EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-01021 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:35417869-35420796 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CUX1MA0754.1chr1:35418903-35418913TTATCGATTA-6.02
CUX2MA0755.1chr1:35418903-35418913TTATCGATTA-6.02
DMRTA2MA1478.1chr1:35420145-35420157ACTGTAACAATT-6.18
FOXK2MA1103.1chr1:35417916-35417927ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr1:35417916-35417927ATGTAAACAAA+6.14
HLFMA0043.2chr1:35420310-35420322TGTTATGTAATG-6.32
Hmx1MA0896.1chr1:35420127-35420144CCAAGCAATTAAATAAT+6.9
Hmx2MA0897.1chr1:35420127-35420144CCAAGCAATTAAATAAT+7.73
Hmx3MA0898.1chr1:35420127-35420144CCAAGCAATTAAATAAT+8.25
ONECUT2MA0756.1chr1:35418902-35418916TTTATCGATTATCT-6.12
YY1MA0095.2chr1:35418965-35418977CAACATGGCTGC+6.14
ZNF384MA1125.1chr1:35419600-35419612TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr1:35420014-35420026AATAAAAAAAAA+6.62
ZNF384MA1125.1chr1:35419601-35419613TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
GAAGAACTCT TTAAACTGAG CACAAACCAC CGTGACAAGG TAAGTGGATG TAAACAAACG 60
TGTTATGGAG CACACATTCC ACAGTGTAAA GCAGCTAAAA TACAAACAGG GGACTCCAGA 120
GAGCAGCAAA CTCTCAAAAG ATAACATCCC TGACTTTCAA AAAAGTCTCA AAAGGCGCCG 180
TTTCGCCGAC ACGCATGAAG ATGCATTACG AGCGCTCGCT TTCGTGCACT TAAAGCGCCA 240
CAGAGCCACA TTTCGCCAAT TCCTCTGATC AATGTTTTCC ACACTGTACA GATCACGTCC 300
CCTCTAGCGG CCGGCACACG CAACTGCAGC CGTTATTAGC GAGCTGATAA AAGCACAATG 360
TTAACATCCA GCTACACAGG GTCAAATGAA CAAATATCGC GATTAGTAAT TCCAAGCGCA 420
ACGCGCGCAA CGCAGCGGCT GCCGCAAGGT ACGAGTCGAA CGCGCTTCGA CGCGAGAGAA 480
AAACGCGTTT CGCCTTTGTG CGTTATTGAT CGCAGATTGT CTGCAATGAA TGGCTGCATG 540
AGGAAGGAAA AAACCCTGAA CTTCAGGTGA CCGACCATGG CTTTGACACA GGCAGCCTGC 600
AGACACGAAC CCCACTGAAC TGGGAGGGGT GGAAGAAAAT ACCTCAGCTT AAAAAAATCC 660
CGCTCGACAA ACGAAAGAAA GAAAGAAGGA AAAAAAAGTC GCGGACAAAC ACACACTTTC 720
ACATACGACC GCGGAAGGCG GAAAGTTGGT CGAACGTGTT TCGGGTGCAT TTTTAAGTTG 780
CGGGCTGCTG CTAGATAGCG CCGGAGCTAA GTAAAGGCAG GGGCACGGAT GGAAGGCTGA 840
GTCTGGCTCT CAGTCTGATC CGACTGACCC TTCATTTTAT TGCGGCCAGA TCCTCAGATC 900
CTCCCCTTTC CCTTCCGCGC GACTCTGCCT CGCTCGCACG GACACATATA AGAAAAGACG 960
CGCGGCCATA AGCGCCAAAT AAGCGGCGAT AACGCGAGCT TTACTGGCCG CAACCTTTAG 1020
GCGGAACGGG ACCTTTATCG ATTATCTGCA ATTAAAGGCA CCGCTAGTGC GCTCGCTCCG 1080
CTAGCCCCCT CATCGCCAAC ATGGCTGCCT AGCACAGACC TAAAAAAGGA GAAATAACCT 1140
CCGCCGTGCC TTTGTCTGTT TCACCTCTTT AACCCTAAAC TACTGCGCAA AACACACAGA 1200
GACGCGCTAA AATCGCGCGG AACGAGAAAA CGACTTACGT GAAGGCAGGC GCTTGGGTTG 1260
CTCCTGTTTC CTCCTTGGCA TTTTCCCCCT TTTATCACAT TCTCCTTCTT GTTTAGGGAT 1320
ATGAAGAAAA AAGGTCTTTT CCCATTGAAA TTTTGCGAGG GAGCCTGATG GCAGGGACTT 1380
GTCGTGCACC TGGCTGTCCT CGGTTAAGTG TATTGTTGGG AACAGGGAAG AGTAGAGGAG 1440
GAGGTGCTGT TGTTGTTGCC GTGTCTTGAC TATGGCTGCT CTCTGTAAGT GTGTGTCTCC 1500
GAGCCCCTAA CTAACACTAA TGCAGGGATC AAAGGGCAGC AACAGCAGAG CACACACACA 1560
CACACACATG CACACACACG CACGCACGCA CACACACACT CACACGCACA CGCTCTCACA 1620
CACACACACT CGCTCACTCA CTCACAGAGA GAGGAGCTCG CCCGACAGAG AGACGAGAAA 1680
GGGACAAGGT GCCCCCAAGC TTTCAGGGTG TACTTGACTG ACCACGAAGG ATTTTTTTTT 1740
TATTCGTTTA TAAAATGGAT TCTGACTGAT GAATATTAAA CGGGGTGGGG GAAAATCTTC 1800
ACGTAACATA CGCTCTTTAT CAACGTGATG TAATGATTTA CACGTAAAAT CAGATTTAAA 1860
ATGACGTATA ATATTTTACG TTTATCATTT TTTTTGGATT CTACAAATGT AAAACTGAAT 1920
TTACTGTAAT ACTTTTTGCT TGTTGACATG AACTAACAGT GAAAAATACT TTTATAACGC 1980
GGCTGTTCAT ATTTTAACTT CAGCATTTAT TAATATGTTA TTACAATCCA AGAGTTTATC 2040
AATGAATGTA GTATTTGACT ATGCAAGTGG CCATTGCTAA TACTAATTCA TGCATTTCAT 2100
GATTAAAATC AACTAGTAAC GAGACATTAT TGTAAAGAGT TGTCAAATAA AAAAAAATAA 2160
CTGTATTTTA TCACTTTTTG TTATTTTTAT TGTATCTCAC AGCTTTCTTA TGACAACAAC 2220
AACGAAGATG ATGATTATTG TAATAAAAAA TTAAATCACC AAGCAATTAA ATAATGACTG 2280
TAACAATTCT TCTATTCATT GTTAATGTGT TAAGTAATGG GATTTTATCG TAAAGTGTTA 2340
CAAAATTAGT TTATTACAAT TTTAAAAATA AGTTTTGTTA ACTAAATACT TATAATTTTA 2400
AAATAATATG ATTTGATAAA AAATATAAAT GTTACAGTTA ATGTTATGTA ATGCACAATA 2460
ATAATTATAA ATATATTAAG TATAACAATT TTAAACTTAT ATTTATACTT TTTAACTTGT 2520
TGAATTTATT ATATTATATT ATTTTATTTT ATATTATATT ATATTACATT ATATTATATT 2580
ATATTATATT ATATTATATT ATATTATATT ATATTATATT ATATTATATT ATTTTATATT 2640
ATATCAGCCC TTCCAGCCGC AACCCAACAC TGGGAAAATC CAGACACTTT CATTCACACA 2700
CATACACTAC AGCCTATTTA CCTTATTCAA TTCACCTATA GTGCATGTAT TTGGACTTGT 2760
GAGGGAAATC TGAGAACCTG GAGGAAACCC ACGCCAATAC ATGCGCATGC AAACTCCACA 2820
CAGAAATGCC AACTGACCCA GTCTAGGCTC GAACTAGTGA CCTCCTTGCC ATGAGGCGAT 2880
CGTGCTACCC ACTGCACCAC CATGATGCCC TATATTATAT AAATATT 2927