EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-00790 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:25673204-25676461 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:25674355-25674371TACTAAATAAACAAAC+6.08
FOXC2MA0846.1chr1:25674358-25674370TAAATAAACAAA+6.18
FOXE1MA1487.1chr1:25674355-25674370TACTAAATAAACAAA+6.83
POU1F1MA0784.1chr1:25674320-25674334AATATGCAAATAAG+6.92
POU2F1MA0785.1chr1:25674320-25674332AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr1:25674321-25674334ATATGCAAATAAG-6.57
POU3F3MA0788.1chr1:25674320-25674333AATATGCAAATAA+6.04
POU5F1MA1115.1chr1:25674321-25674332ATATGCAAATA+6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr1:25675225-25675242AGGTCATACAAAGGCCA+7.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr1:25675225-25675242AGGTCATACAAAGGCCA+7.27
ZNF384MA1125.1chr1:25673294-25673306TTTTTTTTTATC-6.02
ZNF384MA1125.1chr1:25674961-25674973TATCAAAAAAAA+6.14
ZNF384MA1125.1chr1:25674398-25674410AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:25675088-25675100TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:25674397-25674409TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr1:25675089-25675101TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
TCAGACGTGT AATAATAATG TAATGATATT CTACCGTGTA ATCATAATTT GTGCGAAAAG 60
GGGAAAAGAT ATGCCATTTT ACTGTCTCTG TTTTTTTTTA TCAGCTGGAA AATGCCATGA 120
ACTGCATTTA TGTTTGTGTT ATGTTTTAGT TTTACTAAAA TGTTGCCATG GGCAAATAAT 180
ATATTTCAGC TTTGCTTTGT AGCTTTAAGG GCAATTAAAG GCCTCAACCT CTAAAATGGA 240
AGATCTGGAA GATGAGATTT GGTAGTATGT GATGGTAGTG AATAAAACTC TGTCACATAC 300
CTATAAAAAA GATTCGATCA CAACAGAATC AATGTGCTCA GCACATGCGT TCACTCTTTC 360
ACATTTTCTC TCTCTGTGTC AGTCAGTCAT GCTCGGTTAA TGTTTAGGGC AGATGGCTAT 420
GCAGAACCAA TATAATGATC ACCATGGCTA CCACACTCTC TGAAAAAAAA TTTTGCTTTG 480
CGCTGAGCAC AGTTCATCAA ATTAGCCAGA TATATTGACT GGTGCAGACA CAAAGACATG 540
GAGTTGAAGC AGCGGGAATA AGAGGAGAAA GAAAGAAGCT GGGAGAAATG TATAATGGAG 600
GTATTTTGAA AGTTAATTTT GGGAAAAGCA GGGTGTTGTA TGGCATAATG TGCTCAATTA 660
CACGTGAATC ACACTGTAGT AATCTCTGCC TGCATTTACT GTGCCTCCTG TCAGTGTTTG 720
CATCTGAACC AAAAGGGTCA GTAGGTTCAC ACCGGTACAG CTAGACTTCT ACTGTCAGTT 780
ACAACCTATG CTGGGTTAAT TATCAAACAC TCTTAAACCA CAACAGGGAA GGAAAGATAA 840
CCAAATAGAG TACTACAGCT CAATCCTTTG TTTATCAGCT CCTAGTTGAG CATGCGCCTA 900
GCCAGAATTT AAGTTGGGAC TGACTAACAC CAGCACAAAC AATCTTCCAA AACATTCAAT 960
TCTATCTGTT AACCCTTGTT TTAGCAATAA CTAAACTATT GTAACAAAAA AAGAAGACTC 1020
ATATTTTGAT TTGCCGTATG GACGTTCGTT AGAAGTGAAA TTTAGAAATA CCTTGGCAGC 1080
AATAGATGAA CATCCAGACA CAGTGATGAT TAGATGAATA TGCAAATAAG TGCTGCACTC 1140
TTTCCACTAA TTACTAAATA AACAAACAAG AAAATGAATA AGGAACACAG CCGTAAAAAA 1200
AAAAAATAAA TAAATAAAAA AACATTTGAT CATAATAATA TGAACAAGAT TTGCACTTGT 1260
TTTGACAGGT AATCAAATTT ATACTATTAA GACAGTTTGA TAATAAAATG TGTTAAAATG 1320
CAGACTTTGC TTATACACAG ATCTGGCTAT AGTTTAAATA ACTCCTTTTC TTTGCATGAA 1380
ACATTGCAAT AAAGAGCTGC TGCATTACTT TAACAATGCA TAAGCATTTC ATGTTTCATG 1440
AAAACAGACA AAGGCTCTCT GAAACACACA TAAACAGCAC ATCCTTTAGA TTTTCTTGTC 1500
AAAAAATGTC ATCAGTCCTT AACTTACAAA CATACAAAGT CCACGGACTT GTTTTGGGGA 1560
AGGTCTAAAG TTTAAAGCTC TTCAAACACT GGTAATAAAA GAAAGCTATT AAGAGATTAC 1620
AAATTTCAAA CATAGCCCCA TTAACTGCAC GTCTTCTATT TCTAAAATGT AAATAAATAT 1680
GCTGTGAGAA ATTCAGAAAT AAAAACAAAT CTAATTTTAT GTTCAGCTAG ATATATGTTG 1740
ATAAATGTTT CTGATTTTAT CAAAAAAAAT TATGAACTGA ATTTAGCAAT CCTTTATTAA 1800
TATGTCTTTC TAATACAGTT TGTCAATTTG GCACCACACA TTTTTACAAA ACAAAGTCTA 1860
ATTTTAACAT TTATAGGTTG CTAATTTTTT TTTTTTAGGT CAGCTTGATT ATGTAAAGTA 1920
TGTTTAAGCA CTCAAAATTG CAATGAACTT AGATACATTT CACCAATTTG GCACCAGTAA 1980
TAATGACAAA AAATTTTTAC TTTAACATAA TCATAAGTTG CAGGTCATAC AAAGGCCATT 2040
TGGAGTGAAC GAGAGCACAA AGACTTCAAG TGACTGCAAA ATGTTAGAGC ACAGACCCAT 2100
CTGTCTTCTA TTAGCAACAA AGGACAATGG CAGGTTCAAC ATAGCCCGGA CTCTTCAGAG 2160
GGGACCAAGC TGTGGGTGAA ATTACAAACA GAAGTGTATA TCTGCCCAGC TTTTGAAGTA 2220
ATCTACCTCT CTTCAAATCC TCTCTCACAA AGAGGATTTG AAATGTCATT GGGGATGAAC 2280
AAAGAGTGCA CAGTAAAGAA AAAATGCAGC AACTTTAAAA TCATACAACA ACTTAATTTT 2340
TTTTTCTGAA TATATATTCT AAATATTATA CATATGAGCA ATACATAACA AAAACAAACC 2400
TCCCACCTTC AAACTCTCTC TCTGAGACAT GGCTCATACC TTCCCCCGTA CACATGCTGA 2460
TTCTCTACAA ATACCGGTTC ATTTCAAAGG GCTATTTCCT TTGTTTCCAT TCTTATGCTT 2520
ATGTCTTCTG CTTTCTTATA GAAAATAAGA AAATGTCACG GATATTGGCA GCACTTTAAG 2580
GCTTAGGCTG TGGTGTTTAG AGCCCAAGCT AAAATAGTTT GTTAGGTTTA ATCATTTTGT 2640
TTCCTGATCA TAATGCTGAT GTTTTGAATG GTGTGAGAGT GCAGTCCCCC CCCCCAGCAT 2700
GAAACTTTAA AGGGACAGAA ACACCGATCC TGATTACGTT TCCTGACTTG CGGTTTCTTT 2760
TGCTACTCTA TATACCAATT TGAAAAACAT GTTTTTAAGT CATAGTTGTT AAGCTCATGT 2820
CAAAGTAATA ATTAAAAGTC AACTGTGAAG GCTGTCATAC TTGCTAAACT TGTTTCCTTG 2880
TCTGTATGTA AAGCCTGGTT AATGATCGGA GCAGAAGAGT AAGAAAGACA CTTTTACAAC 2940
CTTGCATGCG TGACATTTAA AGCACACTTG CACATGAGTT CTATGATCAA ATTACAGTGG 3000
GAGGAACCGA AGGATGAAGT TTCACTCAAG GCAAACACTC AGCAGCACCA TGTTTACTAA 3060
AGCTCACATG CACATCATGC TACATGCAGT TATCCATTTA TATATTTAAC ATATTTATAT 3120
CAATCCAACA ATGCTTCCAA AGTTCAAAGA ATGACTTCAA TATGGTCAGT TTATTTTAAT 3180
ACTATGGAAG AAAACAGACT GTGCAGATCC ATATTCAACA GAACTGTCAT TTCAATTCAA 3240
TCAAACAAAT ATCGAGT 3257