EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01122 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:38677320-38678510 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:38677674-38677685GACCAATCAGA+6.14
NR4A1MA1112.2chr1:38678428-38678438GTGACCTTTA-6.02
SIX2MA1119.1chr1:38677999-38678015ATCTCAGGTTTCAGTC-7.23
Enhancer Sequence
CACGGAGGTG GAGAGGCCAA GACGAGGGAT TCGTCTTTCT AATGGCTGTG ATGAAATTTT 60
TTGCCACTGT AATTTATGTG TGTTTCAACA TAACTTTATG AGCACTTACT TTTGGAATGC 120
ACTAACCCCC TTTTCCCATT AGTTTCAGCT TTACAGGAAG GCCCATTCAA TATTGCTTTA 180
AATACCATAT GAAAACCACC AAATTATAGA ATTATATTTT CCCCTAAGTG AGGAAGTAAA 240
AGGGGTTGTC ATATATAATT CATGCTGAAA GATTTCTGTA AAAAAGGCGT TTGAATTAAT 300
GTGAAGGTTC ACTGCTTGCA CTGCGCGCTC CAGAACATGG CAGGTAGAAT CTCCGACCAA 360
TCAGATTCGT TGCTGTTCCA TAGGAGAGAG ATAGCAGGAG GGGGTGAGAG ACACATGAAA 420
GACGTAATGA AGGTTAGTGA AATGGAGAGC AATACATCTT GCACATTGAG CTCGCTACTT 480
GTTAAAGCGA CAGGGCCTAA CCAGAAAGGA ATTTGCTTGA TGGATGAATT TTACCCGTCT 540
AATGGATACA AGCACTTGAA AAATGAAAAC ATCGATCCAT TGCCCAAGTT TTTCCATCCC 600
TCTAATGAGA ATGGGTGTTG CGAAAGATTT TGAGAGGGTA GCAGGGACAG TCTTTTGCCC 660
GATGATTCGG AGCACATGTA TCTCAGGTTT CAGTCACAGC TGAACTGCCG CTCGCTCTAT 720
TGTATATATT ACAGGAGAAA GAGAGGACGC TCGATTTGTC TCTCTATTGA TGTGCAAATT 780
CAGAATGGGT TAGATATTTC CTCTGTCATT TTCGCCTGAG TGTTCTTTGA ACCCCGTTAG 840
CCCCCATTGA AGCCGAACAA AAAATATGTT TTTCTGCTTG TTGCTTTGGA CACAACAGTG 900
TACTTGTATT TGCAAACCTG TAGAAATGCC CCTGTTGCTT TCAGATTTGT AGAAAAGTTA 960
GAATTTGTGT TTTTGTTGTC ACTAAATCTG TGAACTAGTG GGGTTGCAAT CCAGAAATGA 1020
CCCGCAGGTC TGTTTCAGAA GAGACTTTGA TAGTAAAAAA AAGGAAACAA GTAAGTATAT 1080
AAATAGTAAA CCTGTGAAAT CAAAGGCAGT GACCTTTAAA GTAATTACCT TAGTAAAGGA 1140
ATTAAGCAAT TAAAGTGTAC AAATGGATTT GACGAAAGAA AAGGCTAGTT 1190