EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-48240 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:34140380-34142360 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr9:34140459-34140469TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr9:34140459-34140469TCTAATTAAA+6.02
FOXA1MA0148.4chr9:34142246-34142262ATTTATTTACTTAATT-6.21
FOXC2MA0846.1chr9:34142247-34142259TTTATTTACTTA-6.07
POU4F1MA0790.1chr9:34140483-34140497CATTAAATATGCAA-6.3
POU4F2MA0683.1chr9:34140481-34140497CTCATTAAATATGCAA-8.17
POU4F3MA0791.1chr9:34140481-34140497CTCATTAAATATGCAA-7.19
PRDM1MA0508.2chr9:34142341-34142351TCACTTTCAC+6.02
RFX1MA0509.2chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC+6.34
RFX1MA0509.2chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC-6.35
RFX2MA0600.2chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC+6.44
RFX2MA0600.2chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC-6.52
RFX3MA0798.1chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC+6.42
RFX3MA0798.1chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC-6.49
RFX4MA0799.1chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC-6.17
RFX4MA0799.1chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC+6.72
RFX5MA0510.2chr9:34142292-34142308TGTTGCTATGGTTACC+6.11
TFAP2A(var.3)MA0872.1chr9:34140842-34140855TCCCCCCGGGGCA+6.01
TFAP2A(var.3)MA0872.1chr9:34140842-34140855TCCCCCCGGGGCA-6.16
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr9:34140842-34140855TCCCCCCGGGGCA+6.03
Enhancer Sequence
ACAAATTCAC ACTAAACAGG TATTTAAAAA AATACTAGGC TAATGATTTG TGGGTGCAGG 60
AGCACAGATT GGAAAAATAT CTAATTAAAT AAGCCTAATT ACTCATTAAA TATGCAAGCA 120
CAATTTTAAT TGCTTATTCA GAGCATTGTG GCTTAATAAT TGCTTTAGCA ACACTATTAC 180
CTCTAATTTA AGCTAATCTA ACAATGAATT CAAAGTTTTT ACACCCAATT GCTCCAATTG 240
TAATGATGGG TGTTGGGGTG AGGAGGTTCG TTGAATCTTT ATACACATAA TGTGTCCGTT 300
CAGTCCACTT GCAGGCGTCT GGCCACTGCA CTTCATCTTC CTAGGCTGTG CTGTTATCCT 360
TGTCATTTAG GGGGGAGAAA AAGAGGAAAG GGGAAATGTG TCCCCCCTTG TTTCCCCTCT 420
CTAAACTCGC CTCTCTCTTA TTCCCCAACT CAATTCTTTC GGTCCCCCCG GGGCAACAGC 480
ATTCCAAAAC ACACACAAGA ATTTCCTTTT CTTCAGTTCA CAAACCCTCC CCTCCAACCT 540
CACTTCAAGA AGAGGAAAAA AGGATACATC ACCCTCTACC AAATGGTCCT TACATTAAAT 600
AACATGAATA AGGAAATAAA ACGTCCGTGA CAAATGGTTA AATCACTTTT TCACAGTCTC 660
CCTGTCTCTC TATAAAATAC CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACT 720
GCATGCTCTA AGTGTGTCTC GTGCATGCGG CATTGTAAGT TCTCGGTTTA AAACACAAAG 780
CAACACAAAT GCAGGAAGAA GCGAGAACAA GAAATTATTC TTCATATACA GCATGTTTTA 840
TATTTGTAGC GTATTACCGC TATAGTTTTG TGTACATGCA ATTTAAACGA TACAGGGATT 900
AAGCAAACGC TAAACAAAGC ATGTACAATC CGCAGCTTAT GGTACAATAA AATCATAAAA 960
CACACAGGAC GCACCTTTTG TTTGAGTTTG CTGCATGCGT TCGCGTTCTT CCTCCGCGCA 1020
CCATCACCGC TGATAGCGGA CAATCTGTTT CTCTGTGTCC AGGAAAGGAA AAAAAGAAAA 1080
GAAAAGAAAG AAAGGCATGA AAAAATGAGC GCATTCGACA AAATGAAAGT ACGGCTCCTT 1140
CGAGAGGGCA GAAACACTTC ATGTTCATCA TCGCATGTTT CATTCATCTG CTTGTCATTT 1200
CCCCCTTCCT TGCGCCGGCC GCCCTTTCAC GCTGTGCATT AACATACAGA ATGACTTGGA 1260
AATGCCACTG CTGCTGCCCC ATTCACATGC TGACTTCACT AACCAGCATT CAGTTCAGAA 1320
ATCCCCCTCT GTCGGGGCCG TCCCTTCGCG CTTGGATATA ACTAAGATAC AAAGCACTGC 1380
AGTTAGCATA ATATATAGGC TATCACACGA TTTGAGGAAA CTCCTAAGTC AAAAATAGAC 1440
TTTCCTGCAA AAGGCGAAAG TTATATGGTG AGATGACATC AATTTTTGAC GACGTACGTG 1500
CATGTTTCTG AGAACAGAAG GGGTAAAACT GCGGCGGCCT CAAATAACTT TAATTTGTAG 1560
GCAGATAAAG ATTTCAACAG TAAATTCAAA GGGGAATTTG TCAGTACATT TTGTTGTTCT 1620
TCTAATTCGA AAATACTATA AATTACATTT AAAATTACTA CAAGGAGTCG CTGGGATCTT 1680
TTAAAAAATT CCAATGGGTT GTTAGGCTAG GTATGCTATC TGTGTACGTT AAACTGCAAA 1740
CGCTTAATTT AGTGTCTTTC GGGGATTAAA TTCAGTCAGA TGTAAACTAT CTTAAATGAT 1800
CTCATTTAAA AATAATACAT AAATATGGTT GTGATCGGCA TAAGTAAACG TGTAATAAAA 1860
TAATTTATTT ATTTACTTAA TTTTTGCTCT CGACGAAGCC GCTCTCGACC TTTGTTGCTA 1920
TGGTTACCAA ACGCGACTTC TTTTTGTAAG CTTCAATAAG TTCACTTTCA CTAGCTTGTC 1980