EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-05891 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr12:227436-228487 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr12:227558-227569CTAATTAATAT-6.02
HLFMA0043.2chr12:227881-227893GGTTATGTAATG-6.62
IRF1MA0050.2chr12:227618-227639TCTTACTCTCAGTTTCTGTCT+6.03
LMX1BMA0703.2chr12:227575-227586AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr12:227574-227585TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr12:227574-227585TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr12:227574-227585TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr12:227574-227585TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
CCTGAATGCT CGTGTGATCA TGCCATCCTG CTCTGTGCTT TTTTAATACA ATACTGAATC 60
ACCATTACAG AGTTTTGATG ACTTCTCTGC AGTTTACTCA CACTGATCTC TCACACGCAT 120
CTCTAATTAA TATTAATTTA ATTTAATTAA AGCTTACTGG TATCCGCTGC TGACCACGCT 180
GCTCTTACTC TCAGTTTCTG TCTGGTTTCT AGTCTAAATA TCTACAAATA TCAAGAAGCA 240
CTGTCTTGTT TTCAGAAATG GAGTGAGATT TTCCTTAAAA CTAGAAAATG AATCCCCCTA 300
AATGACAAGC TGAGATGTGA ATCAGAGTGA GTGAACAGGT TGAGTGTGTC TGTAATCCTG 360
ATGATGAGCT GAACGACAGA AGATGAATAA ATGACAAAAG GTAATAATAA ATGAACGAGG 420
TAAGATGTGT GTTTCTGTCC AAACGGGTTA TGTAATGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 480
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 540
GTGTGTGTGT GTGTTTTCAA TTTTCACTCT GACTTCCGTT TTCCTCATTG GGACCAAAAA 600
CGTCCCCATG AGGTCAAAAT GTTCTGGTTT TGCTATACTT ATGGGAACAT TTGAATCTCA 660
CAAATTTCAG GAATGCAAGT TACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACATTTT 720
GTGCGACTGA AGCTGGATGA GAAATTAGCA CATCAGTAAC GTCCTCATAA TTCACGTTCT 780
GCTGTAACAC CCGTCATAGA CATCACACTA TACAAGTGTG TGTCCTGATA TGTCACACAC 840
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACTGCATGAC GTCTGCGCGT CCCCTGAGTA 900
AACGCTCATT TCCCTTCACT CGAGGAAGAG CCCAATTTTG TCAGTAATTT GGAGCTGAAA 960
GTCATTACTG CCAGAGCAGA CGCTGAGAAG CCAAACCCAG CGCAGAGGAG AACTGCAGCT 1020
CAGTCTGAGC AGAGAAGAGC AGATCCCGCG C 1051