EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01601 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:50884119-50885612 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:50885351-50885372CTCTCCTTTCACTTTCCTGTT+6.74
IRF2MA0051.1chr1:50885350-50885368TCTCTCCTTTCACTTTCC-6.51
Lhx3MA0135.1chr1:50884845-50884858AAATTAATTATTC+7.34
POU4F1MA0790.1chr1:50884846-50884860AATTAATTATTCAC-6.98
POU4F2MA0683.1chr1:50884844-50884860CAAATTAATTATTCAC-7.05
POU4F3MA0791.1chr1:50884844-50884860CAAATTAATTATTCAC-6.95
RFX3MA0798.1chr1:50884489-50884505CGTTTCCTTGGTAACA-6.08
RFX5MA0510.2chr1:50884489-50884505CGTTTCCTTGGTAACA+6.12
Enhancer Sequence
GGCTCCTTAC CACAGAAATA TTAGTCTGCT GTAGTGAACA GTATGTGCAG TGCAGTGTAA 60
TCTAACAGGG TAAAGTAGGC GGTGTTTATC GCCTCCTGTT GGACATGAGA GGTACTTTAT 120
CTCCTGTGCA CGTCCCGTCC GCGATAGGGT TGCTAAGTCT GCGGTTTTCA CGCGTAATTT 180
GACTACTTTT AACCACTTGC CGCATGTTTT TTTATTCCGC GAGGTAAAGC TTGACATTTT 240
GCATTACATA TGTATATGAT GAAATATTCT GCTCTACCAA TGATACAAAC TAATAAGCGT 300
AAAAAGAGTA AGAACACCTT TGTGTTTGTG AGGTCTTTCT TTGAGGAGGA AATGTTTGTG 360
AAGCTGTTTT CGTTTCCTTG GTAACAGCCA TATAAAACCA TGGAAACGAC AACAGACGCA 420
CACACTCCAA GATTAATGCT AATAATAAAT AAAATCAAAT GTTGGTATAT GTCATCTGCA 480
GAAGATTTTA AAACTTCTTT AACTTAAGAA GTCCACTGTA TTCACTTCAG TCGCCGGAGT 540
GTTCTGCATT TGCCAGCATC CATTACGTTT TAATTGAGTG TTTGGCAAAT GTAAGTCACA 600
TGAGAGCACA ATGCTAGCTG GGCTATCAGT CCCATGTTGC TGAGACTTTT ATTTATAGAA 660
ACAAATGGTC AGACTTTCAT TGAAGATTAC CAAAACAGTG GATTTTGTGA GTGGATAAAC 720
TTCCACAAAT TAATTATTCA CTTAAAGAAT AACAATGTGA GCTCGCAAAA TAACCATTAA 780
ACTTACATTT CAAGCGGACT TTAAGGTAGG ATGACTTTTT TATAAACATA TTAAAGTTGC 840
TAAATTCGCA CATTTCACAT AACTATATGC ATTATACATG ATTTCTCCTG TCAAAATCAC 900
TGTATGATGC AAACAGTTAT GTGAAATGTG CCAGTTTTGG TATTATTGTA CTGGTTTTAA 960
TTGGCCAACG CGCTAATTTT GTCGAATACC TGGCAACCCT GGATCCGCCT CCCCTGGTTA 1020
ACACTTCATC AGCTGCTGCG GTGAAGTCTA GTTCAGTCTA AACAAACTTA AACGTCCATT 1080
CTCACCAGAT AATCAACTAT TTATTAGATT TTTTATGAAT ATATCTCTAT ATAAAAGAAA 1140
TAGCGAGGGA AAGCGCCTCG CGAAGAAAGC ATTGGGCTGA GGATGGTCAG TCAGTGTGAT 1200
GAATTAAAGC GTCTGTGTCC GATTCTAATG CTCTCTCCTT TCACTTTCCT GTTTAAACTC 1260
ACGACCAAAA CAATCATCTC AGCAGAGGAG AATCTTGAAG CGGATCCAAA ACCCTGTTTA 1320
CAGTTCTGGC AAACTGTTTT ACGCTGACAT ATTTGACTCT GAAGCAGCTT TCCTGTTTGC 1380
ATTACGAGTG TATGTTTCAG ATCAGTTATT TGGGAAGGTT ATAAAGTTCC TGCAGAACTT 1440
CAGCTGTGCC GAGGTGAGCT TTAGCACGGA AATGAAGGAT ACAGTATATT TTG 1493