EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-48012 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:29874293-29875705 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr9:29875505-29875520AATTAATTATTGACC+6.15
HNF1BMA0153.2chr9:29875506-29875519ATTAATTATTGAC-6.15
IRF1MA0050.2chr9:29874415-29874436AGATGCTTTCATTTTTCATTT+6.13
Lhx3MA0135.1chr9:29875504-29875517AAATTAATTATTG+6.46
RESTMA0138.2chr9:29875361-29875382ATTCTTGTCCATGGTGCTGAA-7.29
Enhancer Sequence
AAAATACTAA ACTAAATTTC ATATTCTTTA AAGCACGGTG ATATTACCCA TTATCAGCTT 60
TCATTTATAA TTTTAGACAG AGCCAAAAAG ACAAACCACA ATCATATTGT CCACTATCAA 120
CAAGATGCTT TCATTTTTCA TTTTAGACAT AAGTCCTTAA TTATTTTTAG GCTTCAAATA 180
ATAATCAGTA AATAGGCTAT CTGTCTCAAA ACGACGCTGA ATGACCACAC ATTTTACCTG 240
TATTTTGACT TTTCCCACAA AAGTTATTTA AAACAGACTC CTGTATCTAA AATATTGTCC 300
ATGTGTGTAA AATAAAACAA CTAAACAAAT ACGATAGAAA TTGTAAAAGT CTAATTTGAT 360
GAAGACAAAA ATGCTTGTTG CCCACAGCGG TAGTCTCACC TGTGGTGCGC TGCTCTGCGG 420
TGGCCGCGGC GCTGCATTCT TCTTGCGGGA CGCGGTTTCT TTACGCTCCC CGTCCTTGAG 480
GTCATTAATG CTCTTGGTGT ACTGACGCCT GAGCGCCACC AGCTCCTGTA AGTATTCTAG 540
ACAGTCCTGG TTCTGGGAGT AGAGCCACAC TCGGTCCTCT CGGCTCTGGT AATAGTAGAG 600
GGCGGTGCTG GACTCCACAC TCACGGCGCT CACGCTCCGC TTCAGCGTCG AGTCCCGCAG 660
CGCGCGACTG CTCTCCCCGA CCACGAGCAT CGACGTGCTC CGGACCAACT TCACGGTGCA 720
CGCGCTGTGA TAGTCCTCAG TGGACCTGAA CCTGTCCCGA GAGCGAGGCG CAGGATGGTT 780
CGGCCGAAAA ACGGCGTTGA TTTTCTTAAA CATCACGCTG GGTGCCTGGT TGGCGCAATT 840
TAGTTGTTAA ATAGCTGGGA TGAAAACCGA AGGGATGTTG GTTCAAAGCC CAAGAGGGTG 900
CTAGCATCGT GCTCATCAAA TTGTGACTTG CCAGCTTGTT TTATAATAAA TCTAGCCTAT 960
ATAAATACCT TGTTCTTATA AGACGATCAG ATTGTTTTCT TTTTTCCATG TCCCTCTTCA 1020
CTCTCCTCCC CGTGAAAAAC TTACTTCATA TCTTCTTTAG GAAACAGAAT TCTTGTCCAT 1080
GGTGCTGAAC TCAAACTCGC TATTTTACAT TTCACAGACA GTCGGATGCC TGTTTCTTAT 1140
CCGTATGGAA GCAGTCATTG TAGGTTTGAA ACGCGGCCAT GGCAACTGTG CGCTTGCAAC 1200
TCTACACTAA CAAATTAATT ATTGACCAAA CTTAGACATA TTAGACTACA CACATGTGCT 1260
GGTCATCGCT GTTGCATAAC ATTAGGGTTG CATGCACGAA GATGGTTTTC TTAGAATGTT 1320
TATGTATACG CATAATTTCT GGACGCTATG TGGATTATGG TTAAATTTAC GGTAGCCTAT 1380
ATCTAAAAGT AGCCGACTTG TTTTCTTTTT CA 1412