EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-48615 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:45425857-45426977 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr9:45426919-45426940TCATGCTTTCACTTTTTTTTG+6.67
Lhx3MA0135.1chr9:45425925-45425938TAATTAATTAAAC+6.19
NFIL3MA0025.1chr9:45426374-45426385TTATGTAACGT+6.32
NFYAMA0060.3chr9:45426019-45426030GGCCAATCAGA+6.02
Enhancer Sequence
TTAGACTGCA ACCCTGCAAT AGCTGCAGCC AAGCCAACTG ATCATCATCA CTCTGTCGTT 60
TACAGATATA ATTAATTAAA CACAACAAAT TAGCATTTTT TTATCTTACA AATGTAATCA 120
TCCGTTGTGT TTACAGCCAA TCTGTTTCGC TTTAACGTGT TCGGCCAATC AGATCCGTCG 180
CTGGCGGTCA GCCTCCTTCC CTGACTGACA GAAAGTGGGC GGTGATTACG CGCGCACAGC 240
CAATTGCAGC GTGTTTCGGC AACCACGTTG CGCGCTACCG ACGGGCGACC CCGCGAGAGT 300
ATTCTAGGCC GCTCGTGTGA TCAAACAGAT CCACTCCATT CCCGGGAACA TCATCGAGAT 360
TAGAGGTGGG CTCTCAACTT TATTCCAATG GCGGACGGGA GTCCTTTGAA TCTGTATTGA 420
GGTGCCGATC GCCGCGTGCA CACGCGTGAG TACTGACGGA TCTCTCTACT CGTGATATTT 480
TTAGACGCGG GATATTTTGC GCGTGTTCCC GCTGTGTTTA TGTAACGTAA ACGGGCTTTT 540
TTCTTCTCTC ACATCCTTGA CGTAAGTTGT TCGTGGTGTT ATTTGACAGG GATAGAAGCG 600
GGGATGCTTT ACAGTAGATG TTAACCCACC CACGCTGTTT TGAAGGTGCA CATTATGGTG 660
TTTTTCTGTG TGTGAAACTG TAATAATGAA CGCAGTGCAT CGCTGCAGAT GGGAAGCAGG 720
GCACGCGAGC ATGTCATAAT GCAGTTCCAC AGTCCACAAT GGAAGCGCGC GCGGTGGGCT 780
GATAGATGGA GAAAACAACC AGGCTGTAAG GAGGAAGCAT ATCGAGTCGT TTGCACTGAG 840
GATTTGTTTA TGATCTTAAA CAAGGAGAAT AACTCGATGT TTTCAGTCAA GTGCTTTTTA 900
TAACGCAACT TCCCAATGAT AAAAGTGTTC AATTGAAGAG CCGTGGCAGA ATTCACCCGT 960
GCTCGTCTAC ATCTTGTCGG CTTCATTAAG ACGCACGACT CCGCACCTTC CGCGGATCGT 1020
TTGCTTCATA CTGATAATAA TCCTGTCATC ATCTGCACAC CATCATGCTT TCACTTTTTT 1080
TTGGTTGTGA ACACAAAAAG AGTTACAGAA ACGCTGCTCT 1120