EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-48277 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:35003383-35004013 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr9:35003725-35003736TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr9:35003724-35003737GTGATTAAATTAA-6.28
Lhx3MA0135.1chr9:35003877-35003890TAATTAATTATTA+6.18
Lhx3MA0135.1chr9:35003873-35003886TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:35003874-35003887AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr9:35003870-35003883GAATAATTAATTA-7.12
MyogMA0500.1chr9:35003434-35003445CTGCAGCTGTT-6.02
POU4F2MA0683.1chr9:35003868-35003884ACGAATAATTAATTAA+6.56
POU4F3MA0791.1chr9:35003868-35003884ACGAATAATTAATTAA+6.15
POU6F1MA0628.1chr9:35003875-35003885ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:35003875-35003885ATTAATTAAT-6.02
Tcf12MA0521.1chr9:35003434-35003445CTGCAGCTGTT-6.62
USF1MA0093.2chr9:35003696-35003707GGTCACGTGGC-6.62
USF2MA0526.2chr9:35003693-35003709CGAGGTCACGTGGCAT+6.44
Enhancer Sequence
CTCAAGCAAT CAGCCTGCCA CTCTATTGTA AACAAAACCA TGTGATGCAA CCTGCAGCTG 60
TTTTATTCAA CTTATCTCTA TACATGGGAG GACAAATTGG ATTGACAGGC GGCATAATGG 120
CATGTCCCTG CCCTATTCAC TCTTACCGCG CGTGGACAAA ACGTCTGGGC TGATGAGTTC 180
TTGATAGCAT TTGGTGGCTC CTTTGTGTAC TCCAGCTCAT CTCCAAAAGT CAATTAAAAT 240
CCTGTGATGT TGACACCGCC AGCACGCGCC CCTATCAAAT ACAAGTGCGA CTCGCGTGAA 300
CCCGCGCTCT CGAGGTCACG TGGCATTACG CAACAGGTCG GGTGATTAAA TTAAATGATG 360
TGCGCGAGCT TCTGAATCGT TTACGCAAAT CGGCTCGTTT CAGCAATTGT TATGTCACAA 420
ATGCATGTCA AAATACAGTC AGTGTAACAA TTATTTATGC TCGAAAAGCA CATTTACTCT 480
ATTTCACGAA TAATTAATTA ATTATTATAA TCACAATTAC GGGTAGCACG ATCGCCTCAC 540
AGCAAGGTCA CTGGTTCGAG GCTCGGTAGG GTCAGTTGGC GTTTCTGTGT GAAGTTTGCA 600
TGTTCTCCCC ATGTTTGCGC GGGTTTCATC 630