ACACATTAAC CAGCTGAGAA CGAGTAAAGG TCCAAACCAC ACACTTTCTC 1620
AACTGGAGAT TCATTTGAAG TCCCGCCCAA AGCGGTAAAC AGGACTTTAA AGTTACCATG 1680
GTAACTGTAT TTTACTTTAT TTCCTCAAAT TTGGAGAAGT ACGAAAGTTT CTGTCATTTA 1740
CAACACAACC AGTTAGTTGT GGTTAGCACG CTGGCATGGT TCACTTAGCA GTCACAGTTG 1800
TCGTAAAAGT ATAATAAACT TATTTAATAA AATTAATGTA CTATATTTAA TTTCAGTAAT 1860
GTTATTTACG TTAAAATGGA TAATTTAGCA GACACACTCT TCGAAATCGT ATAAGTTAAC 1920
TTTTATGAAA TCAATGTACA ATTTTATGAA ATCAGTCTTG TTTACATTTA TTTATATTAA 1980
AATTTCACTA AACAAACCTA GTTAAGGGCC GTTTAGTCAT TCATTCATTC CTTAATTCAT 2040
TCATTCATTC ATTCATTTTC TTGGCTTAGT CCCTTTATTA ATCAGGGGTC ACCACAGCGG 2100
AATGAACCGC CAACTTATCC AGCATATGAT GCCCTTCCAG CTGCAATCCA TCATTGGAAA 2160
ACACCCAAAC ACCCATACAC TCTCATTCAC TCACACTATG GACAGTTTAG CTTACCCAAT 2220
TAACATAGCA CATTGGACTT GTGGGGGAAA CCGGAGCACC CAGAGGAAAC CCACGCCAAC 2280
ATGGGGAAAA CATGCAAACT CCACACAGAA ATGCCAACTG GCCCGGCTGA 2330