EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-06013 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr12:1562023-1563035 
TF binding sites/motifs
Number: 31             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr12:1562666-1562677AATAAACAATT-6.02
RFX1MA0509.2chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA+6.83
RFX1MA0509.2chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA-6.83
RFX2MA0600.2chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA-7.04
RFX2MA0600.2chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA+7.09
RFX3MA0798.1chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA+6.99
RFX3MA0798.1chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA-7
RFX4MA0799.1chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA-6.32
RFX4MA0799.1chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA+6.75
RFX5MA0510.2chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr12:1562864-1562880AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr12:1562914-1562930AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA+7.37
RFX5MA0510.2chr12:1562965-1562981TGTTGCTATGGTAACA-7.3
Enhancer Sequence
ACCCGTGGCC ATTATTAACA TCTAATACAT CAACCGTTTT CAAACAAATT CACAAAACCG 60
CATTCCTTAT TCATCTGTCA TTTGGCAACA GTCACACGAT TTCCTCAAAT ATTTGGTTCA 120
AGCCGGATGC CATGACAACC GTGACATCAT TCCCAAGTCC ACAATTCGTC TGACGGGATG 180
GCAGAATTGC ATAATCATCC CTACAACACG GACCCTTGCT TTAACGTGGA AACCAACTTT 240
GCCTTTGTGG TGAAAAAAAG CACCGTAGAG GGTGAGATAT GGATCCGCCA CTTATCAAGC 300
CTCCGTCTGC TCATGCATTT CTTTTTTTTG CTCTGAAGCA AAACCTCACA GGCCTGTACT 360
CTGTAGTGCA CTACACTAAT GTGGTATAGG AAGGAAGTGT TTTATGTTTA TATATGTTAG 420
GGAGAGCATT GCAACACAAA CACTGCAGAA ATATGTGATC CCGGAGCATG AAACCAGTCG 480
TAAGAGTCTG GAGATTGAGA TGCTTTATCT GAACGCTGAA TAAATAAGCT TTACTGTGAC 540
GTATGACTTG TTGGGACACA TATTTGGCTG AGATACAACT ATTTGAAGAT CTGCAATCTT 600
GAAAAAATGC ATTTTAAAGT TGTTTAAAAG AGATCATTTT AATAATAAAC AATTCAGGAC 660
ATTTACATAA TTTCTTCACG GAAGATGAAC TTTACTTAAA ATTCCAATGA TCTTTGGCTT 720
AAAAGAAAAT TCAAAAATTT TAACTCCATT CACCTTTTAT ATATATAAAA AAATTACAGT 780
AATTTATAGT AAATACTACC ATACAATAGT AAATTACTTT AATCTGTTGT GATGATTCTA 840
TAGTTGCTAT GGTAACAAAA GTGCTATAGT AATTTGTTGT GGTCATTCTA TAGTTGCTAT 900
GGTAACACAA GGACTACAGT CAATGTGGTG TGGTTATTCT GTTGTTGCTA TGGTAACACA 960
AGTACTATAG TAGTTAATCT GTTGCGGTAA TTCTACAGTT GCTATGGTAA TA 1012