EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-05454 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr11:35730451-35731334 
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr11:35731065-35731082TGTATTAATTAATTAAT+6.32
ArxMA0874.1chr11:35731065-35731082TGTATTAATTAATTAAT-6.4
FOXE1MA1487.1chr11:35731094-35731109GATTAAATAAACATT+6.43
HNF1AMA0046.2chr11:35731226-35731241ACTTAATTATTAATT-6.04
HNF1AMA0046.2chr11:35731087-35731102AATTAATGATTAAAT+6.76
LMX1BMA0703.2chr11:35731206-35731217AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr11:35731209-35731220TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr11:35731067-35731080TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr11:35731082-35731095TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr11:35731070-35731083TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:35731074-35731087TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:35731078-35731091TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:35731071-35731084AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr11:35731075-35731088AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr11:35731079-35731092AATTAATTAATTA-6.78
PHOX2AMA0713.1chr11:35731210-35731221TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr11:35731068-35731078ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731072-35731082ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731076-35731086ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731080-35731090ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731084-35731094ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731068-35731078ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731072-35731082ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731076-35731086ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731080-35731090ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:35731084-35731094ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr11:35731210-35731221TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr11:35731210-35731221TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr11:35731210-35731221TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
GCAGCTTATG AAATGATCTA AGTACAAGCA TATGTGAAGA TTTGGAGACT AGACTTGGGC 60
ACACTTCAGA AACTTTGGAA AAGCTTGTAG TAGCAGAGGA GAAATGACAA AAGGCTGAAA 120
CAGAAGCTGG GTGGAGCACA GAAGAGGTTT TGTTGAGGAA GCCTGACTGT GTAAAGAAAT 180
ACTCAATAAC CCAGAAATCC TATATTAAGA AGAGAATTGA ATTCTGCATA GCCACATTAA 240
GCATTTCATG ATAACATTTA CACTCACTGG ACACTTTTTA GGTATTCATT CTTGATGGCA 300
ATGCTGGAAG CAAACATCAC ATGTACCAAC TTGAAATGTG TGCATGCAGT AATTTTAAAT 360
ATGTCTATTA AATCAGTGAT TTTTGCTATA TCTAGATTTT ATTGTTTGGT TGGTTGTTGT 420
TTTTTCAATT GTACTAGTTT AACAGATGTT TTCGGTGCTT ATAATAATTG ACTAATCAAT 480
CAGGAAACTA ATTTGTCTGA AAACTATTCA AATGAGTAAT ATTTGTTTAA AATGAAACAA 540
TAACACTAAA ATATAATAAC ATAGTAAAAT AAAAAATGTA AAACTAAATA AAAATGTAAA 600
ACTAAATAAA TGAATGTATT AATTAATTAA TTAATTAATT AATGATTAAA TAAACATTTA 660
TAAAAATAAA TTAATTCAAA ATAAAATAAA TACAAAATAA TGTTCATGAA AACAAAATGT 720
ATAAAAAATA CATTCATTCA ATTTAACTAA ATTCAAATTT AATTAAATTA AATTAACTTA 780
ATTATTAATT TAATAAAATT AAATAAATAA TAACTAAAAA CAAAAATAAT AAACATAAAA 840
AATTTAAATT AAAATTAATT TAATTTAATT TAAGTTAATC ATC 883