EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01724 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:52906993-52908204 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr1:52907610-52907623ATGTTTATTTAAG-6.14
FOXE1MA1487.1chr1:52907609-52907624AATGTTTATTTAAGC-6.63
POU4F1MA0790.1chr1:52907423-52907437TATTAATAATTCAA-6.13
POU4F3MA0791.1chr1:52907421-52907437ATTATTAATAATTCAA-6.24
RFX1MA0509.2chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT-6.02
RFX1MA0509.2chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT+6.03
RFX2MA0600.2chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT+6.37
RFX2MA0600.2chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT-6.43
RFX3MA0798.1chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT+6.09
RFX3MA0798.1chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT-6.42
RFX4MA0799.1chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT-6.12
RFX5MA0510.2chr1:52907198-52907214TGTTAGCATGGCAACT-6.01
RFX5MA0510.2chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT-6.36
RFX5MA0510.2chr1:52908074-52908090TGTTTCCATAGCAACT+6.38
Enhancer Sequence
TGAGTACTTT ACTATAGTAT AGTTCTAAAG CACTACAGTA TTTACTATTA ACTACAACAG 60
TATTTTTAGC TCTTGTGAAC TAATAGTGTA ATAAATACTG TTGTATACTT AAATTTTTAC 120
TATAGTAAAC TGTGGTGTGT TGTAATATTA CATACACCCA TGGAAAACTA CAGTATTGTG 180
TTATATGTTA TTGTAACTAT AGTTGTGTTA GCATGGCAAC TGTAGATTCA CCACAACAGG 240
TTGAATACTT TACTATAGCA AAGTTCTAAA GCATTACAGT ATTTTTAACT CTTCTAAACT 300
AATAAAGCGT AATAAATACT GTTGTATACT TTAGTGTATA CTACACTCTA AAAAACATTT 360
ATTTAACCCA ATGGTTAAGT AAAAAATATT TGATACTTTG TTGGGTTATT TTTTACCTTT 420
ATTGGGTTAT TATTAATAAT TCAACCAGTT AAATTAAATA TTTGGTGCTT TGTTGGGTTA 480
TTTTTAACCT TTATTGGGTT ATTTATTTAA TAACTCAACC AGTTGAGTTA AAAATGTAGA 540
ATTTCTACAG TCAACTGATT TAACGGACGC AGAACAGCTG TATTAATATG CGTACGTAAT 600
GTTGTTTTTG CGTTATAATG TTTATTTAAG CTCTAACATA ATAATATTGC AAGTTTTTTT 660
TTCATCAAAT ATCTCTCCGT GTCGTGTTTT TCTATCCGTT TCTCCAGCAC TCTTAAATAT 720
TGATGATACA AACGTGCCCT TGGTAGCCAA TATGGATAAA ACGCTGTGTC TGGTGGAAAT 780
AAAGCATTTT TTTATATTTT TGTAACCTGT ATGTTATTTA TTTACAGAGC CGTATTTATA 840
AAATTAATAG ATGTTGTAGT AATAGTAGCA ATAGTAATAC CAGAATGAAA AAATAACATT 900
TATTAAAATA ACCCATAGTT GGGAAGGTGC TTTAGTAACC TATATTTGGG TTATATGTTG 960
GGGTATTTTT AACCCAACTA TTTTAACTGA GTATAGTAAA CTGTAGTGTG TTGTAATACA 1020
ACATACCCTA TGGAATAAAA CTACAGTATT GCGTGATTTG TTAATGTTAC TATAGTTGTT 1080
GTGTTTCCAT AGCAACTGAA GAATCACCAC AACAGATTGA GTACTTTATT ACATGGTTCT 1140
AGAGCACTAT TTACTATTAA TTACTCCTGT ATTTTTTTTT AGCTTTTGTG AACTAATATA 1200
GTGCAATAAA T 1211