EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01830 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:56233004-56234636 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:56233760-56233771TTAATTAATAT-6.62
CTCFMA0139.1chr1:56233613-56233632CAGCGCCCTCTATTGGTGG-6.23
IRF1MA0050.2chr1:56233355-56233376GGTTGCTTTCAGTTTCACTGT+7.25
PBX1MA0070.1chr1:56233127-56233139TATGATTGATGT-6.11
SIX2MA1119.1chr1:56234112-56234128GTTTCAGGTTTCATCT-6.36
Enhancer Sequence
CCTGCTTTCT GGAACAGCCC CCAGGAAACA CTCTTGAACT TCTTAAATGC ACCACAGAAA 60
CACATTCAGT GTCTTATTTT TACTGCTGAA CAGACACACA GCAAAATACC TTGTGCTGGA 120
TACTATGATT GATGTAAATA TACAGTATAT TGTTGCCTAA TTCTGTTGTC TAATTAGAGA 180
ATTGTCAGTG AAGAAAATCA AATACACACA CACAAATATG AACATTCAAA CATAAACACA 240
AACTATTATG ATCAATCATG CACACATAAG CACACACACA CTCTCTTTCT CTCTCACACA 300
CACACACTCC TGATATCTTT TCCTGTATCA TGTTCCTGTA GACACGGCAT AGGTTGCTTT 360
CAGTTTCACT GTACCAGAAA AACAAAAGCA AACTGGCCCG ACCCGAGGAG ACAGAGGGTG 420
AGTTCCTCAT ATGAACACAA GCATGAAAAC GTTTACAGTT GTATCATAAA ACCAAACTCA 480
CTCACTTTCC TCAGGCTTAA TCTCTTATTC CTGTCTTATT TGATGGCCGT TGACTGTATG 540
AATGTGCTCT CATGCTGGCT CAGTTCTTCA TGGCTAAAAC AGCAGTGTGG GCAAACAATC 600
AGCAGCTCAC AGCGCCCTCT ATTGGTGGAA ACAATCACTA AACGATTGCC CAGTCAAACA 660
ATAACAACAC ATTGCTGTTG GTTTATTTTA CACTTCTGTA AAGTTACAGA ATAGTAGATT 720
TTTTTTTGTA ATTAGCAGTT TATTGAACTA AAAATCTTAA TTAATATTTA GTTTGTTAAT 780
AACATGCATA GTACATTAAA ATAAAGTGTG ACTGAGACGA ATTTTGCTCT TAAGTCTTTT 840
TTAATTGCAT GATTTCAGTG AATCAACCCA TAACCTGATT AATTTTAACA TATCATCAGA 900
ATATAGCTAG CATCAATTTT TTATTATAAT TTATGTGCTT TATTTCATTC ATTTTCTTTT 960
CAGCTTAGTC CCTTTATTTA TCAGGGGTCA CCACAGCGGA ATGAACCATT AACTTGATAA 1020
CCTCATGATA ACCTTTGGTT TGGCCCACCA TCTTATCTGA AAAGAGATGG AGAATTGGTT 1080
GGGGTAAATG GCTTTTACAG AGATCGTCGT TTCAGGTTTC ATCTATACCC TTTTGTTTCT 1140
TTGTTTAATT GAAATGTTTC ATATGAATCA CACTTTTAAA ATGTAATACT GTCACTTGAC 1200
AGATGCACAG AGAGAACAAT TCACAAGACA AATCAAGCAA ATCAAGGCAA AGGCAGGAGC 1260
AGCTCGACTA GTGTATTTCA AGAGTTCACA CTTAGCTGAT GATTGATATT AAAGCTTGTT 1320
TGGCGTGCTG TCCCGGGAGA GAGCCCTGAG CTTGTGAGAT CTGTTTGCAG GGCGAGAGTG 1380
GAGTTTGAGT TCAGGTAGAA CTCAATAAAC TCCCCCCTGC TTATTTTTAG CTAAATGACG 1440
GATATGGATG ACTAAGGAGA GGTGTACTCA CTATGAGCTT GGCTATGGTC TCAATTTTGT 1500
GTGTTCAATT TACTTAGGGT GCATGTTATT TAGACTGTGG GAGGAAACTG GAGAACCTGC 1560
GGAAAACCCA CGAGAACACA TGCACAACTC CGCACAGAAA TGTCATCTGG TTTAGAAGGG 1620
ACTTTAACCA GA 1632