EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-14184 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr16:2529972-2532084 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr16:2531987-2531999CAGCATATGTTT-6.04
ELK3MA0759.1chr16:2531801-2531811TACTTCCGGT-6.02
ETV1MA0761.1chr16:2531801-2531811TACTTCCGGT-6.02
ETV2MA0762.1chr16:2531757-2531768TATTTCCGGTT-6.62
ETV4MA0764.1chr16:2531801-2531811TACTTCCGGT-6.02
LMX1BMA0703.2chr16:2531826-2531837AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr16:2531829-2531840TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr16:2531876-2531887TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr16:2531873-2531886AAATTAATTAAAT+6.07
PBX1MA0070.1chr16:2531688-2531700ATTGATTGATGA-6.44
PHOX2AMA0713.1chr16:2531830-2531841TAATTAAATTA-6.62
PHOX2AMA0713.1chr16:2531877-2531888TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr16:2531830-2531841TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr16:2531877-2531888TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr16:2531830-2531841TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr16:2531877-2531888TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr16:2531830-2531841TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr16:2531877-2531888TAATTAAATTA-6.62
RORA(var.2)MA0072.1chr16:2531076-2531090CAAAAGTAGGTCAA+7.19
RORCMA1151.1chr16:2531077-2531089AAAAGTAGGTCA+6.32
Enhancer Sequence
AGGACTCTCT CCCGGGACAG CATGCCAAAC ACACTTTATA ATCAATCATC AGCTAATTGT 60
GAACTCTAGA AACACGGGAT CACTTTTAAA TCACTTCCAC AACACTTACA AATAAAAGGG 120
AGAATTGGAG ATATGACGAT GAGCAATCAA TAACAGAACT TTCATTTTTG GGTGAACTGA 180
CCCTTTAAGT GTAATAAAGC GAACAGTTCT TTTGATCAAC TGGACAGAAT GACTAAAACT 240
AGTCCTTCCT GCGAAATGCC GTCTGTGTTT ACATCTCGAC TCTATGAAAG GCTGTGCTGT 300
GCGTGTAAAA CACTGGCTGC TTTGAGCGGG GTTCACTGGA ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACAGCTAA TCTCTGACAC CCTCAGACCG CTGGTTTACA CAGATCCAGT AGCTGCAACC 420
GCTGATTTAT ACTAACGTGA CATAAAAATG ATTAGTCACA TGTGGAGCCG CTGCGGTCTG 480
AAAAAACCCA TCGCGGCCAC ACTCACGTAC ACAGAGAGAG CGTATTATAG TAGCAGAGAA 540
AATAACACAA CGTGTGTAGA CTTCCAAAAG TCATCATGTC TTGTAAACAG AGCGCAATAC 600
ATAACCCTGC TGGAGGATCT GCGGGTTCAT TTTTCAAACT CTCATCAAGG ATGACTTTAA 660
AAACTCCACA CTAAGGCCGT GTCTATGCTA ATGTTTTCGT TTAAAAACGC ACATTTTTCT 720
CGCACACAGA GATGACATTT TTAGGGAACG AACACATAGG GGAGAGCGGG GATGAAAAGA 780
CCATTCATCA TAAAAAACTA TTTCTAAAAG ATAATGCACA CTCACCGGCC ACTTTATTAG 840
GTACACCTGC TTGTTAATGC AAATTTCTAA TCAGCCGTTG ACTAACGTTG ACTAACTGGA 900
GCATTGTTTT AAAGTGTTAC TCTTAAAACT AGTGACTGTA ATAAGTAGCT GCTAATTAAT 960
CTAGTGTTGA TCAGCTGCTT CATTTGGATG TGATCCACCA TCTCTCTCTC TCTCTCTGAC 1020
CCTCACAGGA CAGCACAGTA CAGGACGTCC CGCTGAGAGA GCGGGGGAAT CCGAGAGCAC 1080
GTTTTACAGA AGTGAGAAAC GCTCCAAAAG TAGGTCAAAT ACTTTCCCTC CGCTCTCCTT 1140
CCCGGAGTTG TAGCTACCAG TATTTGCTCT CTGTTTCCAT TTCCAAATGG TAAAAGTGAC 1200
TCGGAGGTTG CGAACGGTTG CATCCGGCAA TTTTCTCGGA CTCATAAATC AGGATCGAGC 1260
CGCTCGAATG TGAACAAACG TTTGAATATT TTCCTCATAA TTCACTGCTT GTAAAAAGCC 1320
GAGAAAACGA ATATATCCCC ATAAATAAGC CCCTTAATGT CACCGTTTGA TTGAAGCCAC 1380
ATGTGGTGCC ATAGGTCTCC ACGGTAACTA AAACTTATAC CTTTGAAAAT AATATAAACA 1440
GTTAGTCGGA GTGTTACATA AGAAAGCGTA TGCATGTGTG TGTGTGTGCT GTAATATTAG 1500
GGCTAATTCC GTGCTCTTGC ATGCTCAGCT GTTTGAATGG CGCTTCAGTC AGTTGTTATT 1560
ACTCACTCTG CAGGTATTGA TTAAGATTTT TCTCATAGAT TTTTTCCATA CAAGCGGAGA 1620
AAGCAGAGAG CATGTTTATG TCTGCTAAAC TGTTTTGACA AAATTCACAG GTGCAGTAGG 1680
TGTGAGAAAA TATGCTGTAC CATCTGTCAA AAAAATATTG ATTGATGACC GCTCGCCCCT 1740
TTTAGGGCAG GACTTCAAGT TTTAGCCCTG CCCCTTTTAG GTGGATATTT CCGGTTTTGG 1800
TCCCCCGCCT CTTTTTATTA TAGACTATAT ACTTCCGGTA ATTACATCCT TATCAATTTA 1860
ATTAAATTAT ATTTTATAAT TCCGGTAATT AGTTTGTAAA CAAATTAATT AAATTATAAT 1920
TCCGGTAATT AGATCATACA TTTATTAATT TTCTTTTCGG CTTAGTCCCC TTATTAATCT 1980
GGAGTTGCCA CAGTGGAATG AACCGCCAAC TTATCCAGCA TATGTTTTAT GCAGGGGATG 2040
CCCTTCCAGC TGCAACCCGT CACTGGGAAA CACTCATACA CACTCATTCA CACACATACA 2100
CAACGGACAT TT 2112