EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-00015 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr1:345522-346777 
TF binding sites/motifs
Number: 53             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr1:346607-346618TATAAACAATA-6.32
MyogMA0500.1chr1:346028-346039CTGCAGCTGTT-6.02
RFX1MA0509.2chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA-6.06
RFX1MA0509.2chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA+6.08
RFX1MA0509.2chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA+6.78
RFX1MA0509.2chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA-6.78
RFX1MA0509.2chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA+6.83
RFX1MA0509.2chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA-6.83
RFX2MA0600.2chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA+6.33
RFX2MA0600.2chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA-6.33
RFX2MA0600.2chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA-7.04
RFX2MA0600.2chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA+7.09
RFX2MA0600.2chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA-7.13
RFX2MA0600.2chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA+7.15
RFX3MA0798.1chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA+6.27
RFX3MA0798.1chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA-6.4
RFX3MA0798.1chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA-6.79
RFX3MA0798.1chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA+6.99
RFX3MA0798.1chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA+7.02
RFX3MA0798.1chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA-7
RFX4MA0799.1chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA+6.17
RFX4MA0799.1chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA-6.32
RFX4MA0799.1chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA-6.52
RFX4MA0799.1chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA+6.75
RFX4MA0799.1chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA+6.92
RFX5MA0510.2chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA-6.29
RFX5MA0510.2chr1:345565-345581TGTTTCTATGGTAACA+6.33
RFX5MA0510.2chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr1:345619-345635AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr1:345778-345794AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA+7.37
RFX5MA0510.2chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA+7.38
RFX5MA0510.2chr1:345724-345740TGTTGCTATGGTAACA-7.3
RFX5MA0510.2chr1:345673-345689AGTTGCTATGGCAACA-7.42
Tcf12MA0521.1chr1:346028-346039CTGCAGCTGTT-6.62
ZNF263MA0528.1chr1:346091-346112TTTTCCTTCTCCTCCTCTTTC-6.77
Enhancer Sequence
TGGCAACAAA ACTATAGTAC TTGATCTGTT GTGGTGATTC TATTGTTTCT ATGGTAACAC 60
AACAACTACA GCAATTGATC TACTGTGGTG ATTCTACAGT TGCTATGGTA ACACAACAAC 120
TACAGTAACT GATTTACTGT GGTGATTCTA CAGTTGCTAT GGCAACACAA CTATAGTACT 180
TGATCTGTTG TGGTGATTCT ATTGTTGCTA TGGTAACACA ACAACTACAG TAATTGATCT 240
GCTGTGGTGA TTCTACAGTT GCTATGGTAA CAACTACAAT ACTATAAACA AATGTAGGCA 300
ATACTGTAGT CTACAATAAC TCAAGGAAAC TCAAGTGTAA ATGTCCACTA GTGAGTTCTT 360
CATTAAAGTC TGTTTCAATC AAATCTGCTC TGCTTGTTGA TCAAACGCTG ATATTTCTCT 420
CTCCCTCTAA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 480
CACAGATGTG AGGTTACATT CTTCCTCTGC AGCTGTTTTC CTCAGTCTCT CTCTCTCTCT 540
CTCTCTGCTG TTGTTTTTCT GAGCCAGTGT TTTCCTTCTC CTCCTCTTTC CCGTCTGTTT 600
CTCTGAGGTC AGGTCACTCC TCCTGTCCAG CTGAAAAACA CACTGAAGCT CAGGTCAGAA 660
GCATCAACAC ACGCACATAC ACAAACACAC ACTTAATACA CACACCCACA CTCACTATAA 720
AACTTACAAA CACACAGACC TAATGCATAC ATGCCTACAA ACACACACAT ACACACTGTA 780
CACTCTCTCA CACACAAATA GACAAACACA CACAGATTCT CTCTTTCACA CACGCACACA 840
CATAGACAAA CAAACCCATA AACACACACA CACACAAACG AACAAGACTT ATGTGGAAAT 900
TTTCCTGCCT AGATTTTCTA TGAACAGCCA TCAGCCTCTT CTGTTATTAG TGTGTAACTA 960
ATGTTGACTT GTACAGCGCT TTCACAATGA TTCCTCCACT GGCATTTCAC ATTATAAAAC 1020
ATCAAGATTA TATGCCAAAT AATATGCACA CAAAAGAATA AGCTTCACTG GAAAAATATA 1080
GAAATTATAA ACAATAAAAT ATAACAATAC TCTTCAACAT TAGTGAACAT CAACCAACAA 1140
TGACAAGTGG TGATAGAGCA TTTATTCACT TTAGCTAATG TACAATCAAA CATGAAATAA 1200
CAAAAAGTAT ATTATAGTTC ATAAACTAAA TATTGTATTC TATTAGTTCT ATTAA 1255