EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-00849 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:28854483-28855609 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr1:28855473-28855484GTTTTATGACC-6.02
CDX4MA1473.1chr1:28855473-28855484GTTTTATGACC-6.02
IKZF1MA1508.1chr1:28854820-28854832GAAACAGGAAGT+7.22
Enhancer Sequence
GTTTTAGAGT GTATGCGTTT GGTTACATGC ATAATATTTA AGACATATTT TAGATGCAAA 60
CAGCTGCGTA AAACTTGTAG ACATACCCAC TGTATCCACT ATTTTGCAGC TTTAAAGTCA 120
ATCACAGAAA TCAAGATCTT ACCTTTGCAT GTGTTCTGTG TTTCAGATGG AGTGCTTTGT 180
AAAAGACAGA GACTTAAGAG GGTCACACAT CTCCAGAAAA TCTCCATCTG ATGGATTCTA 240
AGTGCTCACA CAATGCTGGT GAAAATGGCA AATCCACTGC TTTTCGTTAT GTCACTGTTT 300
TGTATGGCAA ATGTAGACTT CAGCGAAACA CATGATAGAA ACAGGAAGTT TCCATTCTCT 360
CCCTGCAACC TTTGTGGTTG ATGTTATTTG CAAGTTTCAT AAAGCACGTT TAGTTCAGGG 420
TGTCCTACAT AGCATTATAC AGCAGCTGGT GTTTCCTCAG TGAGGGGAGG TAAAGGAGAC 480
CCTGCAGGGG GTTTCTTGTT TGTTTGAGGA AATGACAGGG AGCTATTTAG GGTTAAACTA 540
GGTTGGTTCT TTAGAGTTAC AGTGATATGT ATCACATGAA CGAGAGATAA AGGAAAAAAA 600
TAGTGAGCAC CTGCGAGGAC TCACTACAGA AAATTACACA TTCTTCATCT GAAAAATAAA 660
ATCTTGCATG CATTTCTTTA AAAATAAGCA GTTTTTACTG AACAGAGTGA CACATTCTAA 720
AATGGGTTAA AAAAATGTAA GTTAGTACGA TTTCAAGTTT CCTGTTTTCA ATCTAAAGCT 780
GAGTGCACGT CAGCAGTGCA CTTTATGATC TCTATGGCAA CCAAATCAAA TAACAGAAAC 840
TGTCTTCAAC CCACAATGCT GATGATGAGC TGTTTTTATA GTACTTTTCC CTCGATGGAA 900
AGAAAGAGTC TGATCAGTCA AGGTTCCTCT CATATAATGA GAAGCATGCA AATAATGAGG 960
TTTTTGGTCT TTTTTGTAAT ACTGGACCTA GTTTTATGAC CCATACATAC ACTTTAAATC 1020
CAGCTCCTGT GTGAACCACG CTCATGTGAT AAAATGAAAA TATGTTTACA GAACTTCCCA 1080
TGGGCAAGTA ATGCTTCCAA ACAGAAAAAG CTGAACCATC AGAATA 1126