EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-45960 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr8:26838258-26839534 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr8:26839279-26839295GTTTGTTTACTTAATT-7.32
FOXC2MA0846.1chr8:26839280-26839292TTTGTTTACTTA-7.22
FOXD2MA0847.2chr8:26839281-26839294TTGTTTACTTAAT-6.98
FOXP2MA0593.1chr8:26839280-26839291TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr8:26839277-26839294TTGTTTGTTTACTTAAT-6.39
GCM2MA0767.1chr8:26839175-26839185TACCCGCATA-6.02
PAX3MA0780.1chr8:26839167-26839177TAATCGATTA+6.02
PAX3MA0780.1chr8:26839167-26839177TAATCGATTA-6.02
PAX7MA0680.1chr8:26839167-26839177TAATCGATTA+6.02
PAX7MA0680.1chr8:26839167-26839177TAATCGATTA-6.02
PHOX2AMA0713.1chr8:26838289-26838300TAATTCAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr8:26838289-26838300TAATTCAATTA+6.14
Enhancer Sequence
ACTCACACTC ATACCCTATG GCCAATTCAG TTAATTCAAT TATTCTATAC TGTGTCTTTG 60
GACTGTGGGG GAAACCGGAG CACCCGGCGG AAACCCACGC AAACACGACG AGGACATTCA 120
CTCTCCACAC AGAAATGCCA ACTGACCTTC TTTCTATGAG GCGACATTGC TAACCACTGA 180
GCCACAGTGT CGCCCCTAAG GGAAAATATA TTTGCTTTAA TCAAATTGAA AACAAGTGCA 240
TTAAAAGAGA GTACATCTTA AAAGGACGTG TTTAGCATTG CGTGTTAATA CTCCTTGTTC 300
TACACAGGTG CATTAAGATC TCGCACATGC GCCTTGGCAT CAGTGCAGTC TGCAGCAGTG 360
TACGTCCTGC GCGTGCCCAC CAGACTCAAG CAGCGAGGCG TCACAACAAA GCTGGTAAGC 420
AATGCACAGG TACAGCATAT TTAATACAGA GAGCATAAGG CAGACATAAT CTAAATTATG 480
GCATTAAATG TTTTTCCTAA GCGTTGCGAC GTAAATCTCC GTTGTGTTGT CAGAGAGCAC 540
TTGGGCTAAC TGCGCGTGCA GTTTTAATAA TTGTGGCAAG TATTAACGCT ATTAAAAACA 600
AACATGGATA TAAGGGGCTT AACCTAAATG CACGTCGAAG CAACGTGAAG CGTGTGTTTG 660
TGACCTTAAC CTACCCCGTC AGAAACTGCT TAGCGACAGT GCCAAACGGG GTTTGTTTTA 720
TTTAAAGGGC TGTCAGACAT CGCAACATGT GCGCTCTGAC TGCTCAACAG ACATGTTTAC 780
GCGATAATAC CCCATTTAAA TACTTTAACG TAATCGCTAA GCAATGCATT ATGTGGTGTA 840
GTAAATATTT GCGCAGCAGT ATAATTTTAA ATAGGCCTGT ATGATATTAT AAACCGCTGC 900
TTGCGTGTTT AATCGATTAC CCGCATATGT ACATGAATGC GGCAGTTATG GGTGCATTAC 960
GTTATTTATT GACCATTGAA GACAATTGAT TCGCGCGTTG TCATTGTTTT GACAGTGTGT 1020
TGTTTGTTTA CTTAATTGGG ACGCCCTGTG AATGTGACCC CAAAGTGCGT CTGTGAAATG 1080
AGATTATTAA TATTAGCTTG GCTAAGGTTG TCTGACCCCA CCCACACCTC CACAGGTAGA 1140
CTACAAATTG TAACTTCTTT TACGGTCTGT AGATCTTCAG CCACGTGTGA TTTCATTTTG 1200
TAATACAGCA ACGTTTATGG ATATTGCATA TAATATATGA AATTACACCA GATATCTGTC 1260
ATTTTACATA AATTAT 1276