EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01350 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:45022960-45025041 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:45023547-45023558ATATTAATTAA+6.62
CDX1MA0878.2chr1:45024044-45024055GTTTTATGACC-6.02
CDX4MA1473.1chr1:45024044-45024055GTTTTATGACC-6.02
Lhx3MA0135.1chr1:45023381-45023394AAATAATTAATTC-6.22
Lhx3MA0135.1chr1:45023548-45023561TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr1:45023399-45023412GAATTAATTATTC+6.46
PBX2MA1113.1chr1:45023272-45023284GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr1:45023270-45023287AAGTGATTGACAGGTGG+6.14
POU4F1MA0790.1chr1:45023408-45023422ATTCATAATTAATT+6.33
POU4F1MA0790.1chr1:45023400-45023414AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr1:45023398-45023414TGAATTAATTATTCAT-6.76
POU4F3MA0791.1chr1:45023408-45023424ATTCATAATTAATTCA+6.33
POU4F3MA0791.1chr1:45023398-45023414TGAATTAATTATTCAT-7.26
POU6F1MA0628.1chr1:45023549-45023559ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:45023549-45023559ATTAATTAAT-6.02
mix-aMA0621.1chr1:45023552-45023563AATTAATTAGG+6.32
Enhancer Sequence
ATGCTTTCGA AAATCATGAT CGCAATATAT ATGTTCATGC CTAATATCCG ATGGCCAGAA 60
AGTGATTAAT TTTTTTATAC ATTGTTAAAT TTTTGGTATT TGTTATGCAG CAAGCCCAGA 120
GATTGTTGTG TACACTATGA TTTTATATAA AATTAACTTT AATGTGTGAT AGGAATAAAA 180
CATGATCATA AACGAATGGT TTCTCCACTC AAATGAATGT CGACTTGGAC CCGGAAACAG 240
TATTACATAC GTCAAAAACA CGTCACCACT TAACAAGCGG ATTAACGCCT ATTCACGAGT 300
CCCACGGGAA AAGTGATTGA CAGGTGGTAA TTGTGTGTAA CTTATCTTTA TTTATTTACT 360
GTATGATTTA TGGGTAAAAA AAAAAGACCT TGCAGGTCAG GTAGTTAAAA CGGTAGGCTA 420
CAAATAATTA ATTCGTGATG AATTAATTAT TCATAATTAA TTCACTGTCG CCTATGACGA 480
CGATGCCATC ATCCATCATG ATGTTGTGGT GTTAGACATT GCACAATGCC AAATTGGTCT 540
ACATCGCCCA ACCCTAGTTT AAATCAGGGT TTTCTAGTTA TTTTTAAATA TTAATTAATT 600
AGGATGTATC CATGGTAGCT ATATTTACCT CTGGCACTCT AGCCTCAATC TAGTTTGGTT 660
TTTGGCCCTT CATAAGAAAA AGTTTGGGCA CCCCTGCTTA AGAAACCTTG GCCAAGACAA 720
CAGTCACAGA TTGTACCGTT TAACAGGTTT TTAGATGTGT GGTTGGCTCC GGCTTAGCCG 780
TGACCTTACT GTGGGGTGGT CAATTTGGAC AAGCAGATGC CCAGCAAGGA AGACGCCCCA 840
ATTTTTCTAT AGCGGATTAA TCAAATAAAC CAAGATAATC GGTGGCCTTA TGCACCAGTA 900
TACTGCGTTA TATCATGGTT CAGAATAAAC GAGTTACAGT AATGTGAATG AAGTTTTGGT 960
GCACTTTTGT AATGCCTTGC TGAGTTTTTG CCTTCAGGGT AAATTATTTG CTGCTTTATT 1020
TCAGTTTTGC ATTTGGAAAG AATGTTTTAA AATGACCCTT TATTATGCTG AAACCACTCT 1080
GGTGGTTTTA TGACCCCCCC CCAATCTGCT AAAACACTGG CGCTGACATA AGAGCTTTTA 1140
ACTGTCAGCA AACTAGTGCT AGATATCTTG GCAGAGAGTT TGTTTGTCTG TGTTTTTTAG 1200
ATGGAACTGA TGTCCTGTTT TAATCCTCCT GGGCTTCATC TCTATCCATC ACCGCGTCCT 1260
GCTGCGTGTC CAGTATGCAA ACTACACCCA AACCATCACA GCACTATTCA CCATCTGTTC 1320
TTTATTTCCT ACTTCCTCTC AAATGTCCGT CCCTCTCCTT ATCGTCATCT TTGATTCTAA 1380
TCTATTTTTG TTTGTGTCTG TTTTGGGCAC ACGCTTGCAG CTTTCACTTT TCTCCATTTA 1440
CTACGTTTGC TGTTGATTTC ACTTGTCTCT CTGATATCTC TCATGTTGTT TTGGCAGCTC 1500
TGGTTGTGCC CAGCCCCCGT CAGCATGGTG CACAGCACAC AATGGGGAAC GTCCTCTCTT 1560
AATCCTTACA TTTACGAATA GCAAATTCAA ACCCTGCTGG GTCATTAAGC CCCATTCACA 1620
CTCTATACTG ACTCAACACA CTCAACTCGC TCGTCTGGAG CTAATTCTGT TGGACGAGAG 1680
GGAGAGCAGG GTCGTCGCGT TTCTTCCTGT TTATCTGCGT CGTTGCTACT GTTTCACACT 1740
AACAGGGCTG TTTGACATTT CAGCTCGATC CTACACACAA TAATGGCTCA TTACTGATCC 1800
CTACGCGCAC TGGTACCATT CACCATTGCA AATTACACTA ACAATAGTGA TCGGTTTCTT 1860
TAAGACCGTT CAAACCTGAT TTTCAGTTGT TTCCGCCAGT TTGATCACAA TTGAGCAGTG 1920
CTAAATAAAG GGGTAAACAG GGTCTAAAAT GTTTAATGCT TGTTTTCCTT TGAGCCCTTC 1980
CAGACGTTTC CTTCAGCTTT CCATCGCGCA TTGCGCTCCT TTGTCATTGC TCAGTGACCA 2040
TCAACCGTTT TCTCAGAGGA TGATAAATTA AAAAAACATT G 2081