EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-03129 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr10:28226378-28227718 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr10:28226476-28226493GGAAAGTAAACAACCTC+6.07
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr10:28226676-28226687CTTGAGTGGTT-6.32
SCRT2MA0744.1chr10:28226831-28226844GAGCAACAGGTGA+6.36
Enhancer Sequence
CCACGTTTTT TCACATTGCT GAAATCATTA GGCCCTGTGA GGGGGAAATG TCAAAACGGC 60
CTTAAAGGCA TAATGAAGAC ATTGGCAGAA ATCTATGAGG AAAGTAAACA ACCTCATGAA 120
GCACTCCACT TTTCCAGCAC AAAATCCTTG TTTTTCCAAA AAGAGATGGA ATTTAATATG 180
ATCTAAAATT AGTAATGACC ACAATATGCA AAAACATCAC CGGAAAATGT GTGTGTGTTT 240
TAAGGACAGG AGTCATGTTT GACTCAAGGA ATCTAGCTCC TTTGACTTTC CACTTAAACT 300
TGAGTGGTTT GTTGGGTCAC GGCCTTCTAC ATAACTTCCT CCTTCGTCAC AACATCTCTC 360
TTTCCTCTCT TTCACTAAAG TTTTACAAGA ACTCCTGCGA GCGCTGCCAG GAATGACAGC 420
AGATGCTTTG CGTGAGAATC AAAGCAAACA GCTGAGCAAC AGGTGAAGTG ACACCAACAA 480
CCCCCTTGAA AACACACTCC AACCAACAGG CCAAAACTAT CGGATGCTTT CTCTGCTTCC 540
TCTTGCTCTC AGGAGATGCT CATCAATAGT GTCTGTCTCA CATTGCTTCA GCCACTCAAA 600
AAAGTCAATC GGGCGCCTGA AGACCAATTG TCCCTGGTGA CCCGTCCAAT GACAAGAAAA 660
TAGCTTCACA TGCGCTCAAG ATAAAAACTG TGACTGTTTT CAATTCATTT AACTGAAAGC 720
ATTCTTCTTC ATAAGCATGA CGACCTCACG AGTGAAAAAA AAAAACTTGA AATGTCAATC 780
TCAGGAAGCC ACAAGTTATC TGCAACATAT CGCAAGTGCA ATTTTAAACT AGACATAAAA 840
TTAATAAGCA CAAATTAGAC ATAACAAAAG TTGTTAGCTG ATGATACTTA ATAAACTTTC 900
TTGTTCTAGT TTAAAATCAT ATTTACTCCA TCCTCCGAGG TGGCTAATAA TATAGTCTAT 960
AACTTTAATG TTTGCGTGTT ATGAGGCAGC AAATGTGTGT GCTGAGGTGA GACACAGTTT 1020
CCCATGAGCT GAGCCTTACA GTGGTGTGCT AAAATTACAC TAAGCAAAAC AAAACGGGGT 1080
CAAACACTTT AAGAGCTTAC ATGTACAGAG AAATATGCAG ATGGGCTGTT CTTGGTGATC 1140
ACAGACAGAC ACTTGTATTA TATAAACATT TAACATTCCT TGCATAAAAG ATTCTGATTG 1200
ACGTGAAAAA AACGTGAGAA GGAAAAAAAA AGGTGACACA CCTGCAACTA AACACAACTC 1260
TGAGACTGAA AGCGCAAATG AGTTTCTGGA AAACTGCAAC TATTCATATT CAAATCATCA 1320
AGCAATACAT TCAAACAAAG 1340