EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-47381 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:13508793-13509842 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr9:13509480-13509491TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr9:13509481-13509492TAATTAAATTA-6.62
POU1F1MA0784.1chr9:13509461-13509475AATATGCAAATGAA+7.14
POU2F1MA0785.1chr9:13509461-13509473AATATGCAAATG+6.74
POU2F2MA0507.1chr9:13509462-13509475ATATGCAAATGAA-7.82
POU3F1MA0786.1chr9:13509462-13509474ATATGCAAATGA+6.18
POU3F2MA0787.1chr9:13509462-13509474ATATGCAAATGA+6.37
POU3F3MA0788.1chr9:13509461-13509474AATATGCAAATGA+6.02
POU5F1MA1115.1chr9:13509462-13509473ATATGCAAATG+6.32
PROP1MA0715.1chr9:13509481-13509492TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr9:13509481-13509492TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr9:13509481-13509492TAATTAAATTA-6.62
Pou2f3MA0627.1chr9:13509460-13509476TAATATGCAAATGAAG+6.37
Enhancer Sequence
TACAGTCAAC AAAATATACA TTCACATTGA ATTTCTCTTT AATATTGAAT AGATTGCATC 60
AGTTTTTTTG ATAATAAAAA TAATAATAAT AATTTTGATA ATAAAAATAC AATAGCAATA 120
CATTACAGTA AGGTTGTATT AGTTAATGAT AGTTAATGCA TTTACTAATA TGAACAAACA 180
ATGAACAATA CATTTATTAC AGTATTTGTT CATGTTAGTT AACATTGTAA GTGTAAATAC 240
AGTTGTTTAT TGTTAGTTCA TGTTAACTCA TGGTGCATTA TCTAATGTTA ACAAGCATGA 300
ATTTGGATGT TAAAATACAT TAATAAATGC CAAACTATGA TTAATAAATG TTGTACAAGT 360
ATTGTTCATA ATTAGTTCAT GTTAGTAATT ACATTAACTA ATGAATCCCA TTTGTAAAGT 420
GTGACCATAT AATATAATTA AATTTTTAAT AGTTTTCCAC ATTCACTCGT TGATGAAAAT 480
TTGCTGATCC AACATAACAT GGTTTTAGTA AAAAAGAAAA GATAAATAGA TAAATACAAA 540
ATAATAATTT GGCTTCAAAC AGACGCTTAA TATGAAAAGT AATCAAACAT GCATTATTTG 600
AGAGCTGTTT GACACCCTCT CTCAAACTGT TGCTCTGGGA GGACACCTGA GTAGCTCCTC 660
ATCAAATTAA TATGCAAATG AAGCCATTTA ATTAAATTAA CCACACAAAG ATCAGCCGTT 720
GAGATAGTGA GGTTTGCTGC ATTCAGAAGT CACTTGTAAA TAAATAGCTG TGCAATGTTC 780
ATGACTGATG GCCTGTTTTT CTGCATTTTA ACTAACAAAG GAGCTGCCGG CTAATTGGAC 840
ATCGGCAGCG GACTCGCAGC GTTTCACAGC TGTTTGATCT GTTTTCTGCC TTTTTAATTG 900
CTAATGGAGA GTGTTAGCAT ACAATGTGGG CCTCCAAGTG AGTGGGAATC TCATCACCAT 960
GGGGTTTCCA GTGATTGGTT TAGGAGCTTT ATCTGATTGA AGGTTTACAG GCCTCCCACT 1020
ACTGTCCCAA AAAATAAAGG TAAATGTTA 1049