EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01804 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:54456075-54457378 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr1:54456180-54456195AATTAATTATTAAAC+6.21
Lhx3MA0135.1chr1:54456179-54456192AAATTAATTATTA+6.25
RFX1MA0509.2chr1:54456748-54456764TGTTGCTATAGTAACA+6.21
RFX1MA0509.2chr1:54456748-54456764TGTTGCTATAGTAACA-6.21
RFX2MA0600.2chr1:54456748-54456764TGTTGCTATAGTAACA-6.52
RFX2MA0600.2chr1:54456748-54456764TGTTGCTATAGTAACA+6.54
RFX3MA0798.1chr1:54456748-54456764TGTTGCTATAGTAACA-6.35
RFX3MA0798.1chr1:54456748-54456764TGTTGCTATAGTAACA+6.38
RFX5MA0510.2chr1:54456748-54456764TGTTGCTATAGTAACA-6.86
RFX5MA0510.2chr1:54456748-54456764TGTTGCTATAGTAACA+6.92
Enhancer Sequence
CCCAGGTGGC GCTATAGTCG CATTAAAATA CACAGCTCTT CCCAGGATCA TTGAGTCCAT 60
TGGTCAACTA CACATCACAT CCTATTCTTT ATTAAATATC TCAGAAATTA ATTATTAAAC 120
GCTGTGTGAG TTGCATTGTG TGTAGCATAA TCCGCCGTTT TGCTTTATCT CCATAGCTGA 180
TTTCCCCATA TATATCTATG TGATTTCCCT AGCGGTTGAA GAGTATTACC AAACTTTACC 240
TCACAGAAGT GGCTGAAGTT CAATGTCATG GTGTTTGACT CTTCATTTCT TCCAGGTTTG 300
GGAAGTTTTG GCAGCAGACG CTGATCCTGA CCGGCGGTCT GAATGAAGGG GAAATGCTTC 360
ACCCTTATCC GAAAGCACAA ATGCTATTAA TACACCTGCC TGATGACTGC CATAGACAGA 420
TAACGAGACA TCGACAGACA CGGACAAACA CAATGCAGTG ATGCTTTTAT TGCGGTGTTG 480
CTCTCAGAAT TTTTGAGGAT TGAGGTTAAG AGCCGTTTTC CTGTGTTTGT TTGCGACACG 540
CGACGCTCAT TGTTTTGTTT TTCTCCAAAC AAACACACCT ATAAAGCTCA CTGCCTAAAT 600
CAGTCTCGCA GATGTGCTTT ATCTAAACAC TGTTGTCGTT ATTAGTAAAT AACGTAGTGC 660
AAATTAATTA TGTTGTTGCT ATAGTAACAC AATACTATAG TATTATAAAC AAATCAAGCA 720
CATACTGATA CATCTACACT CACCGGCCAC TTTATTAGGT ACACCGGGTT GGACCCCTTT 780
TTCCTTCAGA ACTGCCGTAA TCCTTCACAG CATAGATTCA ACAAGGTACT GGAAATATTC 840
CTCAGAGATT TTGCTCCATA TTGACAAGAT GGCACCACGC GGTTGCATCA GATTTGTCGG 900
GTGCACTTCT ATGATGCCAA TCTCTCGTTC CACCACATTC CAAAGGTGCT CTATTGGATT 960
GAGTTCTGGT GACTGTGAAG GCCATTTGAG TTCAGTGAAC TCATTGTCAT GTTCAAGAAA 1020
CCAGTCTGAG ATGATTCATG CTTAATGATA TGGCGAATTA TCCTGCTGGA AGTAGCCATC 1080
AGAAGACGGG TACACTGTGG TCATGAAGGG ATAGACGTGG GCAGCAACAA TACTCAGGTA 1140
GCCTGTGGCA ATGACACGAT GCTCAGTTGG TACTAATGTC TTTTGCCAAG ACAATATCCC 1200
CCACACCATT ACACCACCAC CAGCCTGAAC AGTTGATACA AGGCAGGATG GATGCATGAT 1260
TTCATGTTGT TGGTGCCAAA TTCTGACCCG ACCATTCGAT TGT 1303