EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-00519 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:18058316-18059562 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:18059459-18059480ATGAGGAAAGTGAAACTATTG-6.28
IRF2MA0051.1chr1:18059463-18059481GGAAAGTGAAACTATTGG+6.36
Lhx3MA0135.1chr1:18059239-18059252GAATTAATTATTT+6.22
Enhancer Sequence
TGAGCTGGTT CCATTTACGA AACAATATAC TAAAAGTAAC TTTAGAAAAC ATTGATGGAA 60
CTACTGCTAC ACAACAACAA CTTCCTAAAA GCTGAATCAG ACAGCAGTGC TGGAATACAG 120
TGAATACAGA ACGCAATATG ACAGACTGTC AGAAATCGAC AATGCATTCA TTGTCATTTG 180
TGTAAAAACA GCCTTTATAG TATGTAAATG ATTTACATTT GCAATCTTGT TCCTGATGTT 240
CCTTTGTCAC ACAAAACATC TGACACTCCA TCAGTCTTAC TGCCTTGAGT GTCATTAGTC 300
AATGAACAGA CTTGAATGAG CACACTTACT GCAAACAAAC TTAACCACCC AATTGCTCTC 360
AACAATAAAA AATACTTTAT ATACCTTTCA GTCATCTTTC ATCATACATG CCTGCATATA 420
AAGAATCTCT TTAAACCATG TCAACTGCTT TCAATGCGTT GTCCATTTTC TAACTTACAT 480
ACAAATAACC GACAGCTAAC GTTACTGTTA CAGTAAGCTG AGACATCAAA TAACCGCCAT 540
CTAAGTTACC CATTTAATTG AACTCATTTA GACTCAGTTT TAAACTATTT TATTCGTTCA 600
AAAATGACTT TTTTGATCAG TAAAAGTTTC GTTTGACCGT AAGTGTAACA TTTGAACCAT 660
TATTTTATAA TAAACTGACA GGCGTCGTTT CAAAACATAC TGAGCTGCCT ACCTAGACAG 720
CATTAGCGCC TTATGGATAG TTGAATCAGT GCCCAGAAAT GCTGTCTAGA CAAGCAGTTC 780
GGCATGTTTT GAAACACAGC CCACTAATAC AACTCTACCA AGAAAAAGTT CATTATCCGA 840
GATATACATC AAGGCGTTAC ATCAACTAAC GTTGTGTTAT TCACTCTTCG CGAGAGGGAA 900
ATACATTTAA TGACATATCA AGGGAATTAA TTATTTTTCA GAGGGTTAAT GTTCACTAAA 960
CTCTCATTAG TGGCTAACCG ACTAGCTAGC CAGCCATGCT AGCAGACATG GACTTTCCAA 1020
CTAAACAAAC TCCGAATAAA CTTTATAAAA GGTACTCACT GCCTCCTGCT CGCTTTTCAC 1080
ATCCCTCCGC AGTTTATGGA AGATGTGAAA GCGCGCTTTC ATCGCTTCAG CCATCCAGAG 1140
TTCATGAGGA AAGTGAAACT ATTGGAAGTT TGGAGTGTGT GTTGCCGTTT GAACGGCGTT 1200
CAGTGGGATG TGACGGTAAC ATTCACATGA TGAGAGAAAA TTACAC 1246