EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-47923 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:27958838-27961205 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFICMA0161.2chr9:27959115-27959126TATGCCAAGTA-6.14
SOX10MA0442.2chr9:27959887-27959898AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr9:27959887-27959897AAAACAAAGG-6.02
TCF4MA0830.1chr9:27958958-27958968CGCACCTGCT+6.02
Enhancer Sequence
TTGGCTCCAG GTCTCTCGGA TGAAGATCTC TCAGCGACGT GGTCTCTTCT GGTCGCCGCG 60
CGTCTCTGGT GGAGATGGGG AGCGGGACCG TTTCCCTCCG GCGTCCCGGA CCGAAGATGC 120
CGCACCTGCT GAGGACGAGG AGGGCAAAGG CTCGGTCTGG TAGGAGAAGG ACGGCCTCTT 180
TCTCTTCTCA GCAGCATAGG CCTCACTGAA CAGATCGAGC GCAAACACAC ACAAGCAGAC 240
ATCATGTGAG ATTTGGACAA ACACTAGAAC ATGCGGCTAT GCCAAGTACA GTTTACTCAC 300
GCGTCTATGA TGGGAATGAC GTATCTGCCG CTGCCATCTA TCATGACTCC CTTTCGGTCT 360
GGGTCATCCA CCTCCAACAG GAAGCTGCGG GGAATCCCTG TGCTCCTCCG GATGCGCTTG 420
TGCGGAGCAG AGCCGCTGCC CTGTGAATTG AGGAGTGACA GTCAAACTCT GAGCAAACAA 480
TCTGACTGAT GAGGACAAGA GCTCAGTTCA CAGCAACCGT GAGCTTGGAA AACCCAGTTA 540
CCACATTAGT GGGGCAGTGC CTAATGTGGT GTCCCGGGAT CCCAAGTAGC TTCATGGCCT 600
CACTAGTGAA TATCAGAACC ATGAGAATCA GTTCAGACAT TTCTCACAAA GCAAACCTGT 660
CAGTGTCTGA ACGCTCACCT GCTGGAGTAG TAGCACAGGC TGGACTGGTA CATCACCGCT 720
TTCAGCTTGT CCTCCTCTGA CGCCTTTGCC TCAGCCAGAT TCTCAGTCTG TTTCACAGGC 780
ATTTGCACAT TTAAATCTTT TTCACCCTCA ACCCTTCAAA CACCCTCAAA TCTCCCTAAG 840
AAGCTGAGTG TGTGTATGTG TGTGTGTGTG TGTATGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 900
TGTGTGTGTG TATGTGTATT GTGTGCTTCA CATTGCGTTT TGCTATTCTG CTATTCATTT 960
GTTCAATACC TTCAACAACT GCTCCAGTGA GAGGAGTGAA GGATCACCTC TTGGTGAAGG 1020
TTTACCCCAT CGTCCAGCTT GATGTCTGCA AAACAAAGGA GCATGTGTAA CTAAAACACC 1080
AGGGACAGAC CAGGAGTCTT CATATAACAT CTAACAGAGG ACGCTTGTGC TCATTTCACA 1140
GCACTTACCC AACAAATCTT CTGTTTGAGG ACTTCAGTCC CGCCGCAGGG ATCCGTCTGA 1200
TGATGACCGA CGTGTTTTTC GGGATGAGAG CATCATCTGT GTATTCTGAC AGCAAAATAA 1260
AATCAGAATC AGCAAATGAT TATTGAGCAC GGTATACTTT GAGAGCCATT AGCCTTTTAA 1320
AACAGTCAAA ACATCACTAC GTGTCAGCAT CAGCACCACC TTACAGCTTC CAGAAGTGTC 1380
TGATATAACG CATCTAATGT TAGTGTAGAA CAGTTGAAGT GTCTTTTCCT CAACTCACCT 1440
TCATCAGTTT GGGCGTTGCT GATCTTCAGC TGGCAGAACT TCAGCCTCTT GCTCCTCATG 1500
ATCTGCCGCT TCAGCTCTCC AGCGGTGATG TTGAGGCCTT CAAACCTGAG CGAGTCGTAG 1560
GCGAGTCGAC TCTGGAACCT GTAGTGAACA CAAGACATAC TGAACACAAA CACAAAGCAC 1620
AGCGTAATAA AAAGGGTCAA ACCTGAATGA TGGGAACAGC AGGCGATCAA TCGACGTATC 1680
CAACGATCAA TAATGTCGAT AATCCGGAAA AATTGTCACG AAGGACGCAG AGATCAGATG 1740
CCAATCGACA CAGCGAGATT CAAACAACAC CCACAGAAAC GTTGTCATGG ATGCTGATGA 1800
TGAACACGTG ACGCATGCGC TGAAGAACTT CCGGCAATAT TATTATTATT ATAATTATTA 1860
ATAATTTTAT TGATGGTAGT AGTAGTAAAA TCATTGTGAT AATTATAATA AAATAAACAG 1920
CAGAACAGCT GGCCATCTCT GAATAATACA CAGCGACCTT TCCCTACACG AACGATTCAG 1980
GCCTTCGCAA AGAAGACTCG GGTGAGTCGA TGATTCAGTG ATTGATTCAA CTGTCCGTTC 2040
ATCCTATTCG CTTCTTTGGC TGAATGAATC GCTCAATGCT TTACTCAAAT AGAGCGGCCT 2100
CTTGCTGCCA CCTATTGGGG GTTTGCTTTT TTGTTTTTAT TAGTACTGAC ACTTTTTAAA 2160
GGCACCTTTA AGTTCTTTTT TGCACAAAAG CTCGTCTCTG TGCGTTCAAA ATGGTTTGAA 2220
ATTTCCTTAG CACATGGTTT TCTTGATGCA TATGAAATTT TCAATGTAAA TCCACTCGTA 2280
CTTGCATTTG ATCTTTATTA TGCCTTAAAA TCAAAACTAT GCTAAAGATG TCTTATCCAA 2340
ATCCAAATTT TTATTCAAAA CGTTATG 2367