EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01587 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:50753820-50755212 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:50754980-50754991ATATTAATTAA+6.62
BARX2MA1471.1chr1:50754691-50754703GTAATTGTTTTT-6.11
FOXB1MA0845.1chr1:50754757-50754768ATATTTACATT-6.32
IRF1MA0050.2chr1:50754424-50754445AGTATAAAAGTGAAAGTGAAA-7.17
IRF1MA0050.2chr1:50754430-50754451AAAGTGAAAGTGAAACTGTGC-8.34
IRF2MA0051.1chr1:50754428-50754446TAAAAGTGAAAGTGAAAC+6.32
IRF3MA1418.1chr1:50754427-50754448ATAAAAGTGAAAGTGAAACTG+6.39
Lhx3MA0135.1chr1:50754981-50754994TATTAATTAATTT-6.37
POU6F1MA0628.1chr1:50754982-50754992ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:50754982-50754992ATTAATTAAT-6.02
PRDM1MA0508.2chr1:50754433-50754443GTGAAAGTGA-6.02
Enhancer Sequence
AGCAGCTCTA TTCCTCAGAT AAACCCCAGT CCAGGCATCA CTGAGGCCCA CAGGCGGGCG 60
CCGGCCAGAT GTCCTTCAGC CAGTCCTGAC CCGCAGGTAG ATGCTCTGCA TCGGAAGGTA 120
GTGTCCTGTT TTGGGGATCA CCCCTCCGCT CCTTTTGGCG TCCACCAACT GGTAGAGCTG 180
GGAAAGGAGT CTGGAAAGAG GGCAGGAGAC TGGTATGGCC CGTCTGTAGT AGCACACATG 240
CTGAGGTGAG AAAGAAAAAA TTCCAATTTA ATCATAGCAA ATAAATATTG TACACTCTTA 300
TCATGCATCT CAGACAATTT CCCTGAATAC CTGAACTGAA CAGTTGATTT CCTGCTGTCT 360
TAGATTTTTT TCTTCTTCTT CTTCTTCTTT CAGAAAAGCT GTGGCGCGAG CTGCTGAGTT 420
TGAGGATCTT GCTGTGTATG TGGCGCAGGA CTGCACTGGT GAGTCTGTAG ATTGTTCATC 480
ACATGAGCAG ATTAAAAACA GAGAATCTGT AGCCCATGTT AATTCTTATT GTGCTGTAAA 540
ATGCAATGGT GCTACTGAGG TCAAAAAATT GTGCATGTTG GATGATGGGT TCATAAAAGT 600
TAAAAGTATA AAAGTGAAAG TGAAACTGTG CCCTGCGCAT GCGTGTGAGT AAAGTTCTGC 660
TTCTGCTGCA GTATATAAAG AAGATGTCAT GAGTTTGTGT GAGTCCAGCG GTGTGGGGTG 720
GAAATCAGTC GTCATTCTAG TGCCAGTGCG ACTTGGGGGA GAGTCACTAA ACCCTTCATA 780
CATTGAGTGT GTCAAGGTAC GTCTACTGGT CATGCAGAAA TTCAACAATT AAAAATAAAC 840
CACTTTCGGC ATAAATAGAT TTTTATTTTA TGTAATTGTT TTTGGACAAA TGTGGTTTAT 900
TATTACTAAA ATACTATATT ACTATAGAAA AATTATTATA TTTACATTTG TCTTAAATTT 960
GAAGAATCTT TTCTTTAAGT TAAAATGCTG TAATGTATGC TTTTTAATAA TAGAATAAAT 1020
GTGATGTAGT ATTGCATTGG AATAATATAA GTTTTGTGAT GTCTTACATT TAATGTGTGT 1080
AATTGTTATA TTCTATTACA TAATGTTTTT TAAACATCTT GAATAATGGG CCTAAAATAC 1140
CAATATTTTT ACTATATTTT ATATTAATTA ATTTTATTCA TTTATTCATC CATTTATTTA 1200
ACAATTTTTA TATCCAATTA TTCATCTTTT TTTTGTTGTT GTTGTTATTT TATGTTATTT 1260
GTATTTTTAT TAGAGTATTT TAGTATTGCA AAGGAATGTA ATTCTATTTA TTTTCTTGAA 1320
TTAATAATAT AGGCATTTGA CATCCAGTGT AGTTATATTG ATAAACAGTT TTATTATATT 1380
ATTATTATTT AT 1392