EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-00543 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:18678274-18679423 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:18679234-18679251GGTGTTTAATTAACTCG-6.93
Alx4MA0853.1chr1:18679234-18679251GGTGTTTAATTAACTCG-6.64
HOXD9MA0913.2chr1:18678492-18678502GCAATAAAAC+6.02
IKZF1MA1508.1chr1:18678914-18678926GAAACAGGAAGA+6.32
Lhx3MA0135.1chr1:18678645-18678658TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr1:18678648-18678661TAATTAATTAGTC+6.46
POU6F1MA0628.1chr1:18678646-18678656ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:18678646-18678656ATTAATTAAT-6.02
RargMA0859.1chr1:18678677-18678693AAGTTCAAACGTTCAA+6.18
mix-aMA0621.1chr1:18678649-18678660AATTAATTAGT+6.62
Enhancer Sequence
TTCAGCATGG AAGAAATCTC CAAATCCTTA GACCAGAATT TTCCATAAGC AGAAAACAGA 60
CACATTTAAA TAAACCACAA AATGTTTGAC AAAGACATCG TTGAAGAAAC TGCGCAGATT 120
TAGTCACACC ACTCTGCTGT TAGATGGCTC TATTCAGTCA TTTATCAGTC AGCCGGACCT 180
TGATGCCCGC TTACAGGGTA AGGTAGTTAG GTTGCTTAGC AATAAAACCA TGGTTACACA 240
CACAGAGCAT GCTGACCCAC GCACAGCTTA ACCTGGATCT ACACAACTAA CTTCACATAA 300
GTACACACTG ACACCAAAAT CCATGCACAC ACAACTACCA GGACAAGAAG CAACAAAAAA 360
AATGTAATAG TTATTAATTA ATTAGTCATT CACTCCAGGA TTAAAGTTCA AACGTTCAAA 420
TGAGCAACTA GAAGACACAC CATGCTGAAA TACCTGGTGT TTTCATGATG AGTTGAGAGG 480
CTTGCTGAAG GAGCATGTGA CTGTGAGGCT GGAAAAACAG GCAACTCAGC AGTACTAAAG 540
CAAAGCTCTC ACACACACAC ATATCCACGA CACTTCCTCA TTCACACGCT GACACACACA 600
TATGCTGAAA ATCAGAACAT GTGTGGCTCA AGGCCTGGCT GAAACAGGAA GAAACGTAGA 660
CCGACTAATC ACGAGCCAAA AGGACCAGGC AGACCAGCCA ATAAGAGATA TCTATGCTAA 720
TGAGTCTGTA CGCTCTTTAG AAAAGAATCT TCATTGGCAT TGGTGGTTCC ACACTGTAAA 780
CCCAATAAGT TGAGGTAACT CAAACCATTT CAGCAAACCA TTTAAGTTCA AAACTAAACC 840
TAATGAGTAC TGTGAACTTA ATCCATTTGA GCAAATGAAG CAGTTTAAGC ACATTAAAAC 900
CCAGTTAAAA CCCATCTATA TGAGTACTGT GAACTTACTC CATTTAAGTT GGAGTAATGA 960
GGTGTTTAAT TAACTCGTTA CCTTTAACAC AGTTCAAAAC CCTTTTCAAA TGAGTAAAAT 1020
TAACTTTCTG CAAATTGAGT TAACTACACT CAATATGGTG GCTTGAGAAA GAACGCATTT 1080
TAAGAACGCA TCTCCTCCTA GACCGTTCAT ACTACAACCA ACAAACTAAC TCTAAACCTC 1140
CAAATTATA 1149