EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-00246 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:7335503-7336929 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr1:7335549-7335559GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr1:7335549-7335559GCTAATTAGT-6.02
IRF1MA0050.2chr1:7336475-7336496AAATGGAAACTGAAAGTAATT-8.28
IRF1MA0050.2chr1:7335615-7335636TTTTACTTTCGGTTTCACTTT+9.45
IRF3MA1418.1chr1:7335618-7335639TACTTTCGGTTTCACTTTGAA-6.49
IRF3MA1418.1chr1:7336472-7336493TGTAAATGGAAACTGAAAGTA+7.34
IRF4MA1419.1chr1:7335618-7335633TACTTTCGGTTTCAC-6.41
IRF8MA0652.1chr1:7335619-7335633ACTTTCGGTTTCAC-6.51
IRF9MA0653.1chr1:7335619-7335634ACTTTCGGTTTCACT-6.16
LHX6MA0658.1chr1:7335549-7335559GCTAATTAGT-6.02
MEF2CMA0497.1chr1:7336664-7336679TTCTATTTTTGGTTG-6.41
Nr2f6MA0677.1chr1:7336810-7336824TGACCTTGGACCTG-6.02
SOX21MA0866.1chr1:7335977-7335992AATAATGTTATTGTT+6.19
Sox1MA0870.1chr1:7335977-7335992AATAATGTTATTGTT-6.28
Enhancer Sequence
TGTGTAAACA ATTGGGAAAA ACTGTAATAA GATGAATAAT AAAATCGCTA ATTAGTTCAT 60
TGTTATAGAG AGCTCAAATA TAGCAACTCT CATCAGAGCA TTACCTACAG GTTTTTACTT 120
TCGGTTTCAC TTTGAATCAC AGTTCACTGA AGGACAGAAC AAACAGAACA AATGTAACTG 180
TACAGCATTT CTGAGAAGTC CAGGATTACA AATAGAAGAT TTTTAAACAT CGTTTGTTAG 240
CACCAAGTTT GCAGACAAAA ATAAAAATAA AACATTCGTC AAAAGCTGAG TTTTAAAAGC 300
AACATGTAGG AAAATATGGA AGTTGACGGA CATCTGTATA CATTATAAAA ATACCATGAA 360
TAATTCGGAG ATGACAATGA CAGTTTAAGA CTTAGCAAAT TTCCACCGTT AATCTTTAGT 420
CTTGACTAAA TTCAAGCGTA CTAATATATA TTATTTTGGT GTGGCTCGAG CGCAAATAAT 480
GTTATTGTTA AATATTATAA ACAAAATGTG CCCAGCACCA AACTAAATCC CCGTCTCAAC 540
AATTTTATGC CAAGTGGGGT GCGGGCAGTG TGGTGCTTTC ATAAACGATC GTAACAGACA 600
GAAAGGCACC AGATTTCCAA GCTCAAACCA GCCAGATGTA AAAATGCCTT AAGATGCATG 660
CCAAAAATCA ACTATAAATA CTTATATCTC ATATATGCTG TAAGTAAAAA CAAGCCTTCC 720
AATTCCAGAC GGCTAGTGTT TTTGTTTGCT TTTTTCAAAC AGGAAATGTA TTTAATTACA 780
TAGTTTTATG TACATAACGG TTTGCTTGAA ACTGCATTAG ACACTCACCA CAGTTTGTCC 840
AAAATATACC TTCTTCAGCA GCCTATAGTC TAATGCGCAG ATGGGTACGA TGGTATATGG 900
CAGCAAATCT TAGCTGCAAT TTCTTCAAAG AGTGTTCGTA ACAGGGTGTT ACAAGATGTG 960
AGCATTTATT GTAAATGGAA ACTGAAAGTA ATTTGAGGTC TAAAGTAGTT GCACATTCAT 1020
GCCCCTCTAG TTCATATGGA CTCACAAAAG ACAAAATAAC AAATGACGTG AGTTATATTA 1080
CCAAAAGAGA AGCCTATTTA TAGTATGGTG CATGCAGGTA TGTAAGAATT ATGGCTCTAC 1140
TCTTTATTGC CATTTTTTTA TTTCTATTTT TGGTTGATAA AAATAAGTAA TGATGTTAAC 1200
AGCAAATTAT GAAAATATTC AGAAAATAGA ATAAGCATAT TTTTTAAGTG TGAGAGCTTG 1260
CTTGTCCTCC CTTTTCTTAA AGAAACTAAA GAACAACACA CTACATGTGA CCTTGGACCT 1320
GTTCTTCAGT TGCATGTGTA TATTTATAGA TTTTTATTAT AAATGCCAGC AATTACTAGA 1380
ATATAATATT TAAATATCAT GAAGGTATCA AACTCAATTT TTAATT 1426