EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-14351 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr16:5999255-6000962 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr16:6000221-6000232TATGTAAATAA+6.02
HNF1AMA0046.2chr16:6000223-6000238TGTAAATAATTAATT-6.38
HNF1BMA0153.2chr16:6000224-6000237GTAAATAATTAAT+6.42
HOXB9MA1503.1chr16:5999691-5999701GTCGTAAAAT+6.02
HOXC10MA0905.1chr16:5999691-5999701GTCGTAAAAT+6.02
HOXC11MA0651.1chr16:5999690-5999701AGTCGTAAAAT+6.02
HOXD11MA0908.1chr16:5999723-5999733TTTTTACGAC-6.02
Lhx3MA0135.1chr16:6000226-6000239AAATAATTAATTA-6.71
Lhx3MA0135.1chr16:6000229-6000242TAATTAATTAAAT+6
POU4F1MA0790.1chr16:6000224-6000238GTAAATAATTAATT+6.11
POU4F2MA0683.1chr16:6000224-6000240GTAAATAATTAATTAA+6.39
POU4F3MA0791.1chr16:6000224-6000240GTAAATAATTAATTAA+6.38
Enhancer Sequence
TGGCAAACAT TATAATCGAG GTAAAGTTGA TTTCATATTC ACACATTTTG ACATAATAAT 60
ATAGTTTCAG AAAAGTAGTT GCTAATTCTA AATAGTGAAA TCATATTAGT AGCCAAAAGT 120
TCAACGTTAT TCAAATAAAT AGTGCTGATG TTGTTTTGAA GTCATTCTTG CATATGATTT 180
CAGTCCGAAT ATTCAAAATA AAATGATAAA CATTATAGGG AGCATGTCAC AAGTTGTCAC 240
TGAACAACTG TGAGACTATA AAACTAACTT TACCCCAATA TTGAAGCTGG CACTTGTGTG 300
TAACGTTATA AGCATTAATC TTACCATACG ACGAATGGTC TCCTTTAAGC GAAAATAACG 360
CCAAAAGTCC AGCTCAGATC AGATTAAGGG TAACTTGAAA AGTCGCTGAA CACAATCCTG 420
TTTTTCTATC AAGCCAGTCG TAAAATAAAA AATATATTCC GTGGACTCTT TTTACGACGC 480
AGCGGACATC ATTTCGTAAT TATCTGGCAA CAATGATCCC CGGCTCCCTT TCAATGGACC 540
TGCTGCTTGA AAAGTAGCAC GGCGATATTG TCCAGCTTCG TCTTTCTGTT CTCCAGGAGA 600
TTCGAGTATC TGTTCCCATT CAGAGATGAT CAGGGCGAGA GAAGAGCTGA TAAATATGAT 660
GCGCTCTTCC CCAATGATAA AGGACGTTCT CCCCGGAATC CCATCTAAAA AAGCCGGTAT 720
CACACGCTAC ACGCTCTCCG CCCCACACAT TACTGACCTC TCTCTCTCTC TTTCTCTCTT 780
TCTCTTTCAA CCTCCCCGAG CGTGACGCCA CTCCCCATCC TCACTAACCA GCTTTTGCAA 840
CTCTCTTTCA CAACTCACTA CTTGTTGAAG AAAACACATT TGGCTGTTTC CTAATTAATG 900
ATTTATAAAA GTATGCTATT TTGAATGACC TCCATACACG TGGCAGCATT GTTAGCACAC 960
AATAATTATG TAAATAATTA ATTAAATAAA TAAATAAATA GCAAGCATCC TTTAAATACT 1020
TCCTCAGCGT GGTGAATTCT TGCACATAGC AGAAAATATT ACTGCAGGTA GGTAGTGTAA 1080
GGGGTGGTTC TTTTCTCTCA AAAGGTGGAA CTTTTAGTGG TTATAGGCCT CATTTAGGCT 1140
ACTATTTGTT CATTTTCTTT TCGGCTTAAA TCTGGGGTCA CCACAGCGTA ATGAACCACC 1200
AACTTATCCA GCATAAGTTT AATGCAGCGA ATGCCTTTCC AGCTAGGAAA CATCCATACA 1260
AACTCATTCA CACACAGAAA TATAACTTAC CCAATTCACC TATACCACAT TTCGGACTTG 1320
TAGGGGAAAT TGGAGGAAAC CCATGCGAAC ACAGGGAGAC CATGCAAACT CCACACAGAA 1380
ATGCCAACTG ACCCAGCCGA GACTCGAACA AGCGACCTTC TTGCTGTGAA GCGATTGCGC 1440
TACCCGCTGC GCCATTGTGC TGCCCTAGAA AAGTAATGTT AATATGTAAC TTGCATTACC 1500
CCTAACACTG ATTATTATTT TTAATTATTA TTATTTATTC TTTTCGTTTT TGTTTGTGTA 1560
ATTGATGTTA AATGTTGGTA TTTATTGTGT TATACGTGTC TTTTTTAATT ATATGTAAAG 1620
CACTATACCA TATGTCAGAA TGTCAGCCTA TTTCAGTTTC TTTCATCTGT TGAACACAAA 1680
AGAAGATATT TCGAAGAAAG CTGAAAA 1707