EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-48807 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:52283288-52283722 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr9:52283656-52283675TGACCACTAGAGGTCGCTG+7.06
Hmx1MA0896.1chr9:52283495-52283512ATTAATTAATTGCTTGT-7.61
Hmx2MA0897.1chr9:52283495-52283512ATTAATTAATTGCTTGT-8.65
Hmx3MA0898.1chr9:52283495-52283512ATTAATTAATTGCTTGT-9
Lhx3MA0135.1chr9:52283493-52283506TAATTAATTAATT+6.78
POU6F1MA0628.1chr9:52283495-52283505ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:52283495-52283505ATTAATTAAT-6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr9:52283618-52283635TGACCCTGATCTGACCC-6.08
SOX10MA0442.2chr9:52283340-52283351AAAACAAAGAA+6.62
Enhancer Sequence
GTGAGATCGT GTTTTCCTCA GGCTCCAGCT TTATGTTTAT GTTGGTCGGA TTAAAACAAA 60
GAAAACAGTC TTAAGTTATT CTTTTTAAGT TAAATGCATC ATGATTTTAC CAATCTGGCC 120
CACTTGGGAA TAGATTGTTC TCCATGTGGC CCCTCGGCTA AAATCAGTTT GACACCCCTG 180
CTCTATAGAA ATGCTTGATC TAATATAATT AATTAATTGC TTGTTAAATT CTTATATGCA 240
GTATCTATTA GCAATAGTCA TTTCAACTTG CCATCAGCTT TAGGCAGAAT TTCCCTCTCA 300
GGTTGACTAA TATAAGCCTA TGTTGGTGAG TGACCCTGAT CTGACCCCTG TATTGGAGAT 360
TTAGTAAGTG ACCACTAGAG GTCGCTGTGA CTCATGATTA AACCATTCAA GTTCACAGAG 420
TCATAATTCA TTCA 434