EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01837 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:56543816-56545369 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr1:56544868-56544878ACTAATTAGC+6.02
HOXB3MA0903.1chr1:56544868-56544878ACTAATTAGC+6.02
IRF1MA0050.2chr1:56545176-56545197ATACTGAAACTAAAACTAAGA-6.57
LHX6MA0658.1chr1:56544868-56544878ACTAATTAGC+6.02
LMX1BMA0703.2chr1:56544825-56544836AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:56544824-56544835TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr1:56544824-56544835TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:56544824-56544835TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:56544824-56544835TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
CACCAAATAT GTCCCAGGAG CTGCGTTTTT TTGGAGTTTT TGTTTTTGTG AATTCACCAG 60
AGGCCGCTTT GTGCACTTTT TTAAATCTCA ACTTTCTCTC GCAGATGCCA TTCACGCCTG 120
CTGTTCTGTC GACTGACTGA CTGATTGACT GACTGACCGA CCGATTCCCC CACCCCCTAT 180
CTCCCCTAAA TCCAACAAAT AGTGTTTTAC AAAGCACCAT TTGACGTGCC CACCCCTTCT 240
CTAAACCCAA CAGACAGTGT TATCAAAAGC AACGACTGAC CCACCCACAG CCTTTCCTAA 300
ACCCAACCGA TAGTGTTTTT AAAAGCACAG ATTGACCCGC CCACCCCCTT CCTTAAATTC 360
AAGCGACAGT GTTTTTAAAA GCACAGATTG ACCCGCCCAC TGCCTTTCCT AAACGCAACC 420
CACAGTGTTT TTAAAAGCAC AGATTGACCC GCCCACTGCC TTCCTTAAAC CTAATATTTT 480
AATCCTTTAT ATTTATATTA TATATCTATT CTTATTATAT CCTATATATA TCCTTAATAT 540
TTAATTTTTT TCATTTGTAA AGATATTTGC GTATTGCTCT ACATCTTGTG TGTATTAAGC 600
AGTGTGTGAG CGAGGCGCAA CTCTGCGCTG GACTTTAGGC TGAGTTTGTT TTGGTCTATT 660
GAAAAATCTA TTATAGTTTC TCAAAATAGT AACGCGCCAG CAGTGCGCCT CAGAACGCCT 720
TCCTTTTAGA CCAGAACGCC TATGGGCGCA CATAAGAGCG CAAATGCATT TGCTATTTAA 780
ACAGCGTAGC GCAACGCCTC AAAACCACTC TTGCGCCGGG TGTATGATAG AGCTCACTGT 840
CCCATGATCA GTCACCTTTC GCGAGTCTGA AAAAGTTCCT CCAAGACATC CCACTATTTT 900
GACACCAAAT TGTAATATTG ACATACTATG CAACAAAGAA ATGCTGAACA AGAACTTTTC 960
ACCCAACAGT TGTTTCATCA CACTTAAATA TAGTAAAAGT GTCTCTTATA ATTTAATTAA 1020
AGCAAACCCA CTGACATTGT GTAGCCTACA GGACTAATTA GCAAACTGCA TTAAAAGTGG 1080
GGTATGCGTT ATTTAAAAAA CATAGCCTAG CGGTTAGTTT TGTCTATATA TTACACAATT 1140
AAAGATGAAA TAACCCAGCA TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ACTGTGAAAG AGCCTTGTTG 1200
TTTGTCTGCA AGTGGATGAG GCATTCTGCA GTGAAAAGTG AAAGTATCCT ACAGTGCTCT 1260
GTCTGAAATA GCCCTCATTT ACAAGAAGAG TTTATAAATA AAAGAGGTTG TGTCTCGCCC 1320
TTGTTATTTC CTTGCTGCTG AATATCCGTT TGCTGTATTC ATACTGAAAC TAAAACTAAG 1380
ATCACAGTTT TAACTGCACT GCTGTTTAAT GTTTTATCCC AGTGTTTCTT TCCAATATAG 1440
CATGAGTTGA AATACAAATC CCTGTGCAAA AATCAAATGT TCATTTTTTT ATTTAGTACC 1500
TACTCATGAA GTGAACATGC ACTGAAAGAA TTTATTGTCA CTATATTTCT ATT 1553