EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01738 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:53183041-53183581 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:53183137-53183154ATTAATTAATTAATACA-6.32
Arid3bMA0601.1chr1:53183135-53183146ATATTAATTAA+6.62
ArxMA0874.1chr1:53183137-53183154ATTAATTAATTAATACA+6.4
FOXB1MA0845.1chr1:53183220-53183231TATGTAAATAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr1:53183502-53183515AACTAATTAATTA-6.22
Lhx3MA0135.1chr1:53183139-53183152TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr1:53183136-53183149TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr1:53183505-53183518TAATTAATTATTG+6.39
ONECUT2MA0756.1chr1:53183370-53183384TATATTGATTATTT-6.02
ONECUT3MA0757.1chr1:53183370-53183384TATATTGATTATTT-6.29
POU6F1MA0628.1chr1:53183137-53183147ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:53183141-53183151ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:53183137-53183147ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:53183141-53183151ATTAATTAAT-6.02
RORAMA0071.1chr1:53183549-53183559TGACCTTGAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr1:53183044-53183056AAAAAAAAAAAA+6.22
mix-aMA0621.1chr1:53183503-53183514ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
CCCAAAAAAA AAAAAGAAAA ACAGTAATTA AACATTGTAT TGTATTTGTA TTGTAAGGAC 60
ACCTTTTTGG TTTATATATT AATATATGTT ATTTATATTA ATTAATTAAT ACAAATTAAC 120
ACTAAAGTAG CCTATTATTA TAGTATTTTT ATAGTCGGAT TGAATTATTG TTTGTTTGAT 180
ATGTAAATAA TACATTTTAA ACGATTCTTA AGTATTAATA ATGGTGTTAA TAATAAAAAC 240
CAGCAAAAAT TATAATAATT AAATATTGTA TTGTATTTGT ATTGTAAGGA TACCTTTTCG 300
ATTTATATAT CAATATTCTG TACGTTATTT ATATTGATTA TTTAATACAA ATTAATACAA 360
AAGTAGCCTA TTAATATAGT ATTTTTTATA GTCAGATATT ACATTTAAAC GATTCTTAAG 420
TGTTAATAAA GATGTAATAA TAAAAACCAG CAAGAAAAAA TAACTAATTA ATTATTGTAT 480
TGTGTTGATA TTGTAAAGCT TATATACTTG ACCTTGATTT ACTGATTTTC AGTCACAACG 540