EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-00295 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:9305449-9308053 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr1:9305721-9305733AAACATATGCTA+6.32
FOXA1MA0148.4chr1:9306296-9306312ACTTAAGTAAACATAA+6.34
FOXC1MA0032.2chr1:9306299-9306310TAAGTAAACAT+6.02
FOXC2MA0846.1chr1:9306299-9306311TAAGTAAACATA+6.27
FOXD2MA0847.2chr1:9306911-9306924CTAAAGTAAACAT+6.42
FOXD2MA0847.2chr1:9306297-9306310CTTAAGTAAACAT+7.22
FOXE1MA1487.1chr1:9307724-9307739CATAAAATAAACAAA+6.54
Foxd3MA0041.1chr1:9305976-9305988GAATGTTTGTTT+7.22
PBX1MA0070.1chr1:9306378-9306390CAATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr1:9306374-9306386ACATCAATCAAT+6.44
RREB1MA0073.1chr1:9308019-9308039CCCCCAACCATACACAAACA+6.17
ZNF24MA1124.1chr1:9306983-9306996TAATGAATGAATT-6.17
ZNF24MA1124.1chr1:9305960-9305973GAATGAATGCATG-6.39
ZNF24MA1124.1chr1:9305968-9305981GCATGAATGAATG-6.71
ZNF24MA1124.1chr1:9305956-9305969TAATGAATGAATG-7.12
ZNF384MA1125.1chr1:9307927-9307939GTTAAAAAAAAA+6.04
ZNF384MA1125.1chr1:9307438-9307450TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr1:9306873-9306885AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
TTATGTTTGA TTCTTTTGAA CACTGTTGCT TTTCGTTTAA CTGACTTTGA ATAAAGGGAT 60
CTTGCCTCGC AGTCTGCTGT CTGTTCAAAC GTAACAGGCT CCCAGCTACA GGAAAGGTGA 120
CAGAGAAATA GATTAATTTT ATATACAATT CTGAAGCTGA AGGTGTAGTT GAATTGAACA 180
AATAAAATTT GCTGTAACAT ACAGTTGTGA ATGTGAGAGT GTATGGGTGT TTCCAAGTAC 240
TGGGTTGCAG ATATAAGGGC ATGCTCTGTG TAAAACATAT GCTAGATAAG TTGGTAGCTC 300
ATTCCGCTGT GGTAACCCCT GATGAATAAA GGGACTAAGC CGAAGTAAAC TGAATGAGTG 360
AAATTGGCAG GAGTGTGTGT GTGTGTGAAT GCAAGAGTGT ATAGGTGACC GCTGCGTAAA 420
AATATGCCAG AATAGTTGGT GGTTCATTCA GCTGTGGCGA CCCCTGATAA ATAAGGAACT 480
AAGCAGAAAG ACTATGAATG AATGGAATAA TGAATGAATG CATGAATGAA TGTTTGTTTG 540
AAAACATTTT ACATTGATAA TGGCAGGCTG CAATGTCAAG CAATGATAAA TGATATGCAA 600
CAGTTACACA CGGATGATGG CATGATCTTA AATTTTGTCA TTATAAAGGG GAAACAGCTT 660
CACATATTCT TCTTTTACCC TGCTATTGAG ATATTTAACC AAAGTAAGTC AAAAGATTTT 720
CACAAAACCC TAAAAATTGA TACCAACAAT GTGGAAAATG GCCATCCAAT TTCAACTTTA 780
AGAGATTTAA AATTTGTAAT CATTTATTTA TAAAATTAGG GACAGTGCAG TATCTTCATG 840
ATTTAAAACT TAAGTAAACA TAAATTTTTG GGCAGTAAAT AAATAAGAAT GCTCCATTTT 900
AAATGTTTTA ATACATCCAA ACTGTACATC AATCAATCAA AATGTACACA ACAAAATCTT 960
TGCAAACTCT TACCAGTTTT GAGTGACTTT TAAAAAAAAT TATTTTGTTA GAAAACTCTG 1020
TAACTCTTTT TATTCATTTA ATCTACCACA GTGTGTGAGA CAACCGGTAG ACCTACAGGT 1080
AATACTACTG TAGACATATT AGCTCTACAT TTATCTCTTT ATTTACATTG AATTTGTTAT 1140
TTAGGAGACA AGTCTTACCT TCAAGGCAGT CTAAGAGAGT GAGATGGTGT TGTTCTAGAT 1200
TTCTCAAACC GCACTGACTG AATTTACTTT CAGTTTTGAA ACTGACCTTA TCAGAGGTTG 1260
TTTTCATAGA GTAAAAAAGA ACATAAAACA ATAAGCATGC AGCAACATGA AGGTTTAAAA 1320
CATCCTAAAA TGACGAGTAT AATATTTTCT TAATACAAAT GTATTAGTTA AGGTATTGGG 1380
CAGGTTTTAC CACATACAAA AGAAGATAAT GAAATAATAA TAGCAATAAA AAAAAAGAAA 1440
ATTTATGACT ATATTTTGCA TGCTAAAGTA AACATGCAAC AACAATATGC ATGGAAGAGC 1500
TTGTTGCCAC AAGGACAATG TAATAAATCT AATTTAATGA ATGAATTAAT TTTCCTTCGG 1560
CTTTGTCCCT TTATTCATCA GGGGTCACCA CAGCGGAATG AACCGCCAAC TTTTCCAAAA 1620
AGGGAAACTT GGCTGGGAAA TGTCAAATTA TATTAAAGTG GGAAAAAGTA ACAGTCCAAA 1680
TGATGTAAAA TTATCAATAC TTAAAACAAA GATGCCGTCT TTAAAATCAC AGTTATTATT 1740
CAGCATGTTT CCATTGTGAT AATTAGCAGA AATACACCAT CTTAAAAAAT ATTTGCACAT 1800
AAAAAAATGT AACTGAATTG AAACTAAAAT TTTGCTAAAT CAAACAGTAT GTCAAACAGG 1860
AAGCTCTTGT GAGAACGATG CAGATTCAAG ATGCTGTATA CAGAAACCAC AATGTTTATC 1920
AAAGCTGAAA CCTACAGGAA ATAGCTTTGC TGCTAATACT GAGGCTGACA AACCAAAAGA 1980
GCTCCATTCT TTTTTTTTTT ACCTTTTTTA TAACAGTTTT CTAAAAGTGC AAAAAAATTA 2040
TTACAGACTG TCCAAAAACA TAAATTATAA CCAAGAGAGA GAGAGAAAGA GAGAGAGAGA 2100
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAAATAACCA AATCTTCCAA AAATCCACCT TATACATTAA 2160
AATCATAAAG CTGTCCATGG TCAAACTTAA GACATAAAAA TGGAGTAGGA AATTAAGAGT 2220
GTCCTTGATT TAAAAGTGCC CTACTTTAAA CTTTTTAGTC TTTCAATTCT TTCTTCATAA 2280
AATAAACAAA AAGAGCAACC TTTTTTTATT CTTTTAGAAA TACCAGCCCT AGCACAAACT 2340
ATGTTATAAA TAATTTGTAG GTCTCAAGCA TTACTGACTA AGAGTTTTAA ACCTTACCAG 2400
GTGGCCTCTC ACAATCCATG CATTCAGTCG GATGAAGAGT TATTGATCCA AGATAGTGGT 2460
GGAGATTAAC TTTCTGCTGT TAAAAAAAAA GAGGCCTCTC ATTTCTACTG TCTATTGTGA 2520
TTATGATGAA GCCTTTATTT ATACACTTTT ACATTCAGCG AAATTGGAGC CCCCCAACCA 2580
TACACAAACA TCACACATTT CAGG 2604