EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR012-00478 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_sphere 
Coordinate
chr16:36423872-36426108 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr16:36425812-36425825ATTAAGTGTTTTT-6.42
PBX1MA0070.1chr16:36424549-36424561ACATCAATCAAA+6.74
RFX1MA0509.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.52
RFX1MA0509.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.54
RFX2MA0600.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.39
RFX2MA0600.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.5
RFX3MA0798.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.16
RFX3MA0798.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.26
RFX4MA0799.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.18
RFX4MA0799.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.51
RFX5MA0510.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.01
RUNX3MA0684.1chr16:36425324-36425334AAACCGCAAA+6.02
Enhancer Sequence
GGCAGAGCAC ATATTAATTC CCATCATAAC CATAAATAAA CAGAAAACAG CAGTGAATCA 60
CAAAATGATC AGTAGATATT TGTATAACCA CAGCCGCAGA CAGACTCATC TATTAAATGT 120
ATTTTGTGAT GCTTCAAATA TGAATCACGC ATGATGTTTT CAGACTTACC ACATTGCTGT 180
CAACTTCTGA AGTAGTCGAC TTGATGATAA ACTGTGGATG AAAAGTAGAA TTAAACATGA 240
GTGAGCAATC AAACATGATT TCTCTAAAGT TGATGTCCTC TAAACTGGAC TAGGGTGAAC 300
AGACTTACCT GTTTGCCGTC CATTTTTCTG ATACCACGAT AGACATTGCC GTAGCAGCCA 360
GCTCCAATAT TTTCTTTCAG GTCATATTTT GCTTCCACTG AAAGATAAAA ACAGCATGTT 420
CATTTGAGAC AGCTTCTAGT TATGCCTGAA CAGACAGTAT AAAAATAAAG CCATTTAACC 480
CGTAACAGCC AACAACATAA ACAAAGCCAA TTTGCCCCGA ATTAAGTTTT TTGAAACTTT 540
TTTTAATTCA AAAGCCTTTT CCCAAAATAT GTCAAAATAG TTTGTCACTA AAAAAATCAC 600
TCCATTTGCT GAAACTGAGA GAAAGTTGAG GCCAAATGAC CCCAGTGTGT ATGAAACAGC 660
AACACAAGGG TTAAACAACA TCAATCAAAC ATTAAAAATA CATTCAAATG TACCAGAACC 720
AGGAGAAGGC CCTATCCTCT GTCTACATGG CGGTCTTCTT TGTCCGGAAG GACCGGGAAC 780
ATGTAACATA CTTTTTTCCA TTTATTAGCA GTAAATAACG CTCTCTAGGG TGTATAAATG 840
AGTTTACTGC AGTTAATTAT CTGAGTTTTC GCCTTGTCTG AGTATCAAAT GAAAAGTTCC 900
TCAATACACG TCTGTTCTGT CAGGCGTCTG GTGGATTCTG ACACTCGCGG TGCAGAGCGC 960
GTTCGATTTA TGACGTAGCG TAGGGCCAGA CCAAAGATGG GATGGGGGTC CTGTAGGTAC 1020
AGGTGTTCGC GTTTATTCTT CAGGGTGTAA AAGGTGAAGT GGCATATTAA CCTACTGTTT 1080
AGGGCTCGTG ATAACATTAT AAAATACGCG TGGACCTTAT ACAACTCTTT TGCCATCTCT 1140
GCATGGGGAA AAGAGGGAAG AATAAAGTTA ATCACGCAAG GCCTGGCATG ATTGATGTTT 1200
GACGGGTCCA ACACGGCTGA TTAATTTGAG GACTCTGCAT CGGCCTTTAG CTCTGCACTG 1260
AATTTACAAT GTAATACGGA ATCACGATGC GTTGACTCTT GTCCAGAAGT CTGCTGCTAA 1320
GAAATCGAGA GCTCCGGAGT CTAATGTTAG TTGTCATGGA AACGAGGATG TCTTGGCGGC 1380
AGTACGTGAA GTTGCTAACC TATGGAATAA AATTTCTGTT ATAATTATAA AATTCACGCA 1440
TCTGCAATTA TGAAACCGCA AAGGAAAACG GAACATAACT TGTGACGTTA CTTTACAGAC 1500
ACGAAATAGT TTCACCACGG ACACGAAGAG TACGAATCAA ACAGCGACAG TCCACTGTCA 1560
AAATACATCA CCGCGGTCAC AGGCATTAAT AAACGAGCCA GAGTCATCGA TCACAACAGT 1620
GCGCTTGCGT GATGAGATCC TGAATCCTGA CTGAAGGAAG CCCCCCGAAC AAAATGTCTG 1680
GGCAGCTCCC ACACACCGTC TCAGGTAAGA CTTTTGTTAA TCCCTCTTTG AGAACTGTCC 1740
TCCATGAGCT GTAATAAAGG TTGAGACTCA ATGAGGTCCA TTTTCGCTGT GTTTCTTAGA 1800
CATTTTACAG AATCAAAATT AAGATCGGGC CGAGGATAGC AAGCTAAGTT AGCATAACGT 1860
AAGTGAACTT GACAGGCAGC GAGCGCAGAA CTTCTCAGTG AATCACTTAA CGGTGTTTAA 1920
CTATAACATG GCATCTGTTG ATTAAGTGTT TTTGAAAGCC AGATAGACTA TTGATCTATT 1980
ATAAAGAAGA TATCAGCAAA AGGCAAGTTA AATATTTGAG GGTTTTTGCT TATTTTTATG 2040
ACACTGAATC AAATCCATCA ATTGTTTAAA AAACTTGAGA TCTACGTTAA TTTATCTTAT 2100
TATCACCGAA TGAGTGGGAA AATATATTGA ATAATGTAAT AAAGTCTGTG CAGATTAGCA 2160
ATTGGTTAAA TAAGTGACCC GGACCCATGG GCGTAAATCA TGAGGGGCAG TCATTTAAAC 2220
ACTCGTATTT CATCTG 2236