EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-47079 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr9:3702887-3704925 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr9:3703516-3703530TTTTCCCCCCAAAA+6.79
E2F8MA0865.1chr9:3703517-3703529TTTCCCCCCAAA+6.74
KLF13MA0657.1chr9:3704661-3704679TAAAAGGAGGCGTGGCAC-6.33
KLF13MA0657.1chr9:3704890-3704908GTGCCACGCCTCCTTTTT+6.59
MEF2CMA0497.1chr9:3704344-3704359TCTCCAAAAATAGAA+6.04
ONECUT1MA0679.1chr9:3703385-3703399GGAAAATCAATAAT+6.42
ONECUT2MA0756.1chr9:3703385-3703399GGAAAATCAATAAT+6.49
ONECUT3MA0757.1chr9:3703385-3703399GGAAAATCAATAAT+6.84
POU2F1MA0785.1chr9:3703476-3703488TTTATGCAAATT+6.11
POU3F1MA0786.1chr9:3703477-3703489TTATGCAAATTT+6.62
POU3F2MA0787.1chr9:3703477-3703489TTATGCAAATTT+6.32
POU3F3MA0788.1chr9:3703476-3703489TTTATGCAAATTT+6.78
POU5F1MA1115.1chr9:3703477-3703488TTATGCAAATT+6.14
PRDM1MA0508.2chr9:3703770-3703780GTGAAAGTGA-6.02
Pou2f3MA0627.1chr9:3703475-3703491GTTTATGCAAATTTAA+6.66
Enhancer Sequence
TGGGGTAGAC ATAGACCACA AAGCCCATCT AAACAATCTG TTTCGCTGTG TTCAGGTGAT 60
GTTGCGGAAG TTTCCCTCCA TCCTCCCTAT CACCACCACC ACCACCTGGT CGGCCTCGTC 120
TCCACTCAGG AGGTTGGCTT CGCCCTGCCT TCATCTTCAG GCAGGATCTG CCAGCTCATC 180
CAGAGTTCTG CACTATAGAC AGGGCTTACG CCAAAGGACT TTATGAAAGG ACTGTAACGA 240
ATTTGCATTC ATGCAAATAA TTCACAATAA ATGTTCAAAC GTTTATCTGC CTCCTAAAGT 300
CTTTCTGGTA GAACAAACAT TACACAATTA AGTTGATGCA GAAAACCAGC AAGAATTGTG 360
TTGTTTCAGC AAGTAGTTTG AGCAAACATC CTTTTTTTAA CCTGGTAAGT TCCTAGCAAT 420
GTGCCTGACT AATTAAAATT AGAGTTTTGA TATATTTGGA ATAGAAAATG TTCAAAATAT 480
GTTGACTTTG GCATAAAAGG AAAATCAATA ATTTTGACGA ACACTGTAAA ATATGCCACA 540
CAATCGATTT GTGTCAGGGC AACATGAAGG AATTAAGTTA GCTTATTAGT TTATGCAAAT 600
TTAAGTGGAT TGAACATAAA ACAATTAAGT TTTCCCCCCA AAAACACAAG AACTGCGTTG 660
TTTCATCTAA TTTTAAATAA GTAGTTTGAA CAAACACCGA ATGTTTGCAT TTTTTGAGTG 720
TATTCAATGT ATCTTTGCAT GGCTATTTCC AAAAATCTAC ATGTGAAACA TAAAACATAA 780
GCTTTTGTCA TCCAGTGTCA AGGATAAATG ACAAAAAAAA GACCAAACCT TTGCTTATTG 840
TTTACAGGGT TGGAAAGATA TTTCATTTAG ACGCCATCAG TGTGTGAAAG TGACATGATA 900
ATGATGACGA TGGTATCGTA GTCGTGGGAT TCACAAGCTG GAAGAGGAGG AGATCCTCTC 960
TTAGGAGAAA GTCTGAACAT TTCCCAGATC TCCTCCCTCA GCTCCACCCC GAACCAGGGG 1020
AGCTTTTAGA GCAACAACAA ATACGACACC TTCGCAAATA ATACTGCAGT CACAGATGAA 1080
AGATGGTAAA TGAGTGCTGA AATCAGAAGA GCTTTAAAGC AGGAGGTGTT TAGCGCTTTC 1140
AGAGTTTTGC AGGCAAGTAA ACTGACATAT CAGTGCAGCT TCAGGAAAAA CAAGAAGAGT 1200
AAACACCCAC GGAGCGATGT GTCTAATCTA TGACTTTTAA ACTGTCCCTT TGCAGCAGTT 1260
TGGAGAGGCT GATGTTGAAG CAGATCAGCT CTTTTGATGG GATTAAGGTT TCTCATAGTA 1320
ATGGGGGAAG GAGGGGATTC CCGCTGGGAG GAGATCTCAA GTTTTTCCTG TGGTCCACTG 1380
GGAATTGCAA GGGGACACAG TTCTGCTTTT CTATTTAACT GTCAGCTCTA ATTATAAGGT 1440
GTATACTGTT ATATCTTTCT CCAAAAATAG AAACTCTGTT TAGAGAATGA TATCATTTTA 1500
GGTGTGAACG AGGCTCATTA AAGAGTCTTA GTTCGAGCAA AAAGGAACTA AGAAATGAAA 1560
AACTCTGTTA TTAGTTACTT TCAATGCCAT GAGACCTCCG TTCATCTTCA GAACACAAAT 1620
TAAGATAGTA TAGATGACAT TCGAGAGCTC TTTCATTCTC TTGCAGAAAG CAACCTGACC 1680
TGACAAGTAA ACGTAACTAT TTTACATTTT GTCAGTTTAG TGTCCAACTC ATACAAATTC 1740
GCACGAGTTC AGTTGTACGA AAATGTACGA TTTTTAAAAG GAGGCGTGGC ACCAAACCTC 1800
GCCCCGAAAC CCAACGTACA TTTCCTGGAT TAACATCTGT GTTGATCCTG AAACATCATT 1860
TTTGTAACTA ATTTTGTACT AATTATCATA ATAAAACAAT TTACAATTCG TAACTTTTTC 1920
ATTTAGTGGC TAATTCTCAT GAATTCGTAC AATCTTATTC ATACAATTCT CCCAATGGCG 1980
GTTGGGTTTA GGGGTGGGGT TTGGTGCCAC GCCTCCTTTT TAAAAATGAT AAATTTTC 2038