EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-11484 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr14:34626344-34627716 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr14:34626483-34626495GAATGTTTATTT+6.74
HOXD9MA0913.2chr14:34626691-34626701GTTTTATTGC-6.02
RFX1MA0509.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.54
RFX2MA0600.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.68
RFX2MA0600.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.79
RFX3MA0798.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.67
RFX3MA0798.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.8
RFX4MA0799.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.41
RFX4MA0799.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.96
RFX5MA0510.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.17
RFX5MA0510.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.34
Rarg(var.2)MA0860.1chr14:34626561-34626578GAGGTCACTACAGTTCA+6.31
Enhancer Sequence
TCTTCGGTAG GAATGCCTTT TCCTTGAGAC CGCCAACCAC TCCGTTCATT CCTCCGTCAA 60
CATGGTTGGC ATCCGACAGA AGAATAATCG TCGGACATCG TAGTCTCGTG CACGTGCGAG 120
GGCGATATTC GTGTAAGTTG AATGTTTATT TTGTGTCTGT AAATTGCGAT TCATTGAGCG 180
GGGGATCCGG ACATGCGTGT GTCAGTGTTT GTTATCCGAG GTCACTACAG TTCAAAGCAG 240
CATCTCTAGA GAGACAAGAC ACGCATATAG ACGCGTGCTG CATAGAGCTG CATTTAGACA 300
TTATAAATAA CGTTAGCGTG TTTTGATTCC ATTTCAGTGC ATGTTGCGTT TTATTGCAAA 360
CGTTTAACAC CGGTTATCAC AACGTGCTAA AGCAGCGTCG CGTTGGTATC TTTAACGATA 420
ACCTAATACA TCTGTTTCTT ACGTGGGTTG TTCTTATGTA TATTAATAGG AGTAAAACAG 480
AAGTTATTTG TGTAGATGCG CTTATTTAGC ACCGCAACAG GCTCACTGTG CGACCAGCCA 540
GTCACACACA ATGAATTTTC AATGAGCTCG GGGGTTACTA CAGTTCATTT CGACAGTTCC 600
TGCTGCCTCC AACACTAAAA TGCATTATCA GATGTCGTGG TGTGGTGCGG GCGGTCAGAA 660
ATGCTTCCTA AAACGGTTAA AGTCTTTTAA AAGGATACCA AAAACAGCAA GATGAGAAAA 720
GGTAGATTTT GAAGCAACGT TTTAATGGTT TTGAAATGTG TCAATCTTCA TAGAAGTTAT 780
TAAGACTGGC AACAGAAATG TGTTCTCCTT TACGGGGTAG CCATAGCAAC AGTAGGCCGC 840
ATGAGGGGTT TTCGTAAATT GTCTAAATAC TAAATGCTAT ATTTATGTCT TCATTGAATA 900
CACAGTATTT ATTAAAGTGT ATTTGCACAT AAAAAGTGTC AAGAAAATGT GTTTTTTGCT 960
GGTTTAAGCT GGAAGTTACT TGTTTTAGCT GGTTTTCAAG CTTGGCTAAG CTGTTTCAAC 1020
TGGTTTTCCA CTCAGTCCAT ATTGTACAGT TAGTAAGACC AGTTTAAGAC CACATTTTAA 1080
AATGAAGTAA CTGATTGCCT TGCTTATTAA TTTATGGGAC ATTCTACCAG AAACGTTCGT 1140
TATCTGTCCC CGAAATTAAA ACATGAATAC AGTGAATAAT AAGTATTTAA TCCCCCAAAT 1200
TTTTTTAAAA TGGACTGATG GTTGATTTCT GTTATTTCTT TTAAGGAATA TGTCATTCAT 1260
TAGGTTCTTA GATTTTAGTT TTTTATTAAA AACACTTTTC AAATGTACAA ACCCTGTCCT 1320
TGTCCTCTGC CCAATGGGCT ATATGCACAG TTAAGTGTTT TCCAGCCAAT TG 1372