EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-05954 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr12:705592-707288 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:705823-705840ATTAATTAATTAATTCT-7.2
Arid3bMA0601.1chr12:705930-705941TTAATTAATAT-6.62
ArxMA0874.1chr12:705823-705840ATTAATTAATTAATTCT+6.26
FOXB1MA0845.1chr12:706991-707002AATGTAAATAT+6.32
Foxj3MA0851.1chr12:706949-706966GTGTGTGTTTACTTTTA-6.02
Lhx3MA0135.1chr12:705927-705940TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr12:705826-705839AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr12:705821-705834TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:705825-705838TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:705822-705835AATTAATTAATTA-6.78
NR2C2MA0504.1chr12:706876-706891TGACCTCTCACCCCT-7.11
POU1F1MA0784.1chr12:707254-707268CTCATTAGCATAAA-6.64
POU3F1MA0786.1chr12:707255-707267TCATTAGCATAA-6.22
POU3F2MA0787.1chr12:707255-707267TCATTAGCATAA-6.44
POU4F1MA0790.1chr12:705765-705779AATTAATTATGTAT-6.59
POU4F2MA0683.1chr12:705763-705779TCAATTAATTATGTAT-6.03
POU4F3MA0791.1chr12:705763-705779TCAATTAATTATGTAT-6.09
POU6F1MA0628.1chr12:705823-705833ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:705827-705837ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:705929-705939ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:705823-705833ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:705827-705837ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:705929-705939ATTAATTAAT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr12:707253-707269TCTCATTAGCATAAAC-6.39
RARAMA0729.1chr12:706865-706883AAATGACATTCTGACCTC-6.92
Enhancer Sequence
AGTCTTGAAA TGAGAGCAGA GGATGTGAAA CTAGAAACTA ATTCTGTTAA TTAAAAACTG 60
AACCACCCTG TTACACTATA ATAAAGCAGA CAAGAGGAGA AACTCACACA ACGTCATAAG 120
TAACACTTCA GTTTTAGGTG TCTTTGTTAT GTACTTACTT TAGTAGTGAT TTCAATTAAT 180
TATGTATAAA TACATTTTAT AAATACAAGC ACATTTTACC CATATGTGGT AATTAATTAA 240
TTAATTCTGC GTGCACTTAT TTTATGCAAA CACATGTAAT ATTAATGAGT TATGTGTACT 300
TATATTCTTA AAATGTGGTT TTGGCTTGTT GCATGTAATT AATTAATATT ATTTAAATGA 360
ATAGCTCAAC CAGGACACCT AAAAATAAAT GGTTAACGCA CAAAGGTTAA AGAAGTGCTC 420
AGTGTTTTGG TTTCACAGCG TTATCAGTGC ATGAAGGCTG AGGAAGCTTT TTAAAAAAAC 480
ATTAAACCGA GGTGTTTATA AAGAAGTTTG TATATAGTTT TAGTTTTTGA TTTCAGACTT 540
TGATTCGGTG TATATGAAAG CAATAGGACA GAGGTCAGTG CACTTCCCCT TGAGTCATCA 600
TCACTACATA GTGTGCACTA AACATCGGCA TGTGGTTTAC TCTTGATTAC GCATGCAAAA 660
ACAGCAATGG GGTTATTAAC ACAAATATTA AGGCACACAA AAGGAGATAT TTTAACACAG 720
GCTGGTTTTG AAAATGTACC CCTGTATACA TTTCTGGAGA GCACAAATTA GTAGGCAGAG 780
CTACGTATGG CTGCATTTCG TCTTTAAAAC GAATGATACC GGGTGGTATA ACGCCAACAC 840
CGGCTTCTGT TTCTTTTAGC GCTTCCAGCT GACTGCTCAT CTCCGTGTGG ATGGCTTTAC 900
CGCTGCAATT ATATCTGCTG CAATTTAAAA AAAGGCCAAG CTTCCCTACA TTTTGTGTCG 960
TTTGTGTTAA ATTCAGCATT CACAGAAGCA TGGAGATTCA TCTCTTAAAT CATTGAATGT 1020
TAGTGAACTT ATTATTTGCT TTAGAGTAGG AACCCTGCTG TCACCTCAGT TATCTAAACA 1080
CAAAGGTATG AAGCTTTAAA GCATTTATTT TCCTGCTCCA CACGCTGAAA TCTCACCATA 1140
TTGGGTGTTC CTCCCTGACA GGACTCTGAG GAGTGTTTTG CTTACTCTGG GTGTTTATGT 1200
GGCTCTCAGT GAGCAGTTAG TTAAGAATGA AACGCCTCAG ATTTAGTGTC AAAAGCCTCT 1260
GGGTTTTCTA CAGAAATGAC ATTCTGACCT CTCACCCCTT TTTTCATGTC AGCACTCGAC 1320
TCTTTTGTGG ACTGTTAAAG AGTGTTTAAT GACGAGGGTG TGTGTTTACT TTTATTACAA 1380
TTGCAGGAAA AGCATATTAA ATGTAAATAT AGTCTACTTA ATGACCTGTG GAGAAATGAA 1440
ACGTCATCAT ATGGGTTAAA GGAGACCTAT TATGCGGAAA TCACTTTAAT ATGGGGGTGT 1500
GTGTCAGCAG TGTGTGAATA TCTCCAGCAT CTAAGTGGTA AACATCAGGT AATTGTGTGT 1560
TTTATAATCA GACTTGATGA AGGAAACACT TTGATTGACA TTCTCTCTTT GTACGTGTCA 1620
TCAGAGGGGG AAAGCCCCAC CCACTAGTGC CTATCTCTCC ATCTCATTAG CATAAACGGC 1680
AGCCCTGAGT GAGAAG 1696