EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-04010 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr11:4037984-4039394 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr11:4039321-4039342GTGTACTTTTACTTTCCTTTG+6.49
RFX1MA0509.2chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA+6.24
RFX1MA0509.2chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA-6.26
RFX2MA0600.2chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA+6.62
RFX3MA0798.1chr11:4038767-4038783GGTTGTCTTGGCAACA-6.06
RFX3MA0798.1chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA-6.56
RFX3MA0798.1chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA+6.65
RFX4MA0799.1chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA-6.02
RFX4MA0799.1chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA+6.17
RFX5MA0510.2chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA-6.58
RFX5MA0510.2chr11:4038813-4038829TGTTGCTATGGAAACA+6.6
RREB1MA0073.1chr11:4038911-4038931TTGTTGGGGTTTTTTGGGGG-6.04
Enhancer Sequence
CCCAATACCT CAGACAGACC TAATCTGAAA ATTTGACAGA AAACAAACAG CAAGTGCATT 60
TTCATATTTC AATTTCAGAT TACCAGAGCA AACCATTTTC TTAATGAAAT GCACAGATGA 120
ATTGTTCACC ACAGAATTAG CTTTATGAGC TAACAAAATC AGCATGGCTA GTTTTGATTT 180
CATTTGTACT TTGAGATACT CACAATTCAT CCTTTCTCCT CGCGTTCAGT TCAGATAAAA 240
TAAAATACAG AAGCAGAAGA ATTATATAAC TGTATTTTCA GATTCAAACC CTGCGGTCTC 300
TCATTAAACA CTTCCACATG CTGCACTCGG AGCCAGTTTA AAGACTGGGG GCCATTGTTA 360
GGGCTGAGCT TTCTATTTTT TCCGCTTTGG CATGCTCGGA TATCGGGTCT GTGGATGACC 420
CTTGCTCTCC TCAAACAGTG ACAGGAGTGG GAAAACTCAG AGGCAGCATT TCAGGCCTGC 480
ATTCGGTGTC TACACTGACA TCATGTCTGC TGTGAGAGTT TCAGACAGGA GAGAAGGGGG 540
GAACTGCGCT TTCGTTTATT TCCACCGCTT CAATAAGGTT TGATTAATGA GAATGCGGAA 600
AGACGTGTTA CAGAATAAAC ATATTAACTT TATTCAAATG AGCCTGTTTC GTTTTAATGG 660
TTGCTGATCA TTCGCTTAGT CAGAATGTCA GCATTCGCTA AGGTCAGTTT TGTATGTTGT 720
CCAGGCTTGT TCGGGGACAG ATCAACAGCT CTGCGTCGTT CAACTGCGAG TTCATCGTGG 780
GTTGGTTGTC TTGGCAACAA GAGGAGACAC TTTCCATATG GACTATAACT GTTGCTATGG 840
AAACAAAGTT TTTATTTTCT ATTAATAATC CGGCGGGTAA ATGTGTAAGC ATCGAGAGCC 900
TCAATGTTCT GTCTCATGGA AATGTTTTTG TTGGGGTTTT TTGGGGGGTG GTGGAGGGAT 960
TTCGTCCAGT CTGTAATGCT CTGCTCCATT TCACTGTTTG ACTCTCTTGC GGTGGATTTT 1020
ACACAGCTCC TCATCAACTC TTGGACTATA CAAACCCTTT AAACACACTC AGCCAGTTTC 1080
ATTAAATCGA GCTCTTAAAC TGGAGACTGT ATCAGTATAA TGTCAAGCTG TTATATGCTT 1140
CACTTAAACT GCTATTGATT CATCGAGTGA GAGAGAAACT CAGGAAATGT ACGTTAGAAA 1200
ATCCTAAACC ATTTCCTTTG GCGTGGATTC ATATAAGCCT GCAGCAGTGG TGTAAAATAA 1260
CAAATTACAA ATACTCAAAC TACTGTCATT GAGTAGTTTC TCTTAGAAAT TGTCATTTAT 1320
TAAGTAGTTT TAAAAGTGTG TACTTTTACT TTCCTTTGAG TACATTTTTA CTGCAGTATC 1380
AGTGCTTTTA CTAAACTACT TTCCTTCAAT 1410