EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-00089 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:1560382-1561699 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr1:1560632-1560644CAGCATATGTTT-6.04
POU4F1MA0790.1chr1:1560964-1560978ATGAATAATTAACT+6.09
POU4F2MA0683.1chr1:1560964-1560980ATGAATAATTAACTAA+6.14
POU4F3MA0791.1chr1:1560964-1560980ATGAATAATTAACTAA+6.25
RFX1MA0509.2chr1:1561256-1561272AGTTTCCATGACAACA-6.21
RFX1MA0509.2chr1:1561256-1561272AGTTTCCATGACAACA+6.23
RFX2MA0600.2chr1:1561256-1561272AGTTTCCATGACAACA-6.11
RFX2MA0600.2chr1:1561256-1561272AGTTTCCATGACAACA+6.18
RFX3MA0798.1chr1:1561256-1561272AGTTTCCATGACAACA+6.16
RFX4MA0799.1chr1:1561256-1561272AGTTTCCATGACAACA+6.22
ZNF24MA1124.1chr1:1560559-1560572CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
TTGAACTGTG GGGGAAACCG GAGCACCCGG AGGAAACCAC AATGCTGGAT TATTTACATC 60
CAAATTGGGT AAAATATGGA CTAACCCAAA CATTGGTTTA AATTTGGTCC CATTAATTTA 120
ATTCAAAATT CCAGCAGTTG GGTTAGTTCC TATTGCATCC AGAATTGTAT AGTGTGTCAT 180
TCATTCATTT TCCTTCAGCT TAGTTCCTTC GTCCAGGAGT AACCACAACG GATTGAACCA 240
CCAACTATTT CAGCATATGT TTTACACAGC GGATGCCCTT CCAGTTGCAA CTAAACCCTA 300
GCAAACACCC AAGCACACTG ATTCACACAC ATATACGGCC AATTTAGTTC ATCAATTCCT 360
CTATAGCGCA TGTGTTTGGA CTAGGGGAAA CCGAAGCACC CAGGAGAAAC CCACGCCAAC 420
ACGGGGAGAA CATGCAAACT CCACACAGAA ACGCCAACTG ACCCAGTCGG GACTCGAACC 480
AGCAACCTTC TTGCTGTGAG GCAACAGTGC CAACCACTGA GCCACAGTAT CTAATAAAGC 540
ACAAAAAGTG TAGTGTTACT AGTATTTATC ATTTAAAAAT AAATGAATAA TTAACTAAAA 600
GCAAACTCTG GGCATTCAAA TGCTTGAATA AATGACATTA AAACATCTAA AAATAACCCT 660
ATAATAAATT CAATAAAAAT ATCAAGACCA AATAAATGCA TGAATCAATA AATAAATCTA 720
TTTAAAGACA TTTTAACAAA GAGACTGCAT GAAAACCCAA AGGCTGATCG TCATGACAAA 780
GGCTGAGCAC GTGCACTGTC AGATCCGTCT CATCAGGTTT CACAGCTTCC ACTAGAGGGC 840
ATCGCTCGGG TCTAAAATTA GGGGGTGACA TGATAGTTTC CATGACAACA CATTTATAGG 900
CTAGAGCCCA CAGCTTGTAA ATAAAATGCA AGATATTTTT AGCTCTCCTC CTTTGAAGAT 960
GCGGTCTCCA GCAGGCGCTG GTTCAACAGC ACCGGTCAAT TTCCATCAGC AACACACGCC 1020
ATCCATGAGA TTAATCCCTC TAATGAGGAT AATCCCGAAC AACAGCAAGA GAAGACAATA 1080
TTCGTCATGA AATAAGATCT CACAAAAACA GGAACCCTCA AATGAGTGTA TGCTGGGAAT 1140
CCTTATTCAC TGATGAATTA ATGTAAACCA TATAATCTGA TTCAGTGAAT TATTATTTAA 1200
TGCTGCACTA ATCATGAATA ATGAGAAACA TTACAAAGCA GGTCAGGATT TTTTTGTACT 1260
GATTAACAAG CTTGCGATCG CTTTTTACAA CACAAGTACA ATCACAAGAC CCTGATA 1317