EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-06130 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr12:5299473-5300491 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr12:5300069-5300086TGACCGTTTGTTGACCT-6.65
RREB1MA0073.1chr12:5299858-5299878CCCCAAAGCCACCCCCCACC+6.16
RREB1MA0073.1chr12:5299866-5299886CCACCCCCCACCCCCTTCCC+6.35
RREB1MA0073.1chr12:5299859-5299879CCCAAAGCCACCCCCCACCC+6.39
RUNX1MA0002.2chr12:5300143-5300154GTTTGTGGTTT+6.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr12:5300069-5300086TGACCGTTTGTTGACCT-6.58
Enhancer Sequence
TCAGTCTCCC AGTTGATTAG AAGAAATGTT GCTGGTTAAA GGGAGTTCAC TAGTTCACAG 60
GCATCGATGA GAAGTGATGT AATACCACAG CGTAAAGTGA ATGGATCACA TAAGACTTAC 120
AGCATTAATC CTAATGTCCT TTGTGGACAC TCAAAGATCT TTTCTTTTAG ATGGATTTGA 180
TTTGATCTTC CTGTGGACTC ATGCAATGTC TTATTATTTT GGTTACATTG TAATCAAAGT 240
TCAATGTTTA GGACTGTCGC CTCACAGCTA GAAGGTTGCT GGTTCGAGTC CCAGCTGGGC 300
TAGTTGTTAT TTCTGTGTGG AGTTTGCATG TTCTCCCCTT GTTGGCGTGG CATTTCCTCC 360
GGGGTGCTCC AGCCCCCCAT CCCCCCCCCA AAGCCACCCC CCACCCCCTT CCCCCGTCCA 420
TACACATGCA CTACAGGTGA ATTGAATAAA CTAAATTGGC TGTAGTGTAT GAGTGTGTGT 480
AAATGAGTGT GTATGGGTGT TTCCCAGTAT TGGGTTGTGG ATGGAAGGGC ATCCGCTGCG 540
TAAAACATCT GCTGGAATAG TTGGCGGTTC ATTCTGCTGT GGTGACCCCT GTTTTTTGAC 600
CGTTTGTTGA CCTTGGTTGT AACCTACATA ATGCAACCCT TGTGTTCTGC TGTCTTTGTT 660
GTGGTCAGTT GTTTGTGGTT TTTGCACACA CTCTTGACCG GCGGGTCCTT TGAAGGGCCG 720
TCCAGGGTGC AGTGTCTCTT ATGTAAGCTT TTAATGTGTC AGGAGTGCTG TCCGTGCTCT 780
GCTGGCCGGT AACTCAAGAG CAGCAGTCTG TCCGCTGGAA TGCTGGCAGA ATGACACGAG 840
CTCCAATGTA CTGGTCCCCT CGTATTAAGC CTTCCTGACC ATCCGGGCCC CGGCCGAACT 900
GTTTATGTAA CTGACTGGCT TTCTGCGAGG TGTTTTTAGC TGCAACACAC CATCGCGTAA 960
ATATTTGCGC TCAAACTGAT TGCTGTTATG AGTGCTGCGG AGAGGAGACA GTCGGGTT 1018