EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-02674 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr10:13386818-13388489 
TF binding sites/motifs
Number: 45             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr10:13387640-13387657TGAATTAATTAATTAAT+7.27
ArxMA0874.1chr10:13387639-13387656ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr10:13387640-13387657TGAATTAATTAATTAAT-6.7
DUX4MA0468.1chr10:13387702-13387713TGATTGAATTA-6.14
FOXE1MA1487.1chr10:13387518-13387533AACTAAACAAACAAT+6.41
Foxd3MA0041.1chr10:13387522-13387534AAACAAACAATC-6.92
HNF1AMA0046.2chr10:13387799-13387814TGTTAATAATTAGTT-6.08
Lhx3MA0135.1chr10:13387661-13387674TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr10:13388151-13388164TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr10:13387641-13387654GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr10:13388148-13388161AAATAATTAATTA-6.71
Lhx3MA0135.1chr10:13387645-13387658TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:13387649-13387662TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:13387653-13387666TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:13387657-13387670TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:13387642-13387655AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:13387646-13387659AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:13387650-13387663AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:13387654-13387667AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:13387658-13387671AATTAATTAATTA-6.78
ONECUT3MA0757.1chr10:13387526-13387540AAACAATCAATAAT+6.04
POU4F1MA0790.1chr10:13388146-13388160CTAAATAATTAATT+6.07
POU4F2MA0683.1chr10:13388146-13388162CTAAATAATTAATTAG+6.74
POU4F3MA0791.1chr10:13388146-13388162CTAAATAATTAATTAG+6.51
POU6F1MA0628.1chr10:13387643-13387653ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387647-13387657ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387651-13387661ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387655-13387665ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387659-13387669ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387643-13387653ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387647-13387657ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387651-13387661ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387655-13387665ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr10:13387659-13387669ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr10:13387505-13387518GAATGAATGAACA-6.3
ZNF24MA1124.1chr10:13388058-13388071AAATGAATGAATA-6.42
ZNF24MA1124.1chr10:13388062-13388075GAATGAATAAATG-6.48
ZNF24MA1124.1chr10:13388066-13388079GAATAAATGAATG-6.5
ZNF24MA1124.1chr10:13387606-13387619GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr10:13387633-13387646GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr10:13388070-13388083AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr10:13387629-13387642GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr10:13388074-13388087GAATGAATGAATG-7.82
mix-aMA0621.1chr10:13387662-13387673AATTAATTAGT+6.62
mix-aMA0621.1chr10:13388152-13388163AATTAATTAGT+6.62
Enhancer Sequence
ATATCTTTTT AATAAATCTG TTTTGTTTAA ATGCACCAAA ATACATTGCC TATATTTACT 60
CAGAAGTGGC TAAAACTATA TTTTCAAAAT GGGACATACT CAATTATGCT GAGCACTGTC 120
TCCTGATAAA ATATGTCTCA AAACAGACTA GAAACTTTTA AACTAGGGAT TTTCATGGTT 180
AAAATTTGAT AGTTAATAAT GTTTTAATAG TATTAGTGGA AAGCAACAGT GTCTTCTGTA 240
TTGGTTTCTG TTGTGTTTTT CAGTGGGGTG TAGAGGGCAT TCTGGGACAT GACGTCAAAT 300
GAAAAGGCCC GCTATCTGAA AAATGGCCCT GAGGAGCTGA GTATCAACAA GCTGTAAACG 360
CTTTAAACAA ATACAGTAAC TGACAGGACA CATCTGTCGT TTGCCTGGCA GGCTGGCGTT 420
TTATGACAAA CGGTGCCCGA GGAAAGACAT TAATAAAAGT CAATGCAGGA ACTCATTTCA 480
CATTCCAGAT GCTGAAGTCA CCACACCTCA CAACAACACT CTCAGGGGAG ATCATTTGAT 540
CATTGATGAA GGAAAAATGA CAATGGTTTA AATATAAACA CTAAAGATCA AAATGTGGAA 600
ACAAGAAAGA AAGAAAGAAA GAAAGAAAGA AAGAAAGAAA GAAAGAAAGA CAGACAGACA 660
GACAGACAAG ACATTATTTT ATACATAGAA TGAATGAACA AACTAAACAA ACAATCAATA 720
ATTAAGATAA TTGTAAATAA ATTACTTAAT TATGAATGAA TTGATTAATA AATCTGTTAC 780
CTAATTATGA ATGAATGAAT TAGTTAATTG TGAATGAATG AATGAATTAA TTAATTAATT 840
AATTAATTAA TTAGTTAAAA GTAAACTAAT AAATTAGTTC TGAATGATTG AATTAGTTAA 900
TTGGGAATTA ATGTATAAGT TATAAATTAA TGAATTCTTA AAGAATCAAT AAATAAGTTA 960
TGAATTAATG AATCAGTAAA TTGTTAATAA TTAGTTAATT GTGAAATAAT AAATTAGTTA 1020
TGAATAAATG AATTAGGGCC ATAAGGTGGT GTAGTGGGTA GCACGATAGC CTCACAGCAA 1080
GAAGGTTCAT GGTTCGAGCC TCTGCTGGAT CAGTTGGCAT TTCTGTGTGG AATTTGCATG 1140
TTCTCCCCGT GTTTGCGTGG GTTTTCCCCA TATGCTGATA AGTTGGCAGT TCAATCCGCT 1200
GTGGTGACCC TGATTTAATA AAGGGACAAA GCCAACAAGA AAATGAATGA ATAAATGAAT 1260
GAATGAATGA AATAGTTAAC TGTTAATGAT TGAATGAATA AAAAATTTAT GAATAAATAA 1320
ATTAAGAACT AAATAATTAA TTAGTTATGA ACGAATGAAC ACATTGTGAA TAAATAAATA 1380
AGTTAACTGA AATAATGAAG GGCGATGCGG TGGTGCAGTA GGTAGGGCTG TCACATCACA 1440
GAAAGAAGGT CGCTGGTTCG ACCCTCGGCA GGTTTAAAGA CATGTGGTAC AGATGAATTG 1500
GGTAAGCTAA ATTGTCCGTA GTGTATGAGT GTGAATGGGA GTATATGGAT GTTTCCCAGA 1560
GATAGGTTAA AGCTGGAAGG GCATCCGCTG CGTAACATGT GCTGGATAAG GTGGCGGTTC 1620
GTTCTGCTGT GGCGACCCCA GATTAATAAA GGGACTAAAC TGAAAAGAAA A 1671