EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-47954 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:28417814-28418856 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:28418521-28418533AAACAAACAAAC-6.32
NR2C2MA0504.1chr9:28417972-28417987TGAACTCTGACCTCG-7.02
RXRBMA0855.1chr9:28417972-28417986TGAACTCTGACCTC-6.02
RXRGMA0856.1chr9:28417972-28417986TGAACTCTGACCTC-6.3
RxraMA0512.2chr9:28417972-28417986TGAACTCTGACCTC-6.1
SOX21MA0866.1chr9:28418442-28418457AACCATAGCATTGTT-6.03
SOX8MA0868.2chr9:28418381-28418391CCATTGTTCT-6.02
Sox1MA0870.1chr9:28418442-28418457AACCATAGCATTGTT+6.41
Enhancer Sequence
CAATAACAGT GCTGAGTGAA GAAAATGACC AGAATCATGG AAGCAAAAAA AAAATCAGGA 60
TTTACAGCAG TACTTCTCCT CAAAACAGAA CCTCGCCTTA TTTAGACTCT TTTCGTTTAG 120
TTGACGATTC AAAACAGCTC AAATGCGTTC ACAACCTCTG AACTCTGACC TCGAGAAGCT 180
TCATAGTCCA CACTAGCAGT TGACAAACAG AGTAAGAGTG TGGTAAGATG CTCGTCTCTT 240
TGTCTGGTGG AGGCGTGAGT GATTAAGCTT GCGTTAGGAG TCATTATCTG AGTGTTTGCA 300
CAGCTCCGTC TGTCCTGAAT GGGCCCAGTG GGTAAACACA AACGTAATAC AGGATACACT 360
TGCACAAGAG ACTCAAGGCC TTTTCACAGT CAAACACACA CACACACAAA CACACACACA 420
CACACACATA GGCTTCACTG CCATTCACTT CCCTCCAAAC CTCCAAAGAT TAATTTAAAC 480
ATCCTAATTA CGCTTTGAGG AGTAATGTGC GTCGCCTCCC CACAGTTTTT TGACTAACAT 540
AAATTATCAT TGTGTTGATC CTTTAAGCCA TTGTTCTAGC ATGTCTAACC TGTTTAACTA 600
TCACATTTTC TGTTCAATTT AGGGTGGAAA CCATAGCATT GTTCCAAACT CATTAAGTGA 660
TTAAAAGCTC AGTTTCACAC AATGATATGA AAGACAGCCA CTGTAAAAAA CAAACAAACA 720
TAAATTAACA TTTTCTTTGT GTTTTGTGAT GTTTTTAATG TATTTAAATG ACATTGTGGG 780
ATCTTGAGCT TTCCCCCAAC AACTTTTGTT GCTGAAATGT TTGAAAAAGT GGCTTTTATT 840
GACATTTTTA ATCGTTTAAG GTGATATATT GTGTGTGTTG GTATGTTGGT ATTATAAATT 900
ATTATACAAA AATCTGGTAA TAAACTGCCA GTGTTTTCTG TTATTTTACA GACTTAATCC 960
TCTGTATATT GTTTCCTATA CAATATGTTG TTTAACAGTT TTTCTCAGTG GCTTTGGTGC 1020
ATCTTTCACA AGACTACATT TG 1042